本文選題：高通量測序　切入點：退化　出處：《微生物學通報》2017年03期

【摘要】：【目的】利用新疆伊犁州新源縣過度放牧導致的退化草原土壤樣品,揭示其細菌的菌群多樣性�！痉椒ā客ㄟ^Illumina Hi Seq 2500測序技術,分析6個退化草原土壤細菌的菌群結構及多樣性�！窘Y果】細菌群落Chao1指數(shù)平均值為2 118.28,Shannon指數(shù)平均值為8.84。細菌群落主要屬于Actinobacteria、Proteobacteria、Firmicutes、Gemmatimonadetes等35個門,Phingomonadaceae、Gemmatimonadaceae等220個科,Sphingomonas、Rubrobacter等329個屬,在科屬水平上未知菌類分別占31%和56.1%。固氮細菌共有9個屬,自生固氮菌中Arthrobacter和Methylobacterium的豐度最高,而根瘤菌中Bradyrhizobium和Rhizobacter的豐度較高。【結論】雖然6個退化草原土壤樣品中細菌類群具有豐富的多樣性,但很多種類豐度特別低,可能正趨向滅絕。
[Abstract]:[objective] to reveal the bacterial diversity of degraded grassland soil samples caused by overgrazing in Xinyuan County, Yili Prefecture, Xinjiang. [methods] Illumina Hi Seq 2500 sequencing technique was used.The structure and diversity of bacteria in 6 degraded steppe soils were analyzed. [results] the average Chao1 index of bacterial community was 2118.28 Shannon index and 8.84.The bacterial community mainly belongs to 329 genera of Sphingomonasaurus Rubrobacter, such as Actinobacteriae Proteobacteriae, first Gemmatimonadetes and other 35 phylum phylum, such as Gemmatimonadaceae, etc. At the level of family and genus, 31% and 56.1% of the unknown fungi are found in the family and genus level, respectively.There were 9 genera of nitrogen-fixing bacteria, and the abundance of Arthrobacter and Methylobacterium was the highest among the autobiotic nitrogen fixing bacteria, while the abundance of Bradyrhizobium and Rhizobacter in rhizobia was higher. [conclusion] although the bacterial groups in 6 degraded grassland soil samples are rich in diversity,But many species are particularly low in abundance and may be heading towards extinction.
【作者單位】： 伊犁師范學院生物與地理科學學院;南開大學生命科學學院微生物系;
【基金】：伊犁師范學院一般科研項目(No.2013YSYB15)~~
【分類號】：S812.2

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本文編號：1726072