發(fā)布時間：2018-04-02 19:26

  本文選題：地方豬品種　切入點(diǎn)：結(jié)構(gòu)變異　出處：《畜牧與獸醫(yī)》2017年04期

【摘要】：應(yīng)用Hiseq 2000平臺測定了香豬的全基因組序列,從中發(fā)現(xiàn)整合素結(jié)合涎蛋白(IBSP)基因內(nèi)含子4中存在結(jié)構(gòu)變異,命名為SV13,為了進(jìn)一步探究SV13在豬群體中的分布,采用PCR技術(shù)檢測了7個豬品種的SV13基因型。7個豬品種群體中均存在DD、DA和AA三種基因型,對純合的DD和AA基因型測序,明確D等位基因缺失了227 bp。香豬、可樂豬和糯谷豬群體以DD為優(yōu)勢基因型,大白豬以AA基因型為主,6個地方豬品種群體中D的基因頻率明顯高于大白豬品種(P0.01),香豬和大白豬群體基因型頻率處于Hardy-Weinberg不平衡狀態(tài)(P0.05)。SV13可以作為輔助鑒別6個地方豬品種和大白豬的分子標(biāo)記。
[Abstract]:The whole genome sequence of Xiang pig was determined by using Hiseq 2000 platform. The structural variation in intron 4 of integrin binding sialoprotein sialoprotein gene was found, named SV13, in order to further explore the distribution of SV13 in pig population.The SV13 genotypes of 7 pig breeds were detected by PCR technique. The homozygous DD and AA genotypes were sequenced and the D allele was found to be lacking 227 BP.DD was the dominant genotype in Xiang pig, cola pig and waxy pig population.The frequency of D gene in 6 local pig populations was significantly higher than that in large white pig breeds (P0.01G). The genotype frequency of Xiang pig and big white pig population was in the state of Hardy-Weinberg imbalance. SV13 could be used as an assistant to identify 6 places.Molecular markers of pig breeds and large white pigs.
【作者單位】： 貴州大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院;貴州大學(xué)農(nóng)業(yè)生物工程研究院;貴州大學(xué)動物科學(xué)學(xué)院;
【基金】：國家高技術(shù)研究發(fā)展計(jì)劃(863計(jì)劃)(2013AA102-503) 貴州省農(nóng)業(yè)攻關(guān)項(xiàng)目(黔科合NY[2013]3073號) 貴州大學(xué)研究生創(chuàng)新基金(研農(nóng)2016003) 貴州省“百”層次創(chuàng)新型人才項(xiàng)目(黔科合人才2016-4012號) 國家自然科學(xué)基金(31672390)
【分類號】：S828

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本文編號：1701776