牛支原體脂質(zhì)相關(guān)膜蛋白誘導(dǎo)胎牛肺細(xì)胞差異表達(dá)的轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究
本文選題:牛支原體脂質(zhì)相關(guān)膜蛋白 切入點(diǎn):胎牛肺細(xì)胞細(xì)胞 出處:《中國預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報(bào)》2017年04期 論文類型:期刊論文
【摘要】:為闡明牛支原體(Mycoplasma bovis,M.bovis)脂質(zhì)相關(guān)膜蛋白(LAMPs)誘導(dǎo)胎牛肺(EBL)細(xì)胞的免疫應(yīng)答機(jī)制,本研究采用轉(zhuǎn)錄組測序(RNA-seq)技術(shù)結(jié)合生物信息學(xué)方法分析M.bovis LAMPs誘導(dǎo)EBL細(xì)胞產(chǎn)生的差異表達(dá)基因。本實(shí)驗(yàn)首先分別構(gòu)建LAMPs誘導(dǎo)組與對照組EBL細(xì)胞的c DNA文庫并對其進(jìn)行高通量測序,利用MAS3.0軟件對差異表達(dá)基因進(jìn)行篩選,結(jié)果顯示共篩選得到706個(gè)差異表達(dá)基因,其中上調(diào)和下調(diào)差異基因分別為364個(gè)和342個(gè);GO注釋顯示,差異表達(dá)基因編碼蛋白主要與細(xì)胞黏附、免疫應(yīng)答以及細(xì)胞增殖等相關(guān);利用熒光定量PCR對部分差異表達(dá)基因(PIM2、F2RL1以及PTPN2)的表達(dá)情況進(jìn)行驗(yàn)證,結(jié)果與RNA-seq測序結(jié)果相符。本研究為進(jìn)一步闡述M.bovis的致病機(jī)制及宿主的免疫應(yīng)答機(jī)制提供依據(jù)。
[Abstract]:To elucidate the immune response mechanism of Mycoplasma bovis-M.bovis-lipose-associated membrane protein (Lampps) in fetal bovine lung (EBLL) cells induced by Mycoplasma bovisma. In this study, transcriptome sequencing RNA-seq technique and bioinformatics were used to analyze the differentially expressed genes induced by M.bovis LAMPs in EBL cells. In this study, the c DNA library of EBL cells induced by LAMPs and control group was constructed and sequenced by high throughput sequencing. MAS3.0 software was used to screen differentially expressed genes. The results showed that 706 differentially expressed genes were obtained, of which 364 were up-regulated and 342 were down-regulated. The differentially expressed gene encoding proteins were mainly related to cell adhesion, immune response and cell proliferation. The expression of some differentially expressed genes (PIM2F2RL1 and PTPN2) was verified by fluorescence quantitative PCR. The results were consistent with the results of RNA-seq sequencing. This study provides a basis for further elucidation of the pathogenesis of M. bovis and the immune response mechanism of the host.
【作者單位】: 吉林農(nóng)業(yè)大學(xué)動物科學(xué)技術(shù)學(xué)院;中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院哈爾濱獸醫(yī)研究所獸醫(yī)生物技術(shù)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室/動物支原體病研究室;東北農(nóng)業(yè)大學(xué)資源與環(huán)境學(xué)院;東北農(nóng)業(yè)大學(xué)動物醫(yī)學(xué)院;
【基金】:國家自然基金項(xiàng)目(3150130550)
【分類號】:S852.62
【相似文獻(xiàn)】
相關(guān)期刊論文 前10條
1 李文雍,陳清軒;篩選差異表達(dá)基因的方法進(jìn)展[J];阜陽師范學(xué)院學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版);2004年01期
2 蔣定鋒;潘娟娟;趙耐青;;差異表達(dá)基因篩選方法的比較[J];中國衛(wèi)生統(tǒng)計(jì);2006年05期
3 王吉村,藥立波,趙忠良;篩選差異表達(dá)基因和蛋白質(zhì)的方法進(jìn)展[J];生物化學(xué)與生物物理進(jìn)展;2001年01期
4 蔡紹曦;趙海金;丁彥青;李文軍;周斌;肖軍;;哮喘發(fā)作與細(xì)胞骨架重建相關(guān)基因的差異表達(dá)[J];第四軍醫(yī)大學(xué)學(xué)報(bào);2006年24期
5 康曉龍;李新海;馮登偵;;幾種差異表達(dá)基因篩選方法比較[J];中國獸醫(yī)雜志;2012年06期
6 狄冉;儲明星;;高通量篩選差異表達(dá)基因技術(shù)及其在家畜中的應(yīng)用[J];中國畜牧獸醫(yī);2011年01期
7 李斐雪,王雁玲;差異表達(dá)基因的高通量篩選方法[J];細(xì)胞生物學(xué)雜志;2004年04期
8 呂立夏,徐磊,楊翠香,李學(xué)禮,王堯;單眼視網(wǎng)膜摘除鴿視蓋差異表達(dá)基因的篩選[J];解剖學(xué)報(bào);2002年05期
9 單文娟;童春發(fā);施季森;;基因芯片篩選差異表達(dá)基因方法比較[J];遺傳;2008年12期
10 王學(xué),徐靜;一種鑒別基因差異表達(dá)的新方法——差異表達(dá)mRNA呈現(xiàn)技術(shù)[J];生物工程進(jìn)展;1998年03期
相關(guān)會議論文 前6條
1 狄冉;儲明星;;高通量篩選差異表達(dá)基因技術(shù)簡介[A];中國畜牧獸醫(yī)學(xué)會養(yǎng)羊?qū)W分會全國養(yǎng)羊生產(chǎn)與學(xué)術(shù)研討會議論文集[C];2010年
2 葉波平;邊杉;趙艷景;王穎;奚濤;王;吳梧桐;;鯊魚再生肝組織中差異表達(dá)基因及其產(chǎn)物的活性研究[A];中國海洋生化學(xué)術(shù)會議論文薈萃集[C];2005年
3 秦國政;田世平;王清;劉嘉;;線粒體蛋白差異表達(dá)及氧化修飾與果實(shí)成熟衰老的關(guān)系[A];第三屆全國植物蛋白質(zhì)組學(xué)大會摘要集[C];2010年
4 毛興學(xué);莊楚雄;彭新湘;梅曼彤;郭振飛;李明啟;;水稻冷相關(guān)基因的克隆及差異表達(dá)[A];全國植物光合作用、光生物學(xué)及其相關(guān)的分子生物學(xué)學(xué)術(shù)研討會論文摘要匯編[C];2001年
5 任緒義;張建鵬;馮偉華;焦炳華;;大鼠睪丸鎘毒性相關(guān)蛋白差異表達(dá)分析[A];中國蛋白質(zhì)組學(xué)第二屆學(xué)術(shù)大會論文摘要論文集[C];2004年
6 潘宏偉;龔勛;劉紅;李越中;;粘細(xì)菌中的mRNA差異表達(dá)分析[A];中國資源生物技術(shù)與糖工程學(xué)術(shù)研討會論文集[C];2005年
相關(guān)博士學(xué)位論文 前2條
1 李建祥;氡染毒動物差異表達(dá)基因的高通量篩選[D];蘇州大學(xué);2007年
2 陳鑫基;1.應(yīng)用抑制性消減雜交技術(shù)(SSH)篩選、分離、克隆急性白血病復(fù)發(fā)相關(guān)基因 2.聚合酶鏈轉(zhuǎn)化—阻斷PCR消減法:一種新的篩選差異表達(dá)基因方法的建立和驗(yàn)證[D];福建醫(yī)科大學(xué);2009年
相關(guān)碩士學(xué)位論文 前10條
1 左海洋;小鼠精子形成期間差異表達(dá)基因驗(yàn)證[D];吉林農(nóng)業(yè)大學(xué);2015年
2 員艷麗;白沙蒿對干旱響應(yīng)的轉(zhuǎn)錄組研究[D];內(nèi)蒙古師范大學(xué);2016年
3 任麗萍;根據(jù)功能相關(guān)性評價(jià)差異表達(dá)基因的可重復(fù)性[D];電子科技大學(xué);2011年
4 任曉俊;家蠶第二白卵近等基因系差異表達(dá)基因的篩選與克隆[D];江蘇科技大學(xué);2010年
5 周澤惠;脂肪酸誘導(dǎo)鵝肝細(xì)胞差異表達(dá)基因的篩選和鑒定[D];四川農(nóng)業(yè)大學(xué);2008年
6 紀(jì)相禹;基于R語言的差異表達(dá)基因檢測研究[D];吉林大學(xué);2011年
7 曹振龍;利用SSH技術(shù)篩選與鑒定小鼠MOE內(nèi)受AC3調(diào)控的差異表達(dá)基因[D];河北大學(xué);2014年
8 王芳;中華水韭重金屬誘導(dǎo)差異表達(dá)基因的分離[D];哈爾濱師范大學(xué);2014年
9 胡國庫;性逆轉(zhuǎn)石斑魚腦垂體差異表達(dá)cDNA克隆的篩選及其表達(dá)研究[D];四川大學(xué);2003年
10 龔勛;粘細(xì)菌mRNA差異表達(dá)法研究及耐鹽粘球菌HW-1的mRNA差異表達(dá)分析[D];山東大學(xué);2005年
,本文編號:1640899
本文鏈接:http://sikaile.net/yixuelunwen/dongwuyixue/1640899.html