松遼黑豬NR6A1和VRTN基因多態(tài)性與肋骨數(shù)的關(guān)聯(lián)分析
本文選題:松遼黑豬 切入點(diǎn):NR6A1基因 出處:《吉林農(nóng)業(yè)大學(xué)》2015年碩士論文 論文類型:學(xué)位論文
【摘要】:在生產(chǎn)過程中發(fā)現(xiàn)松遼黑豬群體中的不同個體之間存在肋骨數(shù)量的差異。結(jié)合松遼黑豬的選育歷史,為了解析松遼黑豬群體中肋骨數(shù)的差異,本研究以松遼黑豬為試驗對象群體,選用杜長大三元雜交豬為試驗對照群體,分別采集了173頭松遼黑豬和283頭杜長大三元雜交豬的背最長肌組織樣本為試驗材料,提取基因組DNA,并且按采樣順序記錄了肋骨數(shù)表型值。分別選取與脊椎數(shù)量顯著相關(guān)的NR6A1和VRTN為候選基因,運(yùn)用PCR-RFLP和基因分型技術(shù),篩選候選基因的多態(tài)位點(diǎn),并進(jìn)一步與肋骨對數(shù)表型值進(jìn)行相關(guān)分析,以期為松遼黑豬在品種內(nèi)選育和提高多肋品系提供比較理想的分子標(biāo)記和理論依據(jù)。本研究取得結(jié)果如下:NR6A1基因的相關(guān)研究區(qū)域在杜長大三元雜交群體中不存在基因多態(tài)性,但在松遼黑豬群體中存在基因多態(tài)性,在目的片段184bp處存在AG突變;VRTN基因的相關(guān)研究區(qū)域在杜長大三元雜交群體和松遼黑豬群中存在基因多態(tài)性,在目的片段112bp處存在一個大約289bp的插入突變;驗證了NR6A1基因目的片段的Nci I酶切位點(diǎn)在杜長大三元雜交群體內(nèi)存在選擇清除效應(yīng),NR6A1基因目的片段的NciI酶切位點(diǎn)在松遼黑豬群體內(nèi)存在AA、AG、GG三個基因型,且該酶切位點(diǎn)在松遼黑豬群體內(nèi)處于Hardy-Weinberg平衡狀態(tài),遺傳多態(tài)性處于中度多態(tài);VRTN基因目的片段的ins/ins、ins/-和-/-三種基因型在杜長大三元雜交群體和松遼黑豬群體內(nèi)均存在,該插入突變位點(diǎn)在杜長大三元雜交群體和松遼黑豬群體均處于Hardy-Weinberg平衡狀態(tài),遺傳多態(tài)性處于中度多態(tài);NR6A1基因的184AG位點(diǎn)松遼黑豬個體的肋骨數(shù)表型變異現(xiàn)象不存在關(guān)聯(lián)性,VRTN基因112bp位點(diǎn)的插入突變與杜長大三元雜交豬和松遼黑豬的肋骨數(shù)表型變異現(xiàn)象存在一定的關(guān)聯(lián)性,因此該插入突變位點(diǎn)很有可能成為松遼黑豬在品種內(nèi)選育和提高多肋品系的理想分子標(biāo)記。
[Abstract]:In the production process has found differences between different individual rib number of Songliao Black pig group. Combined with the breeding history of Songliao Black pig, the difference in order to rib in Songliao Black pig population number analysis, this study in Songliao Black Pig as the experimental object groups, with three yuan of Duroc crossbred pigs as experimental control group, respectively. Collect 173 Songliao Black Pigs and 283 head three yuan Duroc Hybrid Pigs longissimus muscle tissue samples as test materials, the genomic DNA was extracted, and according to the sampling sequence records were selected. The phenotypic value of rib was significantly associated with vertebral number of NR6A1 and VRTN as a candidate gene by PCR-RFLP and gene typing technique screening of candidate genes, polymorphism, and further with the pair of ribs of phenotypic values were analyzed in order to provide an ideal molecular marker and the rationale for the Songliao Black Pig breeding and raising in varieties of multi rib lines On the basis of this study. The results are as follows: the related research region of the NR6A1 gene in Duroc gene polymorphism does not exist three hybrid populations, but the presence of genetic polymorphisms in Songliao Black pig population, the existence of AG mutation in 184bp fragment; related research region of the VRTN gene in the gene polymorphism of three Duroc crossbred groups and Songliao Black Pigs, in 112bp there is a fragment about 289bp insertion mutagenesis; verified NR6A1 gene fragment Nci I restriction sites in Duroc clear effect of three hybrid groups, NciI enzyme fragment of NR6A1 gene restriction sites AA in Songliao Black Pig in group AG, three GG genotypes, and the restriction sites in the Hardy-Weinberg equilibrium in Songliao Black pig population, genetic polymorphism in moderate polymorphism; fragment of VRTN gene of ins/ins, ins/- and - three base Because in the three yuan of Duroc hybrid population and Songliao Black pig population exists, the insertion mutation in Duroc hybrid population and three yuan in Songliao Black pig population were in Hardy-Weinberg equilibrium, genetic polymorphism in moderate polymorphism; NR6A1 gene 184AG locus of Songliao Black Pig individual rib number phenotypic variation phenomenon does not exist Association of VRTN gene 112bp locus mutation and insertion of Duroc Hybrid Pigs and three yuan songliaohei pig rib number of phenotypic variation exists certain relevance, so the insertion mutation is likely to be in the Songliao Black Pig and improve product in breeding the ideal molecular markers of multi rib lines.
【學(xué)位授予單位】:吉林農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號】:S828
【共引文獻(xiàn)】
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,本文編號:1631595
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