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雞長(zhǎng)鏈非編碼RNA發(fā)掘及組織特異性表達(dá)分析

發(fā)布時(shí)間:2018-03-03 14:47

  本文選題: 切入點(diǎn):RNA-seq 出處:《東北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)》2016年07期  論文類型:期刊論文


【摘要】:長(zhǎng)鏈非編碼RNA(Long non-coding RNA,lnc RNA)是一類長(zhǎng)度大于200個(gè)核苷酸、缺少蛋白編碼功能的RNA。lnc RNA可從多層面調(diào)控基因表達(dá),影響表型性狀。雞作為重要經(jīng)濟(jì)動(dòng)物和模式生物,lnc RNA研究相對(duì)滯后。為加快雞lnc RNA研究進(jìn)展,利用公共數(shù)據(jù)庫(kù)(如NCBI-SRA等)中雞高通量轉(zhuǎn)錄組測(cè)序(RNA-seq)數(shù)據(jù),通過(guò)生物信息學(xué)方法發(fā)掘8 040條雞lnc RNA,發(fā)現(xiàn)大量組織特異性表達(dá)lnc RNA,為雞lnc RNA功能研究奠定基礎(chǔ)。
[Abstract]:Long chain noncoding RNA(Long non-coding RNAs are a class of RNA.lnc RNA, which is more than 200 nucleotides in length and lacks the function of protein coding to regulate gene expression from multiple levels. Chicken, as an important economic animal and model organism, lagged behind in the study of phenotypic traits. In order to accelerate the progress of chicken lnc RNA research, high throughput transcriptome sequencing RNA-seq data from public databases (such as NCBI-SRA, etc.) were used. 8 040 chicken lnc RNAs were discovered by bioinformatics, and a large number of tissue-specific lnc RNAs were found, which laid a foundation for the study of chicken lnc RNA function.
【作者單位】: 農(nóng)業(yè)部雞遺傳育種重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室黑龍江省普通高等學(xué)校動(dòng)物遺傳育種與繁殖重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室東北農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物科學(xué)技術(shù)學(xué)院;
【基金】:國(guó)家863計(jì)劃項(xiàng)目(2013AA102501) 現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系建設(shè)專項(xiàng)資金資助項(xiàng)目(CARS-42) 國(guó)家自然科學(xué)基金(31472088)
【分類號(hào)】:S831

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本文編號(hào):1561484

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