發(fā)布時(shí)間：2018-02-28 00:34

  本文關(guān)鍵詞： 從江香豬 DRD基因 多態(tài)性 生物信息學(xué)　出處：《基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué)》2017年02期 　論文類(lèi)型：期刊論文

【摘要】：為揭示豬DRD1基因多態(tài)性,本研究以從江香豬為研究對(duì)象,以外三元(杜×長(zhǎng)×大)雜交豬及貴州宗地花豬為對(duì)照,采用DNA池和直接測(cè)序技術(shù),篩查DRD1基因所有外顯子區(qū)SNPs位點(diǎn);利用生物信息學(xué)軟件估算等位基因頻率并預(yù)測(cè)SNPs位點(diǎn)對(duì)m RNA二級(jí)結(jié)構(gòu)的影響。結(jié)果表明,在DRD1基因中共篩查到1個(gè)SNPs位點(diǎn),位于5'UTR區(qū)為T(mén)-182G;從等位基因頻率角度分析,從江香豬與貴州宗地花豬估算得到的等位基因頻率較一致,與外三元(杜×長(zhǎng)×大)雜交豬卻存在較大差異;利用RNA secondary structure prediction軟件預(yù)測(cè),發(fā)現(xiàn)m RNA二級(jí)結(jié)構(gòu)發(fā)生明顯變化
[Abstract]:In order to reveal the polymorphism of porcine DRD1 gene, we used Congjiang Xiang pig as the research object, Waiyuan (du 脳 Chang 脳 Da) crossbred pig and Guizhou Zongdi Hua pig as control, using DNA pool and direct sequencing technique to screen SNPs loci in all exons of DRD1 gene. The allele frequency was estimated by bioinformatics software and the influence of SNPs locus on the secondary structure of m RNA was predicted. The results showed that one SNPs locus was screened out of the DRD1 gene, which was located at T-182G in the 5G UTR region. The frequency of alleles estimated in Congjiang Xiang pig and Guizhou Zongdihua pig was consistent, but there was a great difference between the two breeds, and the secondary structure of m RNA was obviously changed by using RNA secondary structure prediction software.
【作者單位】： 貴州大學(xué)高原山地動(dòng)物遺傳育種與繁殖省部共建教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室貴州省動(dòng)物遺傳育種與繁殖重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室貴州大學(xué)動(dòng)物科學(xué)學(xué)院;貴州省生豬健康養(yǎng)殖工程技術(shù)研究中心;
【基金】：貴州省工程中心建設(shè)項(xiàng)目(黔科合農(nóng)C字[2011]4022號(hào)) 貴州大學(xué)引進(jìn)人才科研項(xiàng)目提高香豬產(chǎn)仔數(shù)及仔豬成活率關(guān)鍵技術(shù)研究與應(yīng)用” 貴大人基合字2013(21)號(hào)共同資助
【分類(lèi)號(hào)】：S828

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本文編號(hào)：1544994