本文關(guān)鍵詞： 單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn) 山羊 骨骼肌和腎臟富集的肌醇磷酸酶 生長性狀 成肌分化　出處：《華中農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報》2017年06期 　論文類型：期刊論文

【摘要】：為研究SKIP基因?qū)ι窖蛏L發(fā)育的影響,并尋找與山羊生長性狀相關(guān)的分子標(biāo)記,利用綿羊與牛SKIP基因的同源序列設(shè)計引物,RT-PCR擴(kuò)增得到一段長1 350bp的山羊SKIP基因表達(dá)序列,包括其完整編碼區(qū)序列,編碼449個氨基酸的蛋白。通過序列Blast比較和系統(tǒng)發(fā)育樹的構(gòu)建,發(fā)現(xiàn)山羊SKIP與綿羊SKIP序列相似性最高(99.52%)。利用生物信息學(xué)分析SKIP蛋白的理化性質(zhì),預(yù)測SKIP蛋白分子質(zhì)量為52ku,等電點(diǎn)為5.18,包含典型的疏水區(qū)域和磷脂酰肌醇5-磷酸磷酸酶結(jié)構(gòu)域,定位在細(xì)胞質(zhì)(60.9%)和細(xì)胞核(26.1%)中。間接免疫熒光試驗驗證了SKIP的細(xì)胞定位,并發(fā)現(xiàn)位于細(xì)胞核中的SKIP在成肌細(xì)胞分化過程中轉(zhuǎn)移到細(xì)胞質(zhì)。通過波爾山羊和麻城黑山羊的DNA混池測序,發(fā)現(xiàn)SKIP內(nèi)含子2有一處G/A突變,利用PCRRFLP方法對波爾×麻城黑山羊F2代雜交后代進(jìn)行基因分型,性狀關(guān)聯(lián)分析發(fā)現(xiàn)該單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)(SNP)與出生體質(zhì)量、胸圍、管圍、身高等性狀顯著相關(guān),等位基因G與生長呈正相關(guān)。
[Abstract]:In order to study the effect of SKIP gene on the growth and development of goats, and to search for molecular markers related to goat growth traits, a 1 350 BP long goat SKIP gene was amplified by RT-PCR using primers designed by homologous sequence of sheep and cattle SKIP gene. By comparing sequence Blast and constructing phylogenetic tree, it was found that goat SKIP and sheep SKIP sequence had the highest similarity (99.52%). The physicochemical properties of SKIP protein were analyzed by bioinformatics. The predicted molecular weight of SKIP protein is 52ku.The isoelectric point is 5.18. it contains a typical hydrophobic region and phosphatidylinositol 5-phosphatase domain, located in cytoplasm 60.9 and nucleus 26.1). Indirect immunofluorescence assay verifies the cellular localization of SKIP. It was found that SKIP located in the nucleus was transferred to the cytoplasm during myoblast differentiation. By sequencing the DNA mixed pool of Boer goat and Macheng black goat, we found a G / A mutation in intron 2 of SKIP. The genetic analysis of F2 progeny of Boer 脳 Macheng Black Goat was carried out by PCRRFLP method. The trait association analysis showed that the single nucleotide polymorphism (SNP) was significantly correlated with birth weight, chest circumference, tube circumference, height and other traits. Allele G was positively correlated with growth.
【作者單位】： 湖北省農(nóng)業(yè)科學(xué)院畜牧獸醫(yī)研究所/動物胚胎工程及分子育種湖北省重點(diǎn)實(shí)驗室;華中農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)業(yè)動物遺傳育種與繁殖教育部重點(diǎn)實(shí)驗室/農(nóng)業(yè)部豬遺傳育種重點(diǎn)開放實(shí)驗室/生豬健康養(yǎng)殖協(xié)同創(chuàng)新中心;
【基金】：國家自然科學(xué)基金青年項目(31402051)
【分類號】：S827

【相似文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前10條

1 安慧;倪志廣;馬旭平;吳占福;吳淑琴;王學(xué)彬;劉興華;;塞北兔生長性狀與屠宰性狀典型相關(guān)分析[J];黑龍江畜牧獸醫(yī);2012年14期

2 安慧;馬旭平;吳占福;吳淑琴;王學(xué)彬;;塞北兔生長性狀與屠宰性狀典型相關(guān)分析[J];中國養(yǎng)兔;2012年07期

3 丁艷;魯紹雄;連林生;;撒壩豬胰島素樣生長因子-Ⅰ基因多態(tài)性及其與部分生長性狀的關(guān)聯(lián)分析[J];中國畜牧獸醫(yī);2012年10期

4 李健;林希冉;陳佳虹;張奕;陳家歡;張細(xì)權(quán);;雞1號染色體114701476-115068911區(qū)域與生長性狀的關(guān)聯(lián)分析[J];中國獸醫(yī)學(xué)報;2012年09期

5 楊廣禮;任軍;郭源梅;麻駿武;連總強(qiáng);劉孟洲;黃路生;;豬SLC6A14g.21063G>T多態(tài)性與脂肪和生長性狀相關(guān)性研究[J];中國畜牧雜志;2009年15期

6 顧亞玲;馬麗娜;許斌;李穎康;;生長激素基因多態(tài)性與灘羊生長性狀關(guān)聯(lián)性研究[J];安徽農(nóng)業(yè)科學(xué);2010年19期

7 張哲;賀金龍;鄧熙;高寧;吳海娥;張豪;李加琪;;杜洛克豬生長性狀全基因組關(guān)聯(lián)分析[J];廣東農(nóng)業(yè)科學(xué);2014年14期

8 肖禮華;史忠輝;曾瓊;穆林;徐猛;羅衛(wèi)星;劉若余;陳志;;黔北麻羊GHRH-R基因多態(tài)性與生長性狀的關(guān)聯(lián)分析[J];中國草食動物科學(xué);2012年05期

9 馬旭平;吳占福;吳淑琴;李文海;許所山;;塞北兔生長性狀與屠宰性能通徑分析[J];黑龍江畜牧獸醫(yī);2012年19期

10 張旭;初芹;吳宏軍;王東升;姜立鑫;王雅春;;奶牛生長性狀遺傳分析的研究進(jìn)展[J];中國畜牧雜志;2013年17期

相關(guān)會議論文 前8條

1 王t，

本文編號：1520992