綿羊KITLG基因的表達及其多態(tài)性與產(chǎn)羔性狀關聯(lián)分析
本文關鍵詞: KITLG基因 單核苷酸多態(tài)性 產(chǎn)羔數(shù) 基因表達 綿羊 出處:《農(nóng)業(yè)生物技術學報》2017年06期 論文類型:期刊論文
【摘要】:繁殖性狀作為綿羊重要的經(jīng)濟性狀,其分子機理的研究極為重要。綿羊(Ovis aries)繁殖性能受到下丘腦-垂體-性腺生殖軸的調(diào)控,同時也受到許多的生長因子的調(diào)節(jié),KIT的配體KITLG(KIT LIGAND,KL或KitL)作為重要的生長調(diào)節(jié)因子在卵泡發(fā)育中起很重要的作用。為了解綿羊KITLG基因表達特征、多態(tài)性及其與產(chǎn)羔性狀的關聯(lián)性,本研究利用Real-time PCR分析了KITLG基因在湖羊下丘腦、垂體、卵巢、心臟、肌肉、肺、腎臟、肝臟、脾臟、十二指腸、脂肪和瘤胃等組織中的表達水平,同時采用限制性長度片段多態(tài)性(restriction fragment length polymorphism,RFLP)技術檢測了KITLG基因在湖羊和小尾寒羊群體中的多態(tài)性及其與產(chǎn)羔性狀的關聯(lián)性。結果表明,綿羊KITLG基因在上述檢測的12個組織中均有表達,其中在卵巢中的表達量較高。通過PCR-RFLP分析,在第2和第5內(nèi)含子上檢測到g.38473CT和g.47468CT 2個突變位點。在小尾寒羊和湖羊群體中檢測到的g.38473CT位點上均有CC(優(yōu)勢基因型)和CT兩種基因型,其中C為優(yōu)勢等位基因;湖羊群體的基因雜合度(heterozygosity,He)為0.89,純合度(homozygosity,Ho)為0.11,有效等位基因數(shù)(effective allele number,Ne)和多態(tài)信息含量(polymorphic information content,PIC)分別為1.31和0.11;在小尾寒羊中分別為0.80、0.20、1.10和0.16,并且在該突變位點,兩個群體均處于Hardy-Weinberg平衡狀態(tài)。在g.47468CT突變位點上檢測到CT和TT(優(yōu)勢基因型)兩種基因型,其中優(yōu)勢等位基因為T;在此位點湖羊群體中He、Ho、Ne及PIC分別為0.95、0.05、1.06、0.05;小尾寒羊群體中分別為0.91、0.09、1.10和0.09。兩個群體在該位點均處于Hardy-Weinberg平衡狀態(tài)。多態(tài)位點與綿羊產(chǎn)羔數(shù)的關聯(lián)性分析表明,KITLG基因g.47468CT位點與小尾寒羊產(chǎn)羔數(shù)顯著相關(P0.05)。本研究結果揭示了KITLG基因在綿羊卵巢中的表達量較高,且g.47468CT位點與綿羊產(chǎn)羔數(shù)顯著相關,可作為產(chǎn)羔性狀相關的候選基因。
[Abstract]:As an important economic trait in sheep, the study of its molecular mechanism is very important. The reproductive performance of Ovis aries is regulated by the hypothalamus-pituitary-gonad reproductive axis. The ligand KITLG(KIT LIGDANDKL or Kit, which is also regulated by many growth factors, plays an important role in follicular development. In order to understand the characteristics of KITLG gene expression, polymorphism and its association with lambing traits in sheep, Real-time PCR was used to analyze the expression of KITLG gene in the hypothalamus, pituitary, ovary, heart, muscle, lung, kidney, liver, spleen, duodenum, fat and rumen of Hu sheep. At the same time, restriction restriction fragment length polymorphism was used to detect the polymorphism of KITLG gene in Hu sheep and small tail Han sheep population and its association with lambing traits. Sheep KITLG gene was expressed in 12 tissues, especially in ovary. PCR-RFLP analysis was used to analyze the expression of sheep KITLG gene. Two mutation loci, g.38473CT and g.47468CT, were detected on intron 2 and intron 5. Among them, there were two genotypes of CC-C and CT on the locus of g.38473CT detected in small tail Han sheep and Hu sheep, in which C was the dominant allele. Heterozygosity He0.89, homozygosity of homozygosity 0.11, effective number of alleles and polymorphic information contentPICs were 1.31 and 0.11in Hu sheep, 0.800.201.10 and 0.16in small tail Han sheep, respectively. Both populations were in Hardy-Weinberg equilibrium. Ct and TT2 genotypes were detected at the mutation locus of g.47468CT. Among them, the dominant alleles were T, the PIC and the PIC of the Hu sheep population were 0.950.05 and 1.060.05, respectively, and those of the small tail Han sheep were 0.91 ~ 0.09 ~ 1.10 and 0.09, respectively. Both populations were in the Hardy-Weinberg equilibrium state at this locus, and the correlation between the polymorphic loci and sheep litter size was also observed. The results showed that there was a significant correlation between G47468CT locus of KITLG gene and litter size of small tail Han sheep. The results showed that the expression of KITLG gene was high in ovaries of sheep. Moreover, the locus of g.47468CT was significantly correlated with sheep litter size and could be used as a candidate gene for lambing traits.
【作者單位】: 甘肅農(nóng)業(yè)大學動物科技學院;青海大學農(nóng)牧學院;蘭州大學草地農(nóng)業(yè)科技學院;甘肅省肉羊繁育生物技術工程實驗室民勤隴原中天生物工程有限公司;
【基金】:國家自然科學基金項目(No.31472072) 國家肉羊現(xiàn)代肉羊產(chǎn)業(yè)技術體系建設專項(CARS-39)
【分類號】:S826
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,本文編號:1505646
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