本文關(guān)鍵詞： 鴨疫里氏桿菌 微孔蛋白 克隆 生物信息學(xué)分析 二級(jí)結(jié)構(gòu) 抗原性　出處：《黑龍江畜牧獸醫(yī)》2017年09期 　論文類型：期刊論文

【摘要】：為了研究鴨疫里氏桿菌微孔蛋白(Porin)的結(jié)構(gòu)與功能,試驗(yàn)采用PCR方法克隆了porin基因,并進(jìn)行了生物信息學(xué)分析。結(jié)果表明:8種血清型的鴨疫里氏桿菌均在1 200 bp處獲得目的片段,BLAST分析顯示,8種血清型菌株的porin基因與ATCC 11845等菌株的同源性均達(dá)到100%;二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測顯示,Poirn蛋白前端存在3個(gè)α螺旋,為蛋白的信號(hào)肽部分,其余為β折疊和無規(guī)則卷曲;三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測顯示,Porin蛋白為8個(gè)β折疊所構(gòu)成的圓桶結(jié)構(gòu),符合革蘭氏陰性菌微孔蛋白的結(jié)構(gòu)特點(diǎn);抗原性分析顯示,Porin蛋白的5個(gè)區(qū)段可能存在B細(xì)胞抗原表位。說明Poirn蛋白在鴨疫里氏桿菌菌株間具有高度同源性,且具有潛在B細(xì)胞抗原表位,Porin蛋白可用于鴨疫里氏桿菌的鑒定和疫苗的研發(fā)。
[Abstract]:In order to study the structure and function of microporin (Porin), porin gene was cloned by PCR method. Bioinformatics analysis was carried out. The results showed that the target fragment blast was obtained at 1 200 BP in 8 serotypes of Leucella duck. The homology of porin gene between 8 serotype strains and ATCC 11845 was 100%. The prediction of the secondary structure showed that there were three 偽 helices in the front end of Poirn protein, which were the signal peptide of the protein, while the others were 尾 -folded and irregularly curled. The tertiary structure prediction showed that the Porin protein was a barrel composed of 8 尾 folds, which was in line with the structural characteristics of micropore protein of Gram-negative bacteria. The antigenicity analysis showed that B cell epitopes might exist in five regions of Porin protein, which indicated that Poirn protein had high homology among the strains of Leucella Duck. The Porin protein with potential B cell antigen epitope can be used in the identification of Riemiella Duck and the development of vaccine.
【作者單位】： 吉林農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物科學(xué)技術(shù)學(xué)院;中國獸醫(yī)藥品監(jiān)察所;吉林農(nóng)業(yè)大學(xué)中藥材學(xué)院;吉林農(nóng)業(yè)大學(xué)教研基地管理處;
【基金】：吉林省教育廳“十三五”科學(xué)技術(shù)研究項(xiàng)目(2016192) 吉林農(nóng)業(yè)大學(xué)博士啟動(dòng)基金項(xiàng)目(201405)
【分類號(hào)】：S852.61
【正文快照】： 教研基地管理處,長春130118)鴨傳染性漿膜炎是由鴨疫里氏桿菌(Riemerellaanatipestifer,RA)引起的雛鴨的一種急性或慢性、敗血性傳染病,是當(dāng)前危害養(yǎng)鴨業(yè)的最重要細(xì)菌病之一[1]。RA的血清型多達(dá)21種,各血清型之間缺少交叉保護(hù)作用,給該病的免疫和快速診斷帶來困難[2]。外膜微

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1 盧Z，

本文編號(hào)：1457410