DMU、GBS和Herdsman 3個軟件育種值估計的比較
本文關(guān)鍵詞: 豬 育種軟件 育種值 相關(guān)性 出處:《中國畜牧雜志》2017年07期 論文類型:期刊論文
【摘要】:豬育種管理軟件為豬育種工作和養(yǎng)豬場的管理提供了便利,育種值估計是育種管理系統(tǒng)的核心。但在實際應(yīng)用中,不同軟件育種值估計不一致給一線育種工作者帶來了困擾。本研究選取國內(nèi)廣泛使用的GBS、Herdsman育種管理軟件和科學(xué)研究中常用的DMU程序,以大白豬、長白豬和杜洛克豬的育種數(shù)據(jù)和模擬數(shù)據(jù)為材料,研究3款軟件估計育種值之間的差異。結(jié)果表明:在數(shù)據(jù)和遺傳評估模型及初始參數(shù)一致的情況下,DMU4和GBS由于采取相同的算法,估計育種值一致性高達(dá)0.99以上,DMU5育種值估計與DMU4高度一致;DMUAI基于約束極大似然方法,在相同條件下育種值估計準(zhǔn)確性略高于DMU4和GBS;由于模型和初始參數(shù)未知,本研究Herdsman育種值估計與GBS和DMU一致性偏低。但鑒于Herdsman算法與DMU4和GBS一致,可以預(yù)測在相同模型下,GBS、Herdsman與DMU育種值估計應(yīng)無差異。研究同時表明,軟件對遺傳評估評估結(jié)果影響不大,主要是具體遺傳評估模型的配置。
[Abstract]:The management software of pig breeding provides convenience for pig breeding and management of pig farm. Estimation of breeding value is the core of breeding management system, but it is applied in practice. Different software estimates of breeding values have caused problems for first-line breeders. In this study, the widely used GBS in China was selected. The Herdsman breeding management software and the DMU program commonly used in scientific research are based on the breeding data and simulation data of large white pig, Landrace pig and Duroc pig. The differences between the estimated breeding values of the three softwares were studied. The results showed that DMU4 and GBS adopted the same algorithm when the data were consistent with the genetic evaluation model and the initial parameters. The consistency of estimated breeding value was as high as 0.99 and higher than that of DMU5. The estimated value of DMU5 was highly consistent with that of DMU4. Based on the constrained maximum likelihood method, the accuracy of DMUAI breeding value estimation is slightly higher than that of DMU4 and GBS under the same conditions. Because the model and initial parameters are unknown, the estimation of Herdsman breeding value is lower than that of GBS and DMU, but the Herdsman algorithm is consistent with DMU4 and GBS. It can be predicted that there should be no difference in the estimation of the breeding values between GBSU Herdsman and DMU under the same model. The results of the study also show that the software has little effect on the results of genetic evaluation. It is mainly the configuration of the specific genetic evaluation model.
【作者單位】: 中國農(nóng)業(yè)大學(xué)動物科學(xué)技術(shù)學(xué)院農(nóng)業(yè)部動物遺傳育種與繁殖重點(diǎn)實驗室國家畜禽育種工程實驗室;北京市畜牧總站;全國畜牧總站;
【基金】:國家生豬產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系(CARS-36) 北京市科技計劃項目(D151100004615004) 浙江畜禽育種專項(2016C02054-5)
【分類號】:S828.2
【正文快照】: 現(xiàn)代動物育種有2個基本特征:一是廣泛應(yīng)用現(xiàn)代遺傳育種理論和方法,二是全面應(yīng)用計算機(jī)技術(shù),二者相輔相成,現(xiàn)代遺傳育種理論和方法的一個基本原則是利用一切可以利用的信息和最先進(jìn)的統(tǒng)計分析方法來進(jìn)行育種工作。其中,根據(jù)畜禽性能測定對個體進(jìn)行育種值估計,進(jìn)而評價其種用價
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,本文編號:1451142
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