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豬NLRC5基因克隆及序列特征分析

發(fā)布時間:2017-12-08 12:10

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【摘要】:為了解豬天然免疫受體NLRC5基因特征,用人類、小鼠等物種NLRC5基因已知片段設(shè)計分段擴增的引物,同時運用RACE技術(shù),克隆該序列并進行序列生物信息學(xué)分析.基因序列分析表明,克隆得到豬NLRC5基因c DNA全長為6638bp,基因開放閱讀框為5538bp,共編碼1846個氨基酸.蛋白質(zhì)預(yù)測結(jié)果顯示,NLRC5編碼蛋白質(zhì)整體表現(xiàn)為親水性,蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域分析結(jié)果顯示,NLRC5具有典型的NACHT區(qū)及20個LRRs.同源性分析表明豬與牛、綿羊、獼猴、人等物種具有較高同源性,達到了80%左右,遺傳進化樹分析表明與牛和綿羊進化關(guān)系最近.進一步組織表達分析表明NLRC5基因除在淋巴結(jié)、脾臟等系統(tǒng)免疫器官中具有較高表達量,在腸淋巴結(jié)、胃、肺等黏膜器官中也有較高的轉(zhuǎn)錄水平.本研究結(jié)果說明豬NLRC5基因在長期進化中較為保守,尤其在哺乳動物間具有較高的保守性,在免疫反應(yīng)中可能扮演著重要的角色.豬NLRC5基因序列的成功克隆為后續(xù)NLRC5在機體內(nèi)免疫系統(tǒng)中的功能研究奠定了理論基礎(chǔ).
【作者單位】: 西南民族大學(xué)生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院;西南民族大學(xué)青藏高原研究院;
【基金】:國家自然科學(xué)青年基金(31302074)
【分類號】:S828
【正文快照】: NOD樣受體(NOD-like receptors,NLRs)是目前已知的四大模式識別受體家族之一,定位于細胞質(zhì)內(nèi),主要識別胞質(zhì)中的病原微生物和危險信號[1-2],近年來其家族許多成員被證實在機體的免疫調(diào)節(jié)過程中也扮演了重要角色,其中NLRC5是新近被發(fā)現(xiàn)的NLRs家族成員之一,也是目前NLRs家族中已

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中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前1條

1 陳亞冰;蘭道亮;湯承;李鍵;;NLRC5:一種新發(fā)現(xiàn)的天然免疫調(diào)節(jié)分子[J];中國獸醫(yī)科學(xué);2013年04期



本文編號:1266328

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