本文關(guān)鍵詞：雜交群體中基因組選擇應(yīng)用效果研究

  更多相關(guān)文章： 基因組選擇 單性狀模型 多性狀模型 雞雜交群體

【摘要】：隨著芯片技術(shù)和計(jì)算機(jī)技術(shù)的發(fā)展,覆蓋全基因組單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphism,SNP)標(biāo)記數(shù)據(jù)被大量的獲得,這些遺傳標(biāo)記與數(shù)量性狀位點(diǎn)(quantitative trait loci,QTL)形成連鎖不平衡(linkage disequilibrium,LD),利用SNP信息進(jìn)行育種值估計(jì)的基因組選擇也應(yīng)運(yùn)而生�；蚪M選擇具有準(zhǔn)確性高、可縮短世代間隔、降低近交系數(shù)上升速度、加速遺傳進(jìn)展以及能進(jìn)行早期選種等優(yōu)點(diǎn)�；蚪M選擇方法分為最佳線性無偏預(yù)測(cè)(best unbiased prediction,BLUP)類方法和Bayes類,基因組選擇模型有基因組選擇單性狀模型和多性狀模型。目前,基因組選擇在動(dòng)物育種應(yīng)用中,多數(shù)應(yīng)用在純種群體上,而且基本上使用的是基因組選擇單性狀模型,在雜交群體中的應(yīng)用較少,尤其是關(guān)于基因組選擇多性狀模型在雜交群體應(yīng)用的報(bào)道更加少。本研究將傳統(tǒng)BLUP方法以及基因組選擇GBLUP(genomic best linear unbiased prediction)、BLUP|GA(genomic best linear unbiased prediction with genetic architecture)的單性狀模型和多性狀模型在杏花雞與隱性白羽洛克雞雜交F2代群的14個(gè)生長(zhǎng)性狀運(yùn)用,旨在研究基因組選擇在雜交群體中的準(zhǔn)確性,以及進(jìn)行早期選種的效果,探討基因組選擇的評(píng)價(jià)方法。按照設(shè)計(jì)的方案進(jìn)行育種值估計(jì),得到估計(jì)育種值(estimatedbreeding value,EBV)和GEBV(genomic estimatedbreeding value,GEBV),再進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析得到的如下結(jié)論:(1)傳統(tǒng)BLUP方法和基因組選擇GBLUP方法、BLUP|GA方法在雞雜交群體生長(zhǎng)性狀中運(yùn)用的平均準(zhǔn)確性分別是為0.429、0.514和0.522,平均無偏系數(shù)分別為1.016、1.027、0.913,準(zhǔn)確性最好的是BLUP|GA,無偏性最好的是BLUP。(2)不同留種率下,根據(jù)EBV或GEBV排名,基因組選擇GBLUP方法與BLUP|GA方法選留個(gè)體的共同比例比傳統(tǒng)BLUP方法與GBLUP方法選留個(gè)體共同比例、傳統(tǒng)BLUP方法與BLUP|GA方法選留個(gè)體共同比例高,選留個(gè)體的表型平均值都高于全群表型均值,基因組選擇方法選留個(gè)體的表型均值選留高于傳統(tǒng)BLUP方法選留個(gè)體的表型均值。(3)雞雜交群體生長(zhǎng)性狀的基因組選擇多性狀模型與基因組選擇單性狀模型相比,GBLUP多性狀模型的準(zhǔn)確性比GBLUP單性狀模型高0.068,BLUP|GA多性狀模型的準(zhǔn)確性比BLUP|GA單性狀模型高0.133。(4)基因組選擇可以在雞雜交群體中進(jìn)行早期選種,基因組選擇單性狀模型在留種率較少的情況下具有明顯的優(yōu)勢(shì);基因組選擇多性狀模型中,GBLUP多性狀模型在77日齡時(shí),對(duì)90日齡目標(biāo)體重預(yù)測(cè)效果最好,BLUP|GA多性狀模型在56日齡時(shí),對(duì)90日齡目標(biāo)體重預(yù)測(cè)的準(zhǔn)確性最高。
【學(xué)位授予單位】：華南農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2016
【分類號(hào)】：S813

【相似文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

1 嚴(yán)威凱;;試論小麥性狀間的常數(shù)關(guān)系與小麥品種的突破問題[J];麥類作物學(xué)報(bào);1993年01期

2 徐夕水，胡詩國(guó);微機(jī)在家畜數(shù)量性狀選擇中的應(yīng)用研究[J];計(jì)算機(jī)農(nóng)業(yè)應(yīng)用;1996年02期

3 白石;小麥產(chǎn)量和產(chǎn)量組成性狀的選擇[J];福建農(nóng)業(yè)科技;1981年01期

4 秦豪榮,吉俊玲;組合性狀的研究進(jìn)展[J];黃牛雜志;1998年04期

5 黃慕玉;豐抗號(hào)小麥的選育和若干性狀選擇的探討[J];華北農(nóng)學(xué)報(bào);1986年04期

6 徐宗儔,馮明友,雷昌彬;雜交水稻后代經(jīng)濟(jì)性狀選擇效果初探[J];種子;1991年05期

7 王景旭;楊凡;周未;王瑞懂;;農(nóng)戶對(duì)水稻品種性狀選擇的影響因素實(shí)證研究[J];天津農(nóng)業(yè)科學(xué);2010年05期

8 楊德,戴君惕;關(guān)于多個(gè)數(shù)量性狀的典范相關(guān)研究 Ⅰ.典范性狀及其遺傳力[J];遺傳學(xué)報(bào);1982年03期

9 楊德 ,戴君惕;關(guān)于多個(gè)數(shù)量性狀的典范相關(guān)研究——I. 典范性狀及其遺傳力[J];湖南農(nóng)學(xué)院學(xué)報(bào);1983年01期

10 楊崇力,羅樹中;小麥重要品質(zhì)性狀與選擇[J];作物雜志;1993年03期

中國(guó)碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前2條

1 張海斌;雜交群體中基因組選擇應(yīng)用效果研究[D];華南農(nóng)業(yè)大學(xué);2016年

2 高燕;小麥主要性狀的遺傳相關(guān)與選擇效果研究[D];河南農(nóng)業(yè)大學(xué);2009年

，

本文編號(hào)：1256455