野鴨源H3N8亞型禽流感病毒的系統(tǒng)進(jìn)化和分子遺傳特征分析
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【摘要】:為了解在江蘇某濕地野生水禽中分離到的1株禽流感病毒的來源、流行特點(diǎn)、進(jìn)化和分子遺傳特征,將采集的野生水禽糞便經(jīng)處理后,使用A型禽流感通用熒光RT-PCR檢測(cè),陽性樣品接種10日齡SPF雞胚,收取接種后第24~96小時(shí)的尿囊液,進(jìn)行血凝試驗(yàn),隨后對(duì)其進(jìn)行全基因測(cè)序和遺傳進(jìn)化分析。結(jié)果顯示,該毒株為H3N8亞型禽流感病毒,命名為A/Mallard/Xuyi/14/2015(H3N8)。HA蛋白的裂解位點(diǎn)氨基酸序列為PEKQTR↓GLF,無連續(xù)堿性氨基酸插入,符合典型低致病性禽流感病毒的特征;HA與NA的糖基化位點(diǎn)沒有發(fā)生突變;NA耐藥性氨基酸位點(diǎn)出現(xiàn)突變位點(diǎn);PB2蛋白第627和701位氨基酸分別為谷氨酸(Glu)和天冬氨酸(Asn),是禽源流感病毒的特征性氨基酸。在Gen Bank中對(duì)該毒株進(jìn)行序列比對(duì)分析,結(jié)果顯示,與所測(cè)基因片段同源性最高的10株毒株基本位于我國(guó)東部候鳥遷徙路線上。結(jié)果表明,A/Mallard/Xuyi/14/2015(H3N8)株為從江蘇分離的低致病性禽流感病毒,基因主要來源于我國(guó)東部候鳥遷徙路線上的禽流感病毒。
【作者單位】: 南京農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物醫(yī)學(xué)院;
【基金】:公益性行業(yè)(農(nóng)業(yè))科研專項(xiàng)(200903055) 國(guó)家林業(yè)局部門預(yù)算中央本級(jí)項(xiàng)目(2130211)
【分類號(hào)】:S852.65
【正文快照】: 禽流感病毒(avian influenza virus,AIV)屬于正黏病毒科的RNA病毒。目前,根據(jù)其表面蛋白HA和NA的抗原性差異已經(jīng)鑒定出17種HA亞型和10種NA亞型[1-2]。野生水禽被認(rèn)為是禽流感病毒的天然存儲(chǔ)庫和新型毒株形成的重要載體,其中鴨科禽類是帶毒最多的種類[3]。攜帶禽流感病毒的野生
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