本文關鍵詞：牦牛、普通牛和犏牛睪丸組織microRNA的比較研究

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【摘要】：牦牛與普通牛雜交,得到的后代犏牛具有顯著的雜種優(yōu)勢,產(chǎn)肉、產(chǎn)乳量均高于牦牛,但表現(xiàn)出雄性不育,雜種優(yōu)勢的利用受到很大限制。為了了解miRNA在犏牛睪丸功能發(fā)揮及生殖調控過程中的作用,闡明生殖內(nèi)分泌遺傳調控機制,本研究進行了牦牛、普通牛、犏牛睪丸組織的miRNA鑒定及生物學功能研究。結果表明:(1)牦牛、普通牛和犏牛睪丸組織小RNA高通量測序分別獲得73183534、75781455和74748250條高質量序列,經(jīng)過質量控制處理后,牦牛、普通牛和犏牛的凈數(shù)據(jù)分別為71008752、72004961和70481199條,分別對應8544379、9793585、8859608條唯一序列。在犏牛睪丸組織中大部分miRNA序列長度分布于20~23nt,其中長度為22nt(為典型的miRNA序列長度)所占比例最大,表明犏牛睪丸組織中富含miRNA;普通牛和牦牛的sRNA序列長度分布呈雙峰分布,分別在21~23nt和26~30nt處出現(xiàn)峰值。(2)牦牛、普通牛和犏牛中鑒定到已知miRNA前體分別有509、511和585個,對應的已知mi RNA分別為473、478和560個。各文庫mi RNA的總表達量主要集中在前30位miRNA,三個文庫中bta-mi R-10b均表達量最高,三文庫中表達量前15位共有19個(bta-miR-10b、bta-mi R-143、bta-let-7a-5p、bta-miR-26a、bta-miR-146b、bta-miR-125b、bta-miR-100、bta-miR-148a、bta-miR-125a、bta-miR-99a-5p、bta-let-7f、bta-miR-191、bta-let-7g、bta-miR-22-3p、bta-let-7b、bta-miR-34c、bta-miR-6526、bta-miR-27b、bta-miR-151-5p)。(3)普通牛、牦牛和犏牛三個文庫中共有580個miRNA,其中相同的439個,普通牛、牦牛和犏牛睪丸特異表達的miRNA分別有10、9和69個。與普通牛文庫相比,犏牛中表達極顯著下調和上調的分別有8和321個;與牦牛文庫相比,犏牛中表達極顯著下調和上調分別有11個和312個。犏牛睪丸中表達下調的bta-miRNA的有11個即bta-mi R-34b、bta-miR-2384、bta-miR-449a、bta-miR-34c、bta-miR-449b、bta-miR-449c、bta-miR-375、bta-mi R-133b、bta-miR-190b、bta-miR-7、bta-miR-208b、bta-miR-6526。其中三文庫中表達量前15位中除了bta-miR-34c、bta-mi R-6526在犏牛文庫中表達下調,其余均在犏牛文庫中表達上調。(4)目標miRNA的靶基因主要參與生物學過程調控、基因表達調控、細胞凋亡、細胞分化等生物學過程,具有蛋白結合功能,參與信號轉導活動。bta-miR-10b和bta-miR-34c靶基因主要參與核苷酸結合、基因轉錄后表達調控、嘌呤核苷結合等生物學過程。靶基因主要在Wnt信號通路、Toll受體信號通路、促性腺激素釋放激素受體通路、TGF-β信號傳導途徑、血管生成、細胞凋亡、p53通路等生殖相關的細胞信號通路中顯著富集。睪丸中表達量較高的miRNA(bta-miR-125a、bta-miR-125b、bta-miR-26a、bta-miR-26b)調控靶基因涉及細胞凋亡機制,可能與犏牛精子發(fā)生阻滯相關。
【學位授予單位】：西南民族大學
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2016
【分類號】：S823

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本文編號：1246621