5株PCV2四川株全基因組的克隆與遺傳進化分析
發(fā)布時間:2017-11-27 12:26
本文關鍵詞:5株PCV2四川株全基因組的克隆與遺傳進化分析
【摘要】:【目的】了解目前四川省豬圓環(huán)病毒2型(PCV2)的分子流行病學特征和遺傳變異情況,探討PCV2感染的控制對策!痉椒ā扛鶕礼enBank中發(fā)表的PCV2基因組序列設計2對特異性引物,對2012-2014年臨床送檢的PCV2感染病例材料中的5株PCV2全基因組序列進行擴增測序,并利用DNAStar等生物信息分析軟件對獲得的PCV2基因組序列進行分子特性與遺傳演變分析!窘Y果】5株PCV2四川株全基因組序列長度都為1 767bp,均具有滾環(huán)復制起點(ORC)典型結構。序列比對和進化分析顯示,5株PCV2四川株的基因序列同源性很高,基因組核苷酸序列及ORF1、ORF2和ORF3基因序列同源性分別為98.4%~99.9%,97.5%~99.6%,99.4%~100%和96.2%~100%,ORF1、ORF2和ORF3基因推導氨基酸序列同源性分別為98.4%~99%,99.6%和91.5%~100%;與47條參比PCV2毒株核苷酸序列的同源性比較發(fā)現(xiàn),5株PCV2與國內一些新出現(xiàn)的PCV2毒株親緣關系較近,且均屬于PCV2d基因型毒株!窘Y論】5株PCV2四川株之間盡管存在著不同程度的基因變異,但遺傳進化相對較穩(wěn)定。
【作者單位】: 四川農業(yè)大學動物醫(yī)學院;動物疫病與人類健康四川省重點實驗室;金宇保靈生物藥品有限公司;
【基金】:“十二五”國家科技支撐計劃項目(2013BAD12B04) 四川農業(yè)大學雙支計劃項目(00270401)
【分類號】:S852.65
【正文快照】: 豬圓環(huán)病毒(Porcine circovirus,PCV)是一種單股環(huán)狀DNA病毒,病毒子呈球形,無囊膜,直徑17~20nm,屬于圓環(huán)病毒科(Circoviridae)圓環(huán)病毒屬(Circovirus)成員[1]。目前常見的PCV包括PCV1和PCV2 2種血清型,其基因組長度分別為1 759和1 768bp(或1 767bp)[2],其中PCV1發(fā)現(xiàn)于傳代細胞
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7 何秀苗;官丁明;韋平;yそ鴆,
本文編號:1231860
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