本文關(guān)鍵詞：豬圓環(huán)病毒2型和豬繁殖與呼吸綜合征病毒分子流行病學(xué)調(diào)查及基因進(jìn)化分析

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【摘要】：豬圓環(huán)病毒2型(Porcine circovirus type 2,PCV2)是引起斷奶仔豬多系統(tǒng)衰竭綜合征、皮炎與腎病綜合征等相關(guān)疾病的重要病原體之一。豬繁殖與呼吸綜合征病毒(Porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)能導(dǎo)致懷孕母豬流產(chǎn)、仔豬嚴(yán)重呼吸癥狀及死亡。因此,PCV2和PRRSV是影響?zhàn)B豬業(yè)發(fā)展的兩大病原體。目前,養(yǎng)豬場內(nèi)PCV2和PRRSV混合感染的情況越來越普遍,臨床上混合感染豬只臨床癥狀包括嚴(yán)重的呼吸癥狀、流產(chǎn)和極度虛弱等,且常繼發(fā)嚴(yán)重的病毒性或細(xì)菌性疾病,導(dǎo)致嚴(yán)重的經(jīng)濟(jì)損失。因此,PCV2和PRRSV的混合感染的流行病學(xué)調(diào)查及兩種病毒的遺傳進(jìn)化分析對于綜合防控豬場疾病具有重要意義。為了解PCV2和PRRSV在中國豬場的混合感染及流行情況,本實驗自2013-2015年對吉林、遼寧、黑龍江、山西、山東、廣東6省進(jìn)行PCV2和PRRSV分子流行病學(xué)調(diào)查,采集了192份樣品進(jìn)行檢測,PCV2陽性率為64.3%,PRRSV陽性率為23.4%,29份樣品為混合感染,陽性率達(dá)18.5%。豬群中PCV2和PRRSV的感染比較普遍,混合感染率也較高,加重了疫病防控的難度。采集自不同地區(qū)的12個陽性樣品進(jìn)行PCV2全基因組擴(kuò)增測序及遺傳進(jìn)化分析發(fā)現(xiàn),12個PCV2序列分別屬于PCV2b和PCV2d基因型。其中8個測序序列SX-Z1、SX-Z3、YQ、JL、SY-M-X3、SY-L-3、SY-L-X6和SP-2單獨(dú)形成一個位于PCV2d-1和PCV2d-2之間的單系群,3個測序序列SY-Z-4、ZD-1和ZD-7與只在丹麥流行的PCV2c基因型毒株同源性高,分析發(fā)現(xiàn)是PCV2c和PCV2b基因型間毒株的重組毒。PCV2毒株遷移進(jìn)化分析預(yù)測有PCV2毒株從丹麥遷移至中國。采集自不同地區(qū)的12個PRRSV陽性樣品中PRRSV ORF5、ORF7、部分Nsp2基因測序分析發(fā)現(xiàn),所有毒株均屬于美洲型;12個測序序列在GP5和N蛋白的重要基序上均有關(guān)鍵氨基酸的突變;8個序列SDdz-2013-1、SDta-2013-1、SDly-2013-1/2/3/4、SDly-2014-1和SXkl-2014-1與HP-PRRSV一樣在Nsp2上的第481位和第533-561位氨基酸有30個氨基酸的不連續(xù)缺失;2個序列HLYyq-2015-1和LNsy-2014-2在Nsp2上出現(xiàn)新型缺失即第593-595位氨基酸缺失;1個序列SDly-2014-1與NADC-30毒株ORF7基因相似度高。同時,分離2株P(guān)RRSV毒株,命名為LNsy-2014-1和HLJyq-2015-1,接種細(xì)胞后細(xì)胞出現(xiàn)變圓、聚堆典型病變,RT-PCR和間接免疫熒光鑒定均為陽性,遺傳進(jìn)化分析均為北美洲型且分別與經(jīng)典毒株JXA1和VR2332相似度最高。
【學(xué)位授予單位】：中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2016
【分類號】：S858.28

【共引文獻(xiàn)】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前10條

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本文編號：1204030