本文關(guān)鍵詞：豬FRZB、ABCF1、IGFBP2和BMP-3b基因SNPs檢測及其與生產(chǎn)性狀的關(guān)聯(lián)分析

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【摘要】：隨著分子遺傳學(xué)和分子生物學(xué)的發(fā)展,分子標(biāo)記輔助選擇已廣泛應(yīng)用于動物育種中,其中SNP(single nucleotide polymorphism,單核苷酸多態(tài)性)是目前研究和應(yīng)用最廣的分子標(biāo)記。本研究選取了豬FRZB(Frizzled motif associated with bone development)、ABCF1(ATP-binding cassette subfamily F member 1)、IGFBP2(The insulin-like growth factor binding protein 2,胰島素樣生長因子結(jié)合蛋白2)和BMP-3b(Bone morphogenetic protein-3b,骨形態(tài)發(fā)生蛋白3b)四個候選基因進(jìn)行了SNP檢測及性狀關(guān)聯(lián)分析,取得以下結(jié)果:(1)FRZB基因編碼分泌型卷曲相關(guān)蛋白3(sFRP3),屬于SFRP家族中的一員,在胚胎發(fā)育中起到了重要的作用;已有研究發(fā)現(xiàn)該基因存在三個SNP位點,本研究利用PCR技術(shù)對該基因5′端調(diào)控區(qū)轉(zhuǎn)錄起始位點上游-532bp處插入型SNP g.1541_1542 ins322(KF112870.1)進(jìn)行驗證,在470頭美系大白豬群體中關(guān)聯(lián)分析發(fā)現(xiàn)該位點與背膘厚性狀呈極顯著相關(guān)(p0.01)。(2)ABCF1是一類跨膜轉(zhuǎn)運蛋白,已有研究表明ABCF1基因5′端調(diào)控區(qū)轉(zhuǎn)錄起始位點上游-254bp處A/G SNP g.8472 A〉G(NC_010449.4)與初生重性狀關(guān)聯(lián),本研究利用MspⅠ-RFLP方法在630頭美系大白豬群和576頭法系大白豬群對該SNP進(jìn)行了驗證,在美系大白豬群中該SNP與背膘厚和乳頭數(shù)均呈顯著相關(guān)(p0.05),在法系大白豬群中該SNP與初生重呈顯著相關(guān)(p0.05)。(3)IGFBP2是IGFBP家族的一員,通過與胰島素樣生長因子結(jié)合進(jìn)行轉(zhuǎn)運,并作用于肌肉等靶組織,促進(jìn)動物生長和發(fā)育;本研究利用MspⅠ-RFLP方法對該基因第三內(nèi)含子g.171C〉T(GenBank Accession No.BV727778)進(jìn)行了SNP檢測,在383頭大×梅F2代豬群體中關(guān)聯(lián)分析結(jié)果發(fā)現(xiàn)該位點與背膘厚、眼肌高、眼肌寬、骨率和pH(LD)等性狀呈極顯著相關(guān)(p0.01),與眼肌面積、肥肉率、瘦肥比、花油、色值(LD)和色值(BF)等性狀呈顯著相關(guān)(p0.05)。(4)BMP-3b調(diào)控骨的生成,并且在胚胎發(fā)育中起著重要作用,本研究發(fā)現(xiàn)了BMP-3b基因翻譯起始位點ATG后546bp處存在SNP g.7925 A〉G(ID_100519926)位點,并建立了AlwN1-RFLP檢測方法,在399頭大×梅F2代豬群體關(guān)聯(lián)分析表明該位點與背膘厚、眼肌高、板油重和肌內(nèi)脂肪含量呈顯著相關(guān)(p0.05),與色值(LD)、色值(BF)和大理石評分(LD)呈極顯著相關(guān)(p0.01)。本研究通過初步了解這些基因SNP位點與豬生產(chǎn)性狀之間的關(guān)系,并篩選了與豬生長、肉質(zhì)等性狀顯著相關(guān)的分子標(biāo)記,為豬重要經(jīng)濟性狀的分子標(biāo)記輔助選擇提供理論依據(jù)。
【學(xué)位授予單位】：華中農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2016
【分類號】：S828

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1 徐珍;豬FRZB、ABCF1、IGFBP2和BMP-3b基因SNPs檢測及其與生產(chǎn)性狀的關(guān)聯(lián)分析[D];華中農(nóng)業(yè)大學(xué);2016年

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本文編號：1194034