本文關(guān)鍵詞：基因組選擇中一步法的應(yīng)用評(píng)價(jià)

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【摘要】：基因組選擇能夠通過覆蓋全基因組的高密度SNP標(biāo)記追溯到所有影響目標(biāo)性狀的基因或QTL,從而實(shí)現(xiàn)對(duì)畜禽個(gè)體育種值的準(zhǔn)確預(yù)測(cè)。因此,基因組選擇方法具有估計(jì)育種值的準(zhǔn)確性高等優(yōu)勢(shì),同時(shí)可通過早期基因型測(cè)定實(shí)現(xiàn)早期評(píng)估和早期選種,進(jìn)而縮短世代間隔。實(shí)施基因組選擇技術(shù)需要對(duì)個(gè)體進(jìn)行基因型分型,然而對(duì)一些經(jīng)濟(jì)價(jià)值較小的物種(豬或家禽)而言,在實(shí)際育種中進(jìn)行全部個(gè)體基因分型是不現(xiàn)實(shí)的,而一步法允許部分個(gè)體進(jìn)行基因分型即可實(shí)施基因組選擇,有效的克服這些物種施基因組選擇的一些問題。本研究通一步法在黃羽肉雞群體中的驗(yàn)證,以及基于豬實(shí)際性狀遺傳結(jié)構(gòu)全基因組數(shù)據(jù)表型缺失時(shí)和表型已知時(shí)模擬驗(yàn)證,并且探討一步法在豬實(shí)際育種過程中候選群個(gè)體測(cè)定基因型比例大小、測(cè)定基因型個(gè)體的選擇。通過對(duì)育種值估計(jì)的準(zhǔn)確性、無偏性及選擇反應(yīng)等結(jié)果分析,主要得出以下結(jié)論:1本研究中基于R語言開發(fā)基因組選擇一步法計(jì)算評(píng)估軟件。經(jīng)過測(cè)試,程序穩(wěn)定可靠,親緣關(guān)系矩陣構(gòu)建靈活可變,可用于畜禽基因組選擇遺傳評(píng)定計(jì)算軟件的選擇;2一步法在真實(shí)數(shù)據(jù)驗(yàn)證表明:在采食類、生長類和胴體類三類性狀中一步法準(zhǔn)確性與無偏性優(yōu)于傳統(tǒng)BLUP、GBLUP方法。三大類性狀提高幅度依次為:生長類性狀5.4%~13.9%、胴體類性狀3%~10.1%、采食類性狀0.2%~10.7%;3一步法在模擬數(shù)據(jù)驗(yàn)證表明:無論是驗(yàn)證群在表型缺失時(shí)或表型已知時(shí),一步法的準(zhǔn)確性優(yōu)于傳統(tǒng)BLUP和GBLUP方法(分別提高~25%、~4%)。一步法在低遺傳力性狀或驗(yàn)證群表型缺失情況下的運(yùn)用時(shí),獲得更明顯的遺傳進(jìn)展;4豬育種過程實(shí)施基因組選擇一步法模擬研究表明:候選群體基于父母親平均育種值挑選基因分型個(gè)體,基因分型約40%時(shí)、既可獲得潛在的最大遺傳進(jìn)展。隨著參考群不斷擴(kuò)大,每世代遺傳評(píng)估準(zhǔn)確性不斷提高,獲得更多的遺傳進(jìn)展。
【學(xué)位授予單位】：華南農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2016
【分類號(hào)】：S813

【參考文獻(xiàn)】

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1 張哲;張勤;丁向東;;畜禽基因組選擇研究進(jìn)展[J];科學(xué)通報(bào);2011年26期

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本文編號(hào)：1168671