巴馬小型豬TNF-α基因的克隆與相關(guān)生物學(xué)信息分析
本文關(guān)鍵詞:巴馬小型豬TNF-α基因的克隆與相關(guān)生物學(xué)信息分析
更多相關(guān)文章: 巴馬小型豬 TNF-α基因 基因克隆 序列分析 蛋白結(jié)構(gòu)預(yù)測 同源性
【摘要】:本研究旨在分析巴馬小型豬TNF-α(tumor necrosis factor-alpha)基因的遺傳變異情況。實驗采用RT-PCR和克隆的方法成功擴增TNF-α基因的編碼區(qū)序列,同時對TNF-α基因和相應(yīng)的蛋白序列進行生物信息學(xué)分析。結(jié)果表明,巴馬小型豬TNF-α基因編碼區(qū)全長為699 bp,編碼232個氨基酸;與Gen Bank中已發(fā)表的豬TNF-α基因(登錄號:NM_214022.1)序列進行比對,未發(fā)現(xiàn)核苷酸堿基突變;編碼的232個氨基酸分子量為25 253.9,理論等電點為5.44,不存在信號肽,但存在跨膜螺旋結(jié)構(gòu)。經(jīng)過序列相似性分析,巴馬小型豬的TNF-α基因與豬、人、馬、牛、家犬、綿羊同源性比較結(jié)果表明其具有較強的保守性。巴馬小型豬的TNF-α基因與野豬的親緣關(guān)系一致。
【作者單位】: 廣西大學(xué)動物科學(xué)技術(shù)學(xué)院;
【關(guān)鍵詞】: 巴馬小型豬 TNF-α基因 基因克隆 序列分析 蛋白結(jié)構(gòu)預(yù)測 同源性
【基金】:國家現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系廣西生豬創(chuàng)新團隊項目(nycytxgxcxtd-03-15) 不同誘導(dǎo)型廣西巴馬小型豬2型糖尿病動物模型轉(zhuǎn)錄組的研究項目(14-91-07)共同資助
【分類號】:Q78;S828
【正文快照】: 腫瘤壞死因子(tumornecrosisfactor-alpha,TNF-α)是由單核細胞/巨噬細胞活化產(chǎn)生的一種細胞因子,在機體自的炎癥反應(yīng)、細胞免疫、腫瘤免疫、糖尿病等多種病理和生理過程中起著重要作用。TNF-α基因表達一個長度為26 k D細胞跨膜蛋白,然后在TNF-α裂解酶的作用下形成一個17 k
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