對我國2012~2015年部分地區(qū)雞AIV H9N2流行株的流行變異及抗原性研究
本文關(guān)鍵詞:對我國2012~2015年部分地區(qū)雞AIV H9N2流行株的流行變異及抗原性研究
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【摘要】:中國大陸于1994年在廣東省首次報道并分離得到H9N2亞型禽流感病毒,隨后該亞型病毒廣泛傳播至我國大部分省區(qū)。近年來,關(guān)于H9N2亞型禽流感病毒的分離報道呈持續(xù)上升態(tài)勢,該病的流行每年都給我國養(yǎng)禽業(yè)帶來巨大經(jīng)濟(jì)損失。同時H9N2亞型禽流感病毒還可以為新出現(xiàn)感染人的H7N9、H10N8亞型禽流感病毒提供內(nèi)部基因,潛在威脅人類健康安全,具有重要的經(jīng)濟(jì)和公共衛(wèi)生意義。為弄清H9N2病毒在我國的流行變異情況,本研究對2012~2015年分離到的42株H9N2亞型AIV進(jìn)行全基因組測序和遺傳進(jìn)化樹構(gòu)建,并選取其中的18株代表株制備單因子血清,進(jìn)行交叉HI試驗,以此來研究H9N2流行株之間的抗原性分化情況,最后用免疫保護(hù)實驗,評價毒株Ck/GX/SIC6/13對流行株的免疫保護(hù)效果。遺傳進(jìn)化分析表明:42株H9N2病毒均屬于Ck/Bei-like分支(h9.4.2),其中97.6%(41/42)的分離株屬于h9.4.2.5亞分支,2.4%(1/42)的分離株屬于h9.4.2.6亞分支,其HA基因之間的核苷酸相似性為86.7%~99.7%,與經(jīng)典疫苗株的相似性為88.6%~92.6%。分離株形成4種不同的重組基因型(S,U,V,W),基因型S是流行的主基因型,占研究毒株的92.8%(39/42);基因型V、W為新重組基因型,其中基因型V和基因型W分別整合了來源于G9-like譜系的NA基因和wild waterfowl-like譜系的PB2基因,使H9N2病毒的基因重組現(xiàn)象愈加復(fù)雜化。特定氨基酸位點(diǎn)分析表明:所有分離株的HA蛋白裂解位點(diǎn)有兩種模式,分別為PSRSSR↓GLF(97.6%,41/42)和PARSSR↓GLF(2.4%,1/42),沒有多個連續(xù)堿性氨基酸插入,均符合低致病性禽流感病毒的分子特征。部分毒株的HA受體結(jié)合位點(diǎn)模式與人流感病毒受體結(jié)合位點(diǎn)類似,92.8%(39/42)的毒株在HA蛋白上出現(xiàn)了與哺乳動物適應(yīng)性相關(guān)的Q226→L突變;95.2%(40/42)的病毒在NA莖部出現(xiàn)了與毒力增強(qiáng)相關(guān)的63-65位點(diǎn)三個氨基酸缺失;97.6%(41/42)的毒株M2蛋白發(fā)生了與金剛烷等藥物耐藥性相關(guān)的S31→N突變;本研究分離株中僅有2.4%(1/42)的毒株在PB2基因中出現(xiàn)E627→K,沒有D701→N突變出現(xiàn)。交叉HI試驗結(jié)果表明:18株新分離株單因子抗血清對于相同和不同病毒抗原的HI效價差異為0~9 log2,它們之間的抗原相關(guān)性R值為0.41~1,說明即使來源同一分支的H9N2亞型AIV,其抗原性也正在逐漸分化,抗原性差異各異的流行株同時存在給該病的防控帶來困難。本研究根據(jù)遺傳進(jìn)化樹和交叉HI實驗結(jié)果,將18株新分離株分為3個抗原群(A、B、C),結(jié)合HA基因進(jìn)化分支和毒株分離時間及地點(diǎn)等因素,3個抗原群的出現(xiàn)大致呈現(xiàn)出A→B→C的先后關(guān)系。免疫保護(hù)實驗表明:H9N2早期分離株制備的滅活疫苗對現(xiàn)今H9N2流行毒株不能起到有效保護(hù),對A群病毒的保護(hù)率僅為30%~50%;毒株Ck/GX/SIC6/13制備的滅活疫苗也只能保護(hù)本毒株的攻毒,保護(hù)率為90%,而對其余毒株的保護(hù)效果均不理想,提示近年H9N2流行毒株的流行變異較為頻繁,流行株之間的抗原性復(fù)雜、交叉保護(hù)力差。
【關(guān)鍵詞】:AIV H9N2 流行變異 抗原性 免疫保護(hù)
【學(xué)位授予單位】:華南農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號】:S852.65
【目錄】:
- 摘要3-5
- Abstract5-7
- 英文縮略詞7-12
- 1 引言12-16
- 1.1 禽流感概述12
- 1.2 AIV H9N2亞型在我國的流行情況12-13
- 1.3 AIV H9N2亞型基因重組現(xiàn)狀13-14
- 1.4 AIV H9N2亞型的疫苗防控14
- 1.5 潛在的公共衛(wèi)生風(fēng)險14-15
- 1.6 本研究的目的意義15-16
- 2 材料與方法16-23
- 2.1 材料16-18
- 2.1.1 相關(guān)試劑16
- 2.1.2 雞胚及實驗動物16
- 2.1.3 主要儀器16
- 2.1.4 生物信息學(xué)軟件16
- 2.1.5 毒株16-18
- 2.2 病毒的分離鑒定與RT-PCR擴(kuò)增18-20
- 2.2.1 病毒的分離18
- 2.2.2 病毒的鑒定和純化18
- 2.2.3 病毒RNA的抽提18-19
- 2.2.4 RT-PCR擴(kuò)增引物19
- 2.2.5 各基因片段一步法RT-PCR擴(kuò)增19-20
- 2.2.6 PCR產(chǎn)物的回收和純化20
- 2.3 H9N2亞型AIV全基因組測定及遺傳進(jìn)化分析20-21
- 2.3.1 全基因組測序20
- 2.3.2 序列拼接和遺傳演化分析20-21
- 2.3.3 基因型劃分21
- 2.4 H9N2亞型AIV分離株抗原性分析21-22
- 2.4.1 H9N2亞型AIV滅活油乳劑疫苗的制備21
- 2.4.2 單因子血清的制備21
- 2.4.3 不同毒株間的抗原交叉反應(yīng)測定21
- 2.4.4 抗原性差異分析21-22
- 2.5 免疫保護(hù)實驗22-23
- 2.5.1 病毒半數(shù)雞胚感染量(EID50)的測定22
- 2.5.2 AIV H9N2亞型排毒規(guī)律的研究22
- 2.5.3 毒株Ck/GX/SIC6/13的免疫保護(hù)效果評價22-23
- 3 結(jié)果與分析23-54
- 3.1 H9N2亞型AIV的流行分布情況23-25
- 3.2 HA基因25-32
- 3.2.1 HA基因遺傳進(jìn)化分析25
- 3.2.2 HA基因核苷酸序列分析及相似性比較25
- 3.2.3 HA蛋白氨基酸序列及特定氨基酸位點(diǎn)分析25-32
- 3.3 NA基因32-40
- 3.3.1 NA基因遺傳進(jìn)化分析32
- 3.3.2 NA基因核苷酸序列分析及相似性比較32
- 3.3.3 NA蛋白氨基酸序列及特定氨基酸位點(diǎn)分析32-40
- 3.4 內(nèi)部基因40-45
- 3.4.1 PB2基因遺傳進(jìn)化分析40
- 3.4.2 PB1基因遺傳進(jìn)化分析40
- 3.4.3 PA基因遺傳進(jìn)化分析40
- 3.4.4 NP基因遺傳進(jìn)化分析40
- 3.4.5 M基因遺傳進(jìn)化分析40-41
- 3.4.6 NS基因遺傳進(jìn)化分析41
- 3.4.7 內(nèi)部基因上特定氨基酸位點(diǎn)分析41-45
- 3.5 重組基因型劃分結(jié)果45-47
- 3.6 抗原性分析結(jié)果47-52
- 3.7 免疫保護(hù)實驗結(jié)果52-54
- 3.7.1 H9N2亞型AIV不同攻毒方式排毒規(guī)律的研究52-53
- 3.7.2 免疫保護(hù)實驗53-54
- 4 討論54-60
- 4.1 H9N2亞型AIV的流行趨勢54
- 4.2 表面基因的變異情況54-57
- 4.2.1 HA基因裂解位點(diǎn)模式與NA基因莖部缺失54-55
- 4.2.2 HA蛋白受體結(jié)合位點(diǎn)55-56
- 4.2.3 NA蛋白紅細(xì)胞吸附位點(diǎn)和神經(jīng)氨酸酶抑制位點(diǎn)56
- 4.2.4 HA、NA蛋白潛在糖基化位點(diǎn)56-57
- 4.3 內(nèi)部基因特定氨基酸位點(diǎn)57-58
- 4.4 內(nèi)部基因的基因重組情況58
- 4.5 抗原性分析58-59
- 4.6 免疫保護(hù)實驗59-60
- 5 結(jié)論60-61
- 致謝61-62
- 參考文獻(xiàn)62-66
【參考文獻(xiàn)】
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,本文編號:1056486
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