發(fā)布時(shí)間：2017-10-12 17:41

  本文關(guān)鍵詞：廣西PRRSV分離株GXNN1396全基因序列分析

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【摘要】：前期我們實(shí)驗(yàn)室分離鑒定了一株nsP2蛋白缺失49個(gè)氨基酸(aa)的豬繁殖與呼吸綜合征病毒(PRRSV)GXNN1396株。為了進(jìn)一步對(duì)該毒株全基因組序列特性進(jìn)行分析,將GXNN1396株病毒在Marc-145細(xì)胞上傳至第3代,收集細(xì)胞上清,抽提該病毒RNA。用RT-PCR檢測(cè)方法對(duì)GXNN1396基因組進(jìn)行分段擴(kuò)增、克隆、序列比較和遺傳進(jìn)化分析。結(jié)果表明,GXNN1 396全長(zhǎng)15 263核苷酸(nt),不包括5′帽子結(jié)構(gòu)和3′Poly A尾。其中,5′非翻譯區(qū)(5′UTR)長(zhǎng)為189nt,3′UTR長(zhǎng)151nt,ORF1a、ORF1b、ORF2、ORF3、ORF4、ORF5、ORF6、ORF7分別為7 422、4 382、771、765、537、603、525nt和372nt。與國(guó)內(nèi)外的PRRSV毒株核苷酸序列的同源性進(jìn)行了比較顯示,GXNN1396與歐洲經(jīng)典毒株LV和VR2332株的同源性分別為61%和88.8%,與TJ、JXwn06、JXA1在全基因上的同源性高達(dá)97.2%~97.3%,說明GXNN1396株是一株典型的美洲型PRRSV毒株。遺傳進(jìn)化分析表明美洲型PRRSV主要分為3個(gè)亞群,GXNN1396與高致病性PRRSV毒株屬于同一分支。
【作者單位】： 廣西大學(xué)動(dòng)物科學(xué)技術(shù)學(xué)院動(dòng)物傳染病研究室;廣西陸川縣陸透水庫(kù)管理所;
【關(guān)鍵詞】： 豬繁殖與呼吸綜合征病毒 全基因序列分析 同源性分析 遺傳進(jìn)化分析
【基金】：國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(31372444) 廣西大學(xué)科研基金項(xiàng)目(XGZ130959)
【分類號(hào)】：S852.65
【正文快照】： 豬繁殖與呼吸綜合征(Porcine reproductive andrespiratory syndrome,PRRS)是豬繁殖與呼吸綜合征病毒(Porcine reproductive and respiratory syn-drome virus,PRRSV)引起的仔豬呼吸困難、體重下降、生長(zhǎng)緩慢及母豬繁殖障礙為特征的一種接觸性傳染病,俗稱“豬藍(lán)耳病”。該病于

【共引文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前1條

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中國(guó)博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前1條

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【相似文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

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5 梁丹潔;廣西豬嵴病毒的感染狀況調(diào)查與基因序列分析[D];廣西大學(xué);2014年

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7 劉飛;家養(yǎng)水稻休眠與萌發(fā)相關(guān)基因序列分析及表達(dá)研究[D];中國(guó)科學(xué)院北京基因組研究所;2011年

8 郭川;PRRS病毒GP5的基因序列分析及其重組蛋白的應(yīng)用研究[D];廈門大學(xué);2006年

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本文編號(hào)：1020065