本文關(guān)鍵詞：結(jié)核分枝桿菌RD12區(qū)T細(xì)胞表位分布情況預(yù)測(cè)及分析

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【摘要】：目的預(yù)測(cè)并分析結(jié)核分枝桿菌(MTB)RD12區(qū)4個(gè)抗原的CD4+T和CD8+T細(xì)胞表位分布情況。方法在NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)上查詢(xún)并獲得各個(gè)抗原的氨基酸序列,用Blast分析其與MTB復(fù)合群及人類(lèi)蛋白的同源性。利用SYFPEITHI、NETCTL、BIMAS和NetMHC數(shù)據(jù)庫(kù)預(yù)測(cè)并分析MTB的RD12區(qū)抗原CD8+T細(xì)胞表位的分布情況;利用NetMHC數(shù)據(jù)庫(kù)預(yù)測(cè)并分析MTB的RD12區(qū)抗原的CD4+T細(xì)胞表位的分布情況。然后,綜合CD4與CD8表位預(yù)測(cè),篩選出優(yōu)勢(shì)表位肽段。結(jié)果通過(guò)預(yù)測(cè)與分析,初步篩選出MTB的RD12區(qū)4個(gè)抗原的CD8+T細(xì)胞候選表位16個(gè);CD4+T細(xì)胞的強(qiáng)結(jié)合候選表位234個(gè),弱結(jié)合候選表位505個(gè),綜合CD4與CD8表位預(yù)測(cè)并分析,最終篩選出13個(gè)優(yōu)勢(shì)表位肽段。結(jié)論預(yù)測(cè)出來(lái)的T細(xì)胞候選表位將為結(jié)核病的特異性診斷及新的抗結(jié)核多表位疫苗的研究奠定基礎(chǔ)。
【作者單位】： 河南中醫(yī)學(xué)院醫(yī)學(xué)免疫學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;上海交通大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院免疫學(xué)與微生物學(xué)系;
【關(guān)鍵詞】： 結(jié)核分枝桿菌 RD區(qū) T細(xì)胞 表位分析
【基金】：“十二五”國(guó)家科技重大專(zhuān)項(xiàng)(2013ZX10003002-005) 國(guó)家自然基金項(xiàng)目(81271794) 上海市科委技術(shù)支撐項(xiàng)目(12441903300)~~
【分類(lèi)號(hào)】：R392
【正文快照】： 結(jié)核病是目前危害全球人類(lèi)健康的主要傳染病之一,是由結(jié)核分枝桿菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)所致的一種以呼吸道感染為主的慢性傳染性疾病。據(jù)2012年WHO[1]報(bào)道,2011年全球估計(jì)有870萬(wàn)新增結(jié)核病患者,其中有13%共感染人類(lèi)免疫缺陷病毒(human immunodeficiency virus,H

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本文編號(hào)：981564