本文關鍵詞：幽門螺桿菌cag致病島CagⅠ蛋白的生物信息學分析

  更多相關文章： 幽門螺桿菌 cag致病島 生物信息學 結(jié)構(gòu)預測 功能分析

【摘要】：目的用生物信息學分析方法對幽門螺桿菌(HP)cag致病島中的CagⅠ蛋白進行綜合分析,推斷其結(jié)構(gòu)和功能,并探索其在HP致病中的作用。方法用antherprot V5.0軟件和網(wǎng)絡數(shù)據(jù)庫等分析預測其結(jié)構(gòu),BLAST程序搜索其同源序列;用PROSITE SCAN和Fingerprint服務器分析推測其潛在的功能。結(jié)果 CagⅠ蛋白有361個氨基酸殘基,分子量(Mr)為39 370,理論等電點為5.56;N'端20個氨基酸殘基為信號肽,有三段跨膜區(qū),二級結(jié)構(gòu)和三級結(jié)構(gòu)中螺旋結(jié)構(gòu)為主體(約80%);CagⅠ為穩(wěn)定的疏水蛋白,保守性很強,有N-糖基化作用位點、蛋白激酶C磷酸化位點、酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位點和豆蔻�；饔梦稽c;存在膜蛋白、菌毛蛋白、轉(zhuǎn)運蛋白、ATP/GTP酶、轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)因子、分泌系統(tǒng)蛋白等多個蛋白質(zhì)標簽。結(jié)論 CagⅠ蛋白定位于HP外膜,是Ⅳ型分泌系統(tǒng)重要組成蛋白質(zhì),在信號轉(zhuǎn)導和物質(zhì)轉(zhuǎn)運過程中充當信使或載體,可能具有水解酶及ATP/GTP酶活性。
【作者單位】： 江蘇大學基礎醫(yī)學與醫(yī)學技術學院病原生物學研究室;北京市中西醫(yī)結(jié)合醫(yī)院檢驗科;武漢塞力斯生物技術有限公司;
【關鍵詞】： 幽門螺桿菌 cag致病島 生物信息學 結(jié)構(gòu)預測 功能分析
【基金】：國家自然科學基金項目(81271795) 2012年第十一批省級科技創(chuàng)新與成果轉(zhuǎn)化(生命健康科技)專項基金(BL2012047) 2012年度高等學校博士學科點專項科研基金(博導類)項目(20123227110008)
【分類號】：R378
【正文快照】： 有限公司,武漢430040)幽門螺桿菌(Helicobacter pylori,HP)在約58 000年前隨著人類從東非遷往世界各地并與人類共同進化,越來越適應人體胃內(nèi)環(huán)境[1]。HP已成為胃病的一個研究熱點[2]。HP感染呈全球性分布,全球感染率超過50%[3],盡管近年來胃癌的發(fā)病率有所下降,但仍然是全球的

【共引文獻】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前3條

1 郭楊;方剛;;DNA疫苗研究進展[J];微生物學免疫學進展;2013年05期

2 暴艷敏;馬桂蘭;喬自林;于國偉;;頂復門原蟲蛋白質(zhì)棕櫚�；难芯窟M展[J];中國獸醫(yī)科學;2013年09期

3 Filipa F Vale;Mónica Oleastro;;Overview of the phytomedicine approaches against Helicobacter pylori[J];World Journal of Gastroenterology;2014年19期

中國博士學位論文全文數(shù)據(jù)庫 前2條

1 陳智浩;減毒沙門菌介導的基于甲病毒復制子載體的自殺基因系統(tǒng)的抗腫瘤效應研究[D];華中科技大學;2013年

2 謝立蘋;幽門螺桿菌CagM、CagI蛋白的生物信息學分析[D];江蘇大學;2012年

中國碩士學位論文全文數(shù)據(jù)庫 前2條

1 劉佳文;TGEV S/M雙基因減毒沙門氏菌核酸疫苗株初步構(gòu)建研究[D];四川農(nóng)業(yè)大學;2012年

2 韋葳;玉米ZmSTOMAGEN基因的克隆及表達特性分析[D];廣西大學;2013年

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本文編號：952809