本文關鍵詞：人腸道病毒A71型分離株全基因組序列及毒力相關位點分析

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【摘要】：為了解人腸道病毒A71型(Enterovirus A71,EV-A71)的基因重組和遺傳進化特征,探索其毒力相關位點。本研究通過對郴州市3株EV-A71分離株進行全基因組序列測定和分析,應用RDP軟件(版本4.1.6)將其與231條EV-A71全基因組序列進行比較分析,檢測可能的重組事件及重組位點;采用SimPlot軟件(版本號3.5.1)對重組序列、2條親本序列和其他A組腸道病毒(EV-A)代表株序列進行相似性分析;采用MEGA軟件(版本5.2)構建系統發(fā)生樹;結果發(fā)現郴州市3株EV-A71毒株均檢測到重組信號,其共同的親本主序列為廣東省2009年毒株,親本亞序列為中國臺灣地區(qū)2008年毒株;我國C4b進化分支EV-A71代表株(分離于1998年的SHZH98株)和C4a進化分支EV-A71代表株(分離于2008年的安徽阜陽株)均與CVA4、CVA14及CVA16原型株在3D區(qū)域檢測到型間重組信號。采用SPSS軟件(版本19.0)對不同病例類型的變異位點作卡方檢驗以篩選出可能的毒力相關位點。發(fā)現死亡病例組與重癥病例組間未找到具有統計學意義的突變位點;而死亡與重癥病例合并組與一般病例組進行比較,共發(fā)現18個突變位點具有統計學意義,這些突變位點僅分布于P2區(qū)和P3區(qū),而P1區(qū)未見。我國大陸的EV-A71流行株與EV-A其他毒株的型間重組早在1998年前即已經發(fā)生,并且在2008~2012年的手足口病暴發(fā)疫情中,EV-A71的型內重組頻繁發(fā)生。此外,EV-A71毒力的改變可能與非衣殼蛋白區(qū)的變異相關,因此應該關注非衣殼蛋白基因改變對病毒毒力的影響。
【作者單位】： 郴州市疾病預防控制中心;中國疾病預防控制中心病毒病預防控制所 世界衛(wèi)生組織西太區(qū)脊毮灰質炎參比實驗室 衛(wèi)生部醫(yī)學病毒與病毒病重點實驗室;
【關鍵詞】： 人腸道病毒A型 全基因組序列 毒力 基因重組 基因突變
【基金】：郴州市科技計劃項目(CZ2013108)
【分類號】：R373.24
【正文快照】： 人腸道病毒A71型是引起嬰幼兒手足口病(Hand,foot and mouth disease,HFMD)的主要病原體,具有高度的嗜神經性,除引起手足口病和皰疹性咽峽炎外,嚴重時可引發(fā)中樞神經系統并發(fā)癥、脊髓灰質炎樣麻痹等癥狀,其中神經源性肺水腫是導致重癥患兒死亡的主要原因[1]。目前,隨著我國脊

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