基于微衛(wèi)星標(biāo)記的不同殼型湖北釘螺小尺度景觀群體遺傳結(jié)構(gòu)研究
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【摘要】:目的分析湖北松滋地區(qū)湖北釘螺小尺度景觀群體的遺傳結(jié)構(gòu)。方法選擇T6-17、P101、D11、B14、T4-33和C22等6對(duì)微衛(wèi)星位點(diǎn)對(duì)松滋地區(qū)10個(gè)生境的湖北釘螺群體進(jìn)行基因掃描,計(jì)算各群體的等位基因數(shù)(Na)、有效等位基因數(shù)(Ne)、期望雜合度(He)、觀察雜合度(Ho)、多態(tài)信息含量(PIC)、群體間的遺傳分化系數(shù)(FST)和遺傳距離,根據(jù)遺傳距離進(jìn)行聚類分析,并進(jìn)行分子變異方差分析(AMOVA)。結(jié)果 10個(gè)釘螺群體經(jīng)鑒定螺殼分為光殼和肋殼(包括淺肋和深肋),10個(gè)群體共檢測(cè)到141個(gè)等位基因,各位點(diǎn)20-34個(gè)不等,平均每個(gè)位點(diǎn)檢測(cè)到23.5個(gè);6個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)的平均有效等位基因數(shù)為1.575,各位點(diǎn)的有效等位基因數(shù)并不平衡,且數(shù)值差異較大,范圍從0.445至3.060。群體的平均Ho范圍為0.438-0.698,在光殼的團(tuán)山村群體中最低,在深肋型的馬木口村群體中最高;群體的平均He范圍為0.589-0.892,在淺肋型的德勝村群體中最低,在深肋型的馬木口村群體中最高;成對(duì)群體間的Fst為-0.01564-0.25247,各群體的PIC為0.528-0.857,顯示出高度多態(tài)性;AMOVA分析結(jié)果顯示,變異主要存在于個(gè)體間,占總變異的88.4%;聚類分析結(jié)果顯示,肋殼的馬木口村、橫堤村、義興村三個(gè)群體與光殼的馬獅子咀村、民主村、土橋村三個(gè)群體先聚為一支后,與淺肋的德勝村、木天河村兩個(gè)群體與光殼的團(tuán)山村、夾馬槽村聚的一支合聚。結(jié)論松滋地區(qū)不同景觀環(huán)境下湖北釘螺呈現(xiàn)不同螺殼形態(tài),盡管遺傳多樣性較為豐富,但遺傳變異主要來(lái)自個(gè)體間,不同螺殼形態(tài)的湖北釘螺群體間并未體現(xiàn)出明顯的遺傳分化。
【作者單位】: 中國(guó)疾病預(yù)防控制中心寄生蟲病預(yù)防控制所 衛(wèi)生部寄生蟲病原與媒介生物學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室 世界衛(wèi)生組織瘧疾、血吸蟲病和絲蟲病合作中心;陜西師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院;
【關(guān)鍵詞】: 微衛(wèi)星DNA 湖北釘螺 小尺度群體遺傳結(jié)構(gòu)
【基金】:國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(81101280) 國(guó)家科技重大專項(xiàng)(2012ZX10004220,2008ZX10004-011) 上海市公共衛(wèi)生海外留學(xué)基金(GWHW201216)~~
【分類號(hào)】:R383.24
【正文快照】: 湖北釘螺(Oncomelania hupensis)是日本血吸蟲唯一的中間宿主,我國(guó)大陸僅有一種,廣泛分布于長(zhǎng)江中下游地區(qū)[1-2]。由于其分布廣泛、孳生環(huán)境復(fù)雜以及地理隔離的影響,湖北釘螺不同地理群體發(fā)生了顯著的遺傳分化和變異。近年來(lái),隨著湖北釘螺的群體遺傳學(xué)、景觀生態(tài)學(xué)等深入研究,
【相似文獻(xiàn)】
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,本文編號(hào):765907
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