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CR1SPR-Cas9技術(shù)構(gòu)建LCA-Nmnat1小鼠動物模型及其發(fā)病機(jī)理研究和PHEX基因新發(fā)嵌合突變導(dǎo)致低磷酸鹽血癥

發(fā)布時(shí)間:2017-08-28 12:33

  本文關(guān)鍵詞:CR1SPR-Cas9技術(shù)構(gòu)建LCA-Nmnat1小鼠動物模型及其發(fā)病機(jī)理研究和PHEX基因新發(fā)嵌合突變導(dǎo)致低磷酸鹽血癥性佝僂病


  更多相關(guān)文章: 先天性黑蒙癥 MMNAT1基因 CRISPR-Cas9技術(shù) 小鼠動物模型 X連鎖顯性低磷酸鹽血癥性佝僂病 PHEX基因 嵌合突變


【摘要】:第一部分CRISPR-Cas9技術(shù)構(gòu)建LCA-Nmnatl小鼠動物模型及其發(fā)病機(jī)理研究背景:遺傳性疾病是出生缺陷的重要原因,單純性眼科遺傳病近300種,其中先天性黑蒙癥(Leber's congenital amaurosis, LCA)是發(fā)生最早、最嚴(yán)重的遺傳性視網(wǎng)膜病變。目前已發(fā)現(xiàn)18種與LCA相關(guān)的致病基因,我們課題組運(yùn)用外顯子組捕獲和新一代高通量測序的方法,發(fā)現(xiàn)NMNAT1基因突變可以導(dǎo)致第9型先天性黑蒙癥。但是具體的突變致病機(jī)制未知。方法:從生物信息學(xué)分析、細(xì)胞學(xué)分析以及CRISPR-Cas9構(gòu)建定點(diǎn)突變小鼠動物模型三方面探究突變可能的致病機(jī)理。生物信息學(xué)分析包括人和小鼠NMNAT1蛋白同源性分析,確保以小鼠作為動物模型的可信性;蛋白晶體結(jié)構(gòu)分析,找到最可能影響蛋白結(jié)構(gòu)的位點(diǎn)作為突變研究對象;蛋白質(zhì)相互作用分析,探索與NMNAT1相互作用的蛋白。細(xì)胞學(xué)分析方面構(gòu)建8種突變和一種野生型重組質(zhì)粒,進(jìn)行熒光共聚焦和熒光定量實(shí)驗(yàn),探究突變對亞細(xì)胞定位和對RNA水平的影響,后續(xù)將進(jìn)一步進(jìn)行蛋白質(zhì)水平的Western Blot實(shí)驗(yàn)。CRISPR-Cas9構(gòu)建小鼠動物模型方面,已獲得用于顯微注射的gRNA、Cas9 mRNA和模板DNA,已購買和飼養(yǎng)供體鼠(C57)和受體鼠(ICR),獲得動物模型后將從表型、生化分析、細(xì)胞分子水平等方面全面探索致病機(jī)制,并且探尋可行的治療方法。結(jié)果:人和小鼠NMNAT1蛋白質(zhì)高度同源。蛋白晶體結(jié)構(gòu)分析纈氨酸151(V151)位于蛋白的疏水核心,纈氨酸98(V98)接近配體結(jié)合位點(diǎn),Trp85* (M255)以及Trp169* (M507)無義突變蛋白明顯截短,結(jié)構(gòu)分散。蛋白質(zhì)相互作用預(yù)測其與多種蛋白存在可能的相互作用。熒光共聚焦實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示Trp85*亞細(xì)胞定位有明顯逸散出細(xì)胞核的現(xiàn)象,其他突變亞細(xì)胞定位無異常。熒光定量實(shí)驗(yàn)顯示Trp85*(M255)、Trp169* (M507)無義突變體以及Met35Thr (M104)、Leu153Val(M457)錯(cuò)義突變體RNA水平和野生型差別不大,而Val151Phe(M451)錯(cuò)義突變體RNA水平顯著下降。CRISPR-Cas9構(gòu)建小鼠動物模型方面,已經(jīng)準(zhǔn)備好注射用的RNA和模板DNA。結(jié)論:本研究擬從生物信息學(xué)、細(xì)胞生物學(xué)、分子生物學(xué)、生物化學(xué)、組織和器官等多角度闡明NMNAT1突變和先天性黑蒙癥的關(guān)系。目前進(jìn)展順利,已完成前期工作,包括生物信息學(xué)分析,細(xì)胞生物學(xué)的部分分析和CRISPR-Cas9構(gòu)建小鼠動物模型前面部分,后續(xù)將進(jìn)一步探究突變的致病機(jī)制,以及利用藥物治療和基因治療手段研究治療先天性黑蒙癥的可行性,為臨床研究和治療奠定理論基礎(chǔ)。第二部分PHEX基因新發(fā)嵌合突變導(dǎo)致低磷酸鹽血癥性佝僂病X連鎖顯性低磷酸鹽血癥性佝僂病(MIM#307800),是一種遺傳性骨病。主要表現(xiàn)為腎小管對磷酸鹽的重吸收異常、發(fā)育遲緩、身材矮小、骨骼疼痛、牙釉質(zhì)異常、雙下肢畸形、行走無力,X射線提示佝僂病癥狀。該病是由位于X染色體p22.1-22.2上PHEX基因突變造成。在本研究中,我們診斷出一個(gè)患病男孩,其PHEX基因看似雜合,我們擬探尋具體的致病機(jī)制。雖然患者是一名男孩,Sanger測序顯示其X染色體上的PHEX基因有表象上雜合突變,存在雙峰,一個(gè)是正常的堿基“G”,另一個(gè)是“A”。TA克隆測序表明確實(shí)存在這兩種堿基,并且獲得了大致的比率。之后我們用生物信息學(xué)工具預(yù)測以及外顯子捕獲技術(shù)實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證該剪切位點(diǎn)突變對RNA剪切的影響。熒光定量PCR實(shí)驗(yàn)用以檢測PHEx的基因拷貝數(shù)。TA克隆測序?qū)嶒?yàn)顯示正常堿基G和突變堿基A的頻率比為19:13。染色體核型分析結(jié)果顯示病人核型正常,熒光定量PCR檢測基因拷貝數(shù)的結(jié)果驗(yàn)證了核型分析的結(jié)果。這個(gè)剪切突變將會引起外顯子18中4個(gè)堿基丟失,造成移碼突變,蛋白截短,PHEX蛋白的激活位點(diǎn)和Zn2+結(jié)合位點(diǎn)喪失,因此造成腎小管重吸收障礙和骨骼礦化異常。總之,發(fā)生在保守剪切位點(diǎn)的突變將會造成異常的剪切,形成功能受損的蛋白。我們發(fā)現(xiàn)的新發(fā)突變是一個(gè)嵌合突變,可能發(fā)生于前期受精卵階段。本研究對于之后進(jìn)行X連鎖顯性低磷酸鹽血癥性佝僂病的遺傳咨詢時(shí)考慮嵌合突變起到重要的提示作用。
【關(guān)鍵詞】:先天性黑蒙癥 MMNAT1基因 CRISPR-Cas9技術(shù) 小鼠動物模型 X連鎖顯性低磷酸鹽血癥性佝僂病 PHEX基因 嵌合突變
【學(xué)位授予單位】:浙江大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號】:R-332;R774.1
【目錄】:
  • 致謝4-5
  • 中文摘要5-8
  • Abstract8-13
  • 第一部分 CRISPR-Cas9技術(shù)構(gòu)建LCA-Nmnat1小鼠動物模型及其發(fā)病機(jī)理研究13-63
  • 1 引言13-16
  • 2 材料和方法16-44
  • 3 結(jié)果44-57
  • 4 討論與小結(jié)57-60
  • 5 參考文獻(xiàn)60-63
  • 第二部分 PHEX基因新發(fā)嵌合突變導(dǎo)致低磷酸鹽血癥性佝僂病63-97
  • 1 引言63-64
  • 2 材料和方法64-84
  • 3 結(jié)果84-91
  • 4 討論91-93
  • 5 小結(jié)93-94
  • 6 參考文獻(xiàn)94-97
  • 綜述97-104
  • 參考文獻(xiàn)101-104
  • 作者簡介及在讀期間所取得的科研成果104-105

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