本文關(guān)鍵詞：基于全基因組單核苷酸多態(tài)性的遺傳力估計(jì)的方法研究

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【摘要】：隨著對(duì)基因領(lǐng)域的深入研究和不斷探索,人類(lèi)對(duì)復(fù)雜性狀和常見(jiàn)病的研究逐步深入到了全基因組的研究中.而單核苷酸多態(tài)性SNP在這些研究中起到了重要的作用.SNP是可遺傳變異中最常見(jiàn)的一種,并且它廣泛地分布在某些群體、個(gè)體全基因組DNA中,大約每1000個(gè)堿基出現(xiàn)一個(gè)SNP.正是由于SNP的分布廣泛、遺傳相對(duì)穩(wěn)定、對(duì)基因的表達(dá)水平或蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)有很大影響的性質(zhì),對(duì)于全基因組SNP的研究已經(jīng)應(yīng)用到生物學(xué)、遺傳學(xué)等諸多領(lǐng)域.一直以來(lái),像糖尿病、高血壓、冠心病等復(fù)雜疾病一直困擾著我們.由于99%的人類(lèi)基因與老鼠非常相似,所以科學(xué)家用老鼠的實(shí)驗(yàn)去研究影響復(fù)雜疾病的性狀.本文主要對(duì)和復(fù)雜疾病(糖尿病、高血壓、冠心病)相關(guān)的四個(gè)性狀進(jìn)行遺傳力大小的估計(jì),用288只NMRI老鼠的真實(shí)性狀表型值和SNP基因型,通過(guò)線(xiàn)性混合模型,應(yīng)用方差分析估計(jì)的方法對(duì)HDL、CHL、TRI、GLU這四個(gè)性狀進(jìn)行遺傳力估計(jì).并用逐步回歸和次等位基因頻率MAF進(jìn)一步對(duì)染色體和SNP位點(diǎn)篩選.結(jié)果表明,通過(guò)逐步回歸和MAF變量篩選,對(duì)遺傳力估計(jì)結(jié)果的貢獻(xiàn)最大的致病位點(diǎn)的基因頻率范圍和MAF0.1的SNP是一致的.
【關(guān)鍵詞】：單核苷酸多態(tài)性 線(xiàn)性混合模型 方差分析估計(jì) 逐步回歸 遺傳力估計(jì)
【學(xué)位授予單位】：黑龍江大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2016
【分類(lèi)號(hào)】：R394
【目錄】：

• 中文摘要3-4
• Abstract4-7
• 符號(hào)說(shuō)明7-8
• 第1章 緒論8-14
• 1.1 背景介紹8-10
• 1.2 國(guó)內(nèi)外研究概況10-13
• 1.2.1 國(guó)外發(fā)展現(xiàn)狀11
• 1.2.2 國(guó)內(nèi)發(fā)展現(xiàn)狀11-12
• 1.2.3 論文研究的目的和意義12-13
• 1.3 本文的創(chuàng)新點(diǎn)13-14
• 第2章 預(yù)備知識(shí)14-19
• 2.1 遺傳學(xué)的相關(guān)理論基礎(chǔ)14-16
• 2.1.1 染色體、等位基因、基因型、表型14
• 2.1.2 連鎖不平衡(LD)14-15
• 2.1.3 單核苷酸多態(tài)性(SNP)15-16
• 2.2 遺傳力16-18
• 2.2.1 遺傳方差的定義16-17
• 2.2.2 遺傳力的定義17-18
• 2.3 本章小結(jié)18-19
• 第3章 遺傳力估計(jì)的方法19-28
• 3.1 線(xiàn)性混合模型19-23
• 3.1.1 線(xiàn)性混合模型的介紹19-20
• 3.1.2 線(xiàn)性混合模型在遺傳力估計(jì)上的應(yīng)用20-23
• 3.2 方差分析估計(jì)23-27
• 3.2.1 矩陣的QR分解24-25
• 3.2.2 方差分析法AN OV A進(jìn)行遺傳力估計(jì)25-27
• 3.3 本章小結(jié)27-28
• 第4章 老鼠的四個(gè)性狀的遺傳力估計(jì)28-31
• 4.1 數(shù)據(jù)資料28-29
• 4.2 結(jié)果29-30
• 4.3 本章小結(jié)30-31
• 第5章 變量篩選31-39
• 5.1 逐步回歸法篩選變量31-35
• 5.1.1 顯著性檢驗(yàn)31-32
• 5.1.2 逐步回歸的結(jié)果32-35
• 5.2 最小等位基因(MAF)閾值篩選35-38
• 5.3 本章小結(jié)38-39
• 結(jié)論39-41
• 參考文獻(xiàn)41-46
• 致謝46

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6 徐t，

本文編號(hào)：706976