本文關(guān)鍵詞：基于生物信息學(xué)分析微小隱孢子蟲含WD40結(jié)構(gòu)域的蛋白功能

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【摘要】：目的對微小隱孢子蟲中含WD40結(jié)構(gòu)域的蛋白進(jìn)行生物信息學(xué)分析,分析該蛋白家族的WD40結(jié)構(gòu)并預(yù)測其功能,為微小隱孢子蟲基因功能的研究提供一定的基礎(chǔ)理論。方法通過隱孢子蟲基因組數(shù)據(jù)庫收集數(shù)據(jù),獲得微小隱孢子蟲含WD40結(jié)構(gòu)域蛋白家族的序列信息,搜索每個(gè)蛋白的CDD結(jié)構(gòu)域并進(jìn)行NCBI BLAST比對分析,確定為WD40結(jié)構(gòu)域家族蛋白,分析結(jié)構(gòu)域并預(yù)測功能。結(jié)果在C.parvum Iowa II中共搜索到50個(gè)含有WD40結(jié)構(gòu)域的蛋白,其中cgd1_1930、cgd5_740和cgd4_3360含有CAF1C_H4-bd超家族結(jié)構(gòu),可能參與DNA修復(fù)和DNA復(fù)制過程;cgd4_260含有ACE1-Sec16-like超家族,可能參與囊泡的形成和物質(zhì)運(yùn)輸;cgd1_2600含有TAF5_NTD2結(jié)構(gòu)域,可能參與蛋白與蛋白的相互作用。結(jié)論在微小隱孢子蟲中,WD40蛋白家族不僅可能單獨(dú)發(fā)揮作用,而且還能通過相互輔助、結(jié)合發(fā)揮其生物效應(yīng)。
【作者單位】： 暨南大學(xué)醫(yī)學(xué)院;
【關(guān)鍵詞】： 微小隱孢子蟲 WD結(jié)構(gòu)域 生物信息學(xué)分析 功能預(yù)測
【基金】：國家自然科學(xué)基金(No.30901249,No.81101267) 廣東省自然科學(xué)基金(No.10151063201000036,No.S2011010002526) 暨南大學(xué)科研培育與創(chuàng)新基金(No.21612426)聯(lián)合資助~~
【分類號(hào)】：R382.3
【正文快照】： 隱孢子蟲(Cryptosporidiumspp.)是一種世界范圍內(nèi)廣泛流行的人獸共患寄生蟲[1],其中感染人的主要為微小隱孢子蟲(Cryptosporidium par-vum)和人隱孢子蟲(Cryptosporidium homi-nis)[2-3]。隱孢子蟲主要寄生在消化道或呼吸道,在免疫功能正常者呈自限性感染;但在免疫功能低下的

【共引文獻(xiàn)】

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【相似文獻(xiàn)】

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本文編號(hào)：678992