EB病毒相關(guān)腫瘤中病毒免疫逃逸基因BNLF2a多態(tài)性研究
本文關(guān)鍵詞:EB病毒相關(guān)腫瘤中病毒免疫逃逸基因BNLF2a多態(tài)性研究
更多相關(guān)文章: EB病毒 BNLF2a基因 腫瘤 基因多態(tài)性
【摘要】:背景和目的EB病毒(Epstein-Barr virus,EBV)又稱人類皰疹病毒4型,世界上有超過90%的健康成人為EBV攜帶者,其感染與人類多種淋巴細(xì)胞和上皮細(xì)胞性腫瘤有關(guān)。EBV的免疫逃逸可能通過抑制機(jī)體對EBV轉(zhuǎn)化細(xì)胞的清除,而參與了EBV相關(guān)腫瘤的發(fā)生。BNLF2a是EBV早期基因,可干擾抗原提呈相關(guān)轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白的抗原肽轉(zhuǎn)運(yùn)而發(fā)揮免疫逃逸作用。研究表明,來自不同地區(qū)的EBV毒株在多種基因位點(diǎn)表現(xiàn)出不同的基因多態(tài)性,同時其相關(guān)腫瘤呈人群和地域傾向性分布,因此是否存在與EBV相關(guān)腫瘤有關(guān)的EBV基因變異一直備受關(guān)注。本研究選擇我國廣東地區(qū)(鼻咽癌高發(fā)區(qū))和山東地區(qū)(鼻咽癌非高發(fā)區(qū))EBV陽性淋巴瘤、胃癌、鼻咽癌和健康人群作為研究對象,對BNLF2a基因的多態(tài)性進(jìn)行檢測分析,旨在探討B(tài)NLF2a基因的多態(tài)性及其分布特征,為闡明EBV BNLF2a基因變異與EBV相關(guān)腫瘤發(fā)生的關(guān)系提供理論依據(jù)。方法聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(polymerase chain reaction,PCR)結(jié)合DNA測序檢測EBV陽性淋巴瘤、胃癌、鼻咽癌和健康人咽漱液標(biāo)本中BNLF2a基因的多態(tài)性,應(yīng)用DNAStar軟件對序列進(jìn)行對比分析,并與EBV標(biāo)準(zhǔn)株B95-8進(jìn)行比對。根據(jù)測序結(jié)果將各序列進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化處理,DNAStar軟件生成系統(tǒng)發(fā)生樹,根據(jù)系統(tǒng)發(fā)生樹和共有突變對各種基因變異進(jìn)行分類。比較山東和廣東地區(qū)EBV相關(guān)淋巴瘤、胃癌、鼻咽癌和健康人群中BNLF2a各基因型的分布,并與以往文獻(xiàn)發(fā)表的相關(guān)數(shù)據(jù)進(jìn)行比較和分析。結(jié)果(1)共408例標(biāo)本成功進(jìn)行PCR擴(kuò)增及測序,根據(jù)測序結(jié)果及系統(tǒng)發(fā)生樹,所有標(biāo)本可以分為BNLF2a-A和BNLF2a-B兩種類型。(2)BNLF2a-A型為主要基因型,見于374例標(biāo)本,有16例標(biāo)本發(fā)現(xiàn)新的共有突變(167415nt g→a)。(3)BNLF2a-B型為次要基因型,見于34例標(biāo)本,共鑒定出2個共有突變,分別為A8T和R40K。(4)統(tǒng)計(jì)學(xué)分析結(jié)果顯示,BNLF2a-A型在廣東地區(qū)咽漱液和EBV相關(guān)腫瘤中的檢出率分別高于山東地區(qū)咽漱液和EBV相關(guān)腫瘤(TW:P0.001;EBV相關(guān)腫瘤:P=0.002)。BNLF2a-A型在廣東鼻咽癌中的檢出率顯著高于山東鼻咽癌(P0.05),而在淋巴瘤和胃癌中則兩地區(qū)無顯著性差異。(5)BNLF2a基因型在山東地區(qū)4組人群中的分布有顯著性差異(P0.001),在廣東地區(qū)4組人群中則無顯著性差異。BNLF2a-B型在山東健康人咽漱液中的檢出率顯著高于3種EBV相關(guān)腫瘤(P0.05),而BNLF2a基因型分布在山東地區(qū)各腫瘤間無顯著性差異(P0.05)。結(jié)論(1)BNLF2a基因高度保守,BNLF2a-A型是我國的主要亞型。(2)在EBV相關(guān)腫瘤和健康人群中,廣東地區(qū)BNLF2a-A型所占比率均顯著高于山東地區(qū),BNLF2a基因的多態(tài)性分布具有地域特異性。(3)BNLF2a-A基因型在山東地區(qū)EBV陽性淋巴瘤、胃癌、鼻咽癌中所占比率顯著高于健康人群,推測BNLF2a-A變異型可能與EBV相關(guān)腫瘤的發(fā)生有關(guān)。
【關(guān)鍵詞】:EB病毒 BNLF2a基因 腫瘤 基因多態(tài)性
【學(xué)位授予單位】:青島大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號】:R373.11
【目錄】:
- 摘要2-4
- Abstract4-7
- 引言7-9
- 第1章 材料與方法9-16
- 1.1 儀器、試劑和耗材9-10
- 1.2 標(biāo)本采集10
- 1.3 核酸提取10-12
- 1.4 EBV陽性標(biāo)本的篩選12-14
- 1.5 EBV免疫逃逸基因BNLF2a的基因多態(tài)性檢測14-15
- 1.6 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析15-16
- 第2章 結(jié)果16-23
- 2.1 EBV陽性標(biāo)本的鑒定16-17
- 2.2 EB病毒BNLF2a基因序列變異分析17-21
- 2.3 系統(tǒng)進(jìn)化樹分析21
- 2.4 BNLF2a變異類型在不同人群中的分布21-23
- 第3章 討論23-26
- 結(jié)論26-27
- 參考文獻(xiàn)27-32
- 綜述32-51
- 綜述參考文獻(xiàn)42-51
- 攻讀學(xué)位期間的研究成果51-52
- 致謝52-53
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,本文編號:618574
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