廣州管圓線蟲線粒體基因組比較分析
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【摘要】:目的比較我國大陸地區(qū)廣州管圓線蟲線粒體基因組的多態(tài)性。方法在種群遺傳學(xué)研究基礎(chǔ)上,選取7條雌蟲進行線粒體基因組的測定。根據(jù)廣州管圓線蟲線粒體基因組已知序列(GQ398121)設(shè)計12對引物,進行PCR擴增,并對目的片段進行測序和拼接。利用多種生物學(xué)軟件對測定的線粒體基因組進行基因定位、結(jié)構(gòu)圖繪制、核苷酸及變異位點分析、進化關(guān)系分析。結(jié)果獲得5個不同遺傳類型的線粒體基因組。這些基因組的大小相似、結(jié)構(gòu)相同,即13 491~13 502對堿基,含12個蛋白編碼基因,2個核糖體基因,22個tRNA基因,2個較大的非編碼區(qū)。上述基因緊密地排列在同一條DNA鏈上,并具有相同的轉(zhuǎn)錄方向。通過對這些基因組的比對發(fā)現(xiàn),變異位點745個,占整個基因組的5.5%。其中,缺失/插入突變59個,堿基顛換105個,堿基轉(zhuǎn)換581個。這些突變位點均勻地分布在整個線粒體基因組中。結(jié)論本研究提供了豐富的廣州管圓線蟲線粒體基因的突變位點,為構(gòu)建種內(nèi)鑒別診斷技術(shù)提供了基礎(chǔ)。
【作者單位】: 中國疾病預(yù)防控制中心寄生蟲病預(yù)防控制所世界衛(wèi)生組織瘧疾、血吸蟲病和絲蟲病合作中心;
【關(guān)鍵詞】: 廣州管圓線蟲 線粒體基因組 比較分析
【基金】:中國疾病預(yù)防控制中心青年科研基金(2012A104) 國家重大科技專項(2012ZX10004220)
【分類號】:R383.1
【正文快照】: 廣州管圓線蟲是引起人類嗜酸性粒細胞增多性腦膜腦炎的主要病原體,分布于熱帶和亞熱帶地區(qū)[1]。廣州管圓線蟲最早于1933年在廣州的野鼠寄生蟲檢查中發(fā)現(xiàn)[2],我國大陸于1984年確診第1例人體感染病例[3]。1997年之前也有數(shù)例感染病例報告,但自溫州的廣州管圓線蟲病暴發(fā)以來,病例
【參考文獻】
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【共引文獻】
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本文編號:487277
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