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一株ST477型單增李斯特菌的全基因組測(cè)序及inlA基因遺傳多樣性

發(fā)布時(shí)間:2024-05-11 05:12
  【背景】單增李斯特菌是一種重要的條件致病菌,不同型別菌株在宿主范圍和毒力等方面存在差異。內(nèi)化素基因inlA在入侵宿主上皮細(xì)胞中具有重要作用!灸康摹垦芯繂卧隼钏固鼐蛄行(Sequence type,ST)為477菌株的基因組特征及內(nèi)化素基因inlA的遺傳多樣性!痉椒ā渴褂孟嚓P(guān)軟件對(duì)測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)行多位點(diǎn)序列分型(Mutilocussequencetyping,MLST)、單核苷酸多態(tài)性(Single nucleotide polymorphism,SNP)及基因inlA遺傳多樣性分析!窘Y(jié)果】MLST進(jìn)化分析結(jié)果顯示,分離自不同國(guó)家的菌株具有較近親緣關(guān)系。以分離自中國(guó)食品的ST477型菌株為參考菌株,通過(guò)SNP分析表明,加拿大食品中的ST9型菌株發(fā)生的突變位點(diǎn)最少(91-93個(gè))。7株復(fù)合克隆系(Clonal complex,CC)為9的菌株其inlA基因序列間核苷酸相似性為29.8%-100%!窘Y(jié)論】初步分析了ST477型別菌株的進(jìn)化及基因組特征,同時(shí)研究了部分CC9克隆系菌株inlA基因突變情況,為研究ST477型別菌株的進(jìn)化及單增李斯特菌的毒力提供基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。

【文章頁(yè)數(shù)】:8 頁(yè)

【部分圖文】:

圖2單增李斯特菌MLST聚類(lèi)分析圖Figure2MLSTgeneticprofileofL.monocytogenesisolates

圖2單增李斯特菌MLST聚類(lèi)分析圖Figure2MLSTgeneticprofileofL.monocytogenesisolates

1104微生物學(xué)通報(bào)Microbiol.ChinaTel:010-64807511;E-mail:tongbao@im.ac.cn;http://journals.im.ac.cn/wswxtbcn圖2單增李斯特菌MLST聚類(lèi)分析圖Figure2MLSTgeneticprofil....


圖3基于7株單增李斯特菌全基因組SNPs進(jìn)化分析Figure3Phylogeneticanalysisof7L.monocytogeneswholegenomeSNPs

圖3基于7株單增李斯特菌全基因組SNPs進(jìn)化分析Figure3Phylogeneticanalysisof7L.monocytogeneswholegenomeSNPs

),一株ST9型與ST122型菌株聚為另一大類(lèi)群(GroupII)。雖然目前沒(méi)有明確的SNP標(biāo)準(zhǔn)規(guī)定菌株進(jìn)化關(guān)系,但ST477菌株與3株來(lái)自加拿大食品菌株的SNP差異數(shù)最少,說(shuō)明其親緣關(guān)系較近。該結(jié)果與Zhang等[22]對(duì)分離自上海的單增李斯特菌基因組多樣性進(jìn)行研究的結(jié)果相似:....


圖4基于7個(gè)單增李斯特菌的inlA序列的最大似然樹(shù)Figure4Maximumlikelihoodtreeof7L.monocytogenes

圖4基于7個(gè)單增李斯特菌的inlA序列的最大似然樹(shù)Figure4Maximumlikelihoodtreeof7L.monocytogenes

1106微生物學(xué)通報(bào)Microbiol.ChinaTel:010-64807511;E-mail:tongbao@im.ac.cn;http://journals.im.ac.cn/wswxtbcn圖4基于7個(gè)單增李斯特菌的inlA序列的最大似然樹(shù)Figure4Maximumli....



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