實時熒光環(huán)介導(dǎo)等溫擴增技術(shù)檢測土壤中的類鼻疽伯克霍爾德菌
發(fā)布時間:2024-03-22 03:40
目的結(jié)合熒光染料EvaGreen與環(huán)介導(dǎo)等溫擴增技術(shù)(Loop-mediated isothermal amplification,LAMP)探索快速檢測類鼻疽伯克霍爾德菌的可行性。方法根據(jù)類鼻疽伯克霍爾德菌filc基因片段設(shè)計了LAMP引物,利用熒光染料EvaGreen建立實時熒光環(huán)介導(dǎo)等溫擴增技術(shù)(real-time fluorescence loop-mediated isothermal amplification,RealAmp),優(yōu)化反應(yīng)條件,擴增產(chǎn)物經(jīng)電泳鑒定。通過類鼻疽伯克霍爾德菌和其他致病菌驗證特異性,比較RealAmp與普通LAMP技術(shù)的敏感度,并測定人工污染土壤模擬樣本的檢出限。結(jié)果恒溫63℃條件下,20~60 min即可完成RealAmp檢測;利用該方法檢測類鼻疽伯克霍爾德菌為陽性,其余致病菌如鼠疫桿菌、布魯氏桿菌、大腸桿菌等13株參考菌株及蜱蟲的DNA(含大量假單胞菌屬細菌)呈擴增陰性;RealAmp技術(shù)檢測類鼻疽伯克霍爾德菌核酸的靈敏度為102 CFU/mL,檢測克隆株質(zhì)粒的靈敏度可達101 copies/μL,比...
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本文編號:3934581
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圖1RealAmp檢測類鼻疽伯克霍爾德菌Fi.1DetectionofBurkholderiapseudomalleibReal-1:陽性對照2:陰性對照
2.1RealAmp檢測類鼻疽伯克霍爾德菌方法的建立如圖1所示,當反應(yīng)進行至25個循環(huán)(1min/循環(huán))時,陽性對照管的熒光強度大幅度增加,熒光曲線斜率增加,當反應(yīng)進行至40個循環(huán),熒光信號增加強度逐漸變緩,直至反應(yīng)結(jié)束,儀器判定為陽性結(jié)果,說明發(fā)生了擴增反應(yīng)。陰性對照管熒光曲線....
圖2電泳驗證RealAmp擴增產(chǎn)物M:100bpmarker;1:陽性對照;2:陰性對照
曲線斜率增加,當反應(yīng)進行至40個循環(huán),熒光信號增加強度逐漸變緩,直至反應(yīng)結(jié)束,儀器判定為陽性結(jié)果,說明發(fā)生了擴增反應(yīng)。陰性對照管熒光曲線一直處于平滑的狀態(tài),直到反應(yīng)終止也沒有曲線斜率的變化,儀器判定為陰性結(jié)果,說明沒有發(fā)生擴增反應(yīng)。1:陽性對照2:陰性對照圖1RealAmp檢測類....
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