發(fā)布時(shí)間：2024-03-05 05:47

　　隨著耐藥細(xì)菌的大量出現(xiàn)及廣泛傳播,細(xì)菌耐藥性成為全球備受關(guān)注的問題。耐藥細(xì)菌的特征如耐藥基因、毒力因子、質(zhì)粒分型等以及不同菌株間親緣關(guān)系對(duì)于細(xì)菌耐藥性流行病學(xué)及分子生物學(xué)的研究有著十分重要的意義。但是傳統(tǒng)的技術(shù)手段如聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(Polymerase chain reaction,PCR)和脈沖場(chǎng)凝膠電泳(Pulsed field gel electrophoresis,PFGE)等得到的結(jié)果不夠全面且精確度低,對(duì)于現(xiàn)有的研究存在很大的局限性。全基因組測(cè)序技術(shù)(Whole genome sequencing,WGS)和生物信息學(xué)分析(Bioinformatics analysis)由于能夠快速詳盡地得到耐藥細(xì)菌的特征,也能更加精細(xì)地判斷不同菌株間的進(jìn)化關(guān)系,逐漸成為更加有效的技術(shù)手段,為耐藥性研究提供了有效的幫助。因此,文中系統(tǒng)地介紹全基因組測(cè)序分析流程中的各個(gè)步驟,主要包括文庫構(gòu)建、平臺(tái)測(cè)序以及后期數(shù)據(jù)分析三大方面的不同方法和其相應(yīng)的特點(diǎn),期望相關(guān)研究人員對(duì)此能夠有更全面的了解,并得到一定的幫助。

【文章頁數(shù)】：17 頁

【文章目錄】：
1 文庫構(gòu)建
2 測(cè)序平臺(tái)
3 組裝拼接
4 數(shù)據(jù)分析軟件
5 SNP分析及進(jìn)化樹構(gòu)建
6 討論
7 展望



本文編號(hào)：3919778