結(jié)核分枝桿菌Rv3248c生物信息學分析及同源建模
發(fā)布時間:2023-03-22 19:36
運用生物信息學方法對結(jié)核分枝桿菌Rv3248c進行結(jié)構(gòu)功能分析及同源建模。通過NCBI、BLAST、ProtParam和Interproscan等生物信息學方法對Rv3248c進行同源性、理化性質(zhì)、保守序列、跨膜、信號肽二級結(jié)構(gòu)和三級結(jié)構(gòu)預(yù)測分析。結(jié)果顯示Rv3248c的氨基酸序列與腺苷高半胱氨酸水解酶高度一致,該蛋白包含495個氨基酸,沒有跨膜及信號肽結(jié)構(gòu),其二級結(jié)構(gòu)α螺旋占43%,無規(guī)則卷曲占41.8%,β折疊占15.2%,利用同源建模法構(gòu)建該蛋白的三級結(jié)構(gòu),并對該模型進行質(zhì)量評估。研究結(jié)果有望對結(jié)核病的診斷和治療提供參考。為進一步研究該蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)與功能打下基礎(chǔ)。
【文章頁數(shù)】:5 頁
【文章目錄】:
1 引言
2 實驗方法
2.1 同源性分析
2.2 理化性質(zhì)分析
2.3 保守序列分析
2.4 跨膜分析
2.5 信號肽分析
2.6 三級結(jié)構(gòu)預(yù)測
3 實驗結(jié)果
3.1 同源性分析結(jié)果
3.2 理化性質(zhì)分析結(jié)果
3.3 保守序列分析結(jié)果
3.4 跨膜分析結(jié)果
3.5 信號肽分析結(jié)果
3.6 二級結(jié)構(gòu)預(yù)測結(jié)果
3.7 三級結(jié)構(gòu)預(yù)測結(jié)果
4 結(jié)束語
本文編號:3767460
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1 引言
2 實驗方法
2.1 同源性分析
2.2 理化性質(zhì)分析
2.3 保守序列分析
2.4 跨膜分析
2.5 信號肽分析
2.6 三級結(jié)構(gòu)預(yù)測
3 實驗結(jié)果
3.1 同源性分析結(jié)果
3.2 理化性質(zhì)分析結(jié)果
3.3 保守序列分析結(jié)果
3.4 跨膜分析結(jié)果
3.5 信號肽分析結(jié)果
3.6 二級結(jié)構(gòu)預(yù)測結(jié)果
3.7 三級結(jié)構(gòu)預(yù)測結(jié)果
4 結(jié)束語
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