一起聚集性發(fā)熱疫情中柯薩奇病毒A組2型的鑒定及基因特征分析
發(fā)布時間:2022-01-01 12:42
腸道病毒(Enterovirus,EV)可以引起包括手足口病的全身各系統(tǒng)的病癥,柯薩奇病毒A組2型(Coxsackievirus A2,CV-A2)在世界范圍廣泛流行。我們對2018年北京市豐臺區(qū)一起聚集性發(fā)熱疫情進行病原學鑒定和基因特征分析,為該類疫情的防控提供實驗室支持。采集6例病例的咽拭子標本,進行EV實時熒光RTPCR檢測,結(jié)果顯示5份為EV陽性。使用人橫紋肌肉瘤細胞進行病毒分離,分離到4株EV,通過EV分支分型方法,確定這4株EV為CV-A2。4株CV-A2分離株的VP1區(qū)核苷酸序列和VP4區(qū)核苷酸序列相似性高達99.5%~100%,基因進化樹圖分析顯示,4株CV-A2與D基因型代表株處于同一分支,與2017年中國天津分離株MG926808核苷酸同源性最高,為99.1%~99.3%。根據(jù)以上結(jié)果,確定此次聚集性發(fā)熱疫情是由CV-A2感染引起,且屬于在我國流行的D基因型,提示我們在以后的工作應結(jié)合流行病學資料,加強對CV-A2的監(jiān)測。
【文章來源】:病毒學報. 2019,35(04)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:5 頁
【文章目錄】:
材料與方法
1標本來源
2標本初篩
3病毒分離和鑒定
4 VP1區(qū)和VP4區(qū)基因擴增
5序列分析
結(jié)果
1標本核酸檢測初篩
2病毒分離與鑒定
3 VP1編碼區(qū)和VP4編碼區(qū)核苷酸相似性分析
4進化分析
討論
【參考文獻】:
期刊論文
[1]柯薩奇病毒A組2型江蘇分離株(JS16-80)全基因組序列分析[J]. 楊倩,嚴冬梅,張勇,樊歡,嵇紅,冀天嬌,宋洋,許文波. 病毒學報. 2018(05)
[2]海淀區(qū)2012—2016年30起學校聚集性發(fā)熱疫情調(diào)查[J]. 邢彥,華偉玉,劉鋒,李婕. 海峽預防醫(yī)學雜志. 2018(01)
[3]2013-2015年上海市浦東新區(qū)聚集性發(fā)熱疫情分析[J]. 陳諏,王遠萍,徐紅梅,葉楚楚,朱渭萍. 實用預防醫(yī)學. 2017(05)
[4]2014-2016年柳州市重癥手足口病柯薩奇病毒A2型病毒株基因特征分析[J]. 黃萍,陳柳軍,余鈞池. 中國病毒病雜志. 2017(02)
[5]珠海市2013年手足口病患兒柯薩奇病毒A2型分離株基因特征分析[J]. 周蘭蘭,魏泉德,張麗榮,林毅雄,李紅霞,鄭予柯,沈韌. 中國病毒病雜志. 2015(02)
[6]2012年北京市豐臺區(qū)環(huán)境污水中腸道病毒監(jiān)測分析[J]. 尉秀霞,張勇,秦萌,孟志明,祝雙利,李曉嫘,楊軍勇,武晶,董曉根,許文波,李潔. 國際病毒學雜志. 2014 (05)
本文編號:3562308
【文章來源】:病毒學報. 2019,35(04)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:5 頁
【文章目錄】:
材料與方法
1標本來源
2標本初篩
3病毒分離和鑒定
4 VP1區(qū)和VP4區(qū)基因擴增
5序列分析
結(jié)果
1標本核酸檢測初篩
2病毒分離與鑒定
3 VP1編碼區(qū)和VP4編碼區(qū)核苷酸相似性分析
4進化分析
討論
【參考文獻】:
期刊論文
[1]柯薩奇病毒A組2型江蘇分離株(JS16-80)全基因組序列分析[J]. 楊倩,嚴冬梅,張勇,樊歡,嵇紅,冀天嬌,宋洋,許文波. 病毒學報. 2018(05)
[2]海淀區(qū)2012—2016年30起學校聚集性發(fā)熱疫情調(diào)查[J]. 邢彥,華偉玉,劉鋒,李婕. 海峽預防醫(yī)學雜志. 2018(01)
[3]2013-2015年上海市浦東新區(qū)聚集性發(fā)熱疫情分析[J]. 陳諏,王遠萍,徐紅梅,葉楚楚,朱渭萍. 實用預防醫(yī)學. 2017(05)
[4]2014-2016年柳州市重癥手足口病柯薩奇病毒A2型病毒株基因特征分析[J]. 黃萍,陳柳軍,余鈞池. 中國病毒病雜志. 2017(02)
[5]珠海市2013年手足口病患兒柯薩奇病毒A2型分離株基因特征分析[J]. 周蘭蘭,魏泉德,張麗榮,林毅雄,李紅霞,鄭予柯,沈韌. 中國病毒病雜志. 2015(02)
[6]2012年北京市豐臺區(qū)環(huán)境污水中腸道病毒監(jiān)測分析[J]. 尉秀霞,張勇,秦萌,孟志明,祝雙利,李曉嫘,楊軍勇,武晶,董曉根,許文波,李潔. 國際病毒學雜志. 2014 (05)
本文編號:3562308
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