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一起聚集性發(fā)熱疫情中柯薩奇病毒A組2型的鑒定及基因特征分析

發(fā)布時(shí)間:2022-01-01 12:42
  腸道病毒(Enterovirus,EV)可以引起包括手足口病的全身各系統(tǒng)的病癥,柯薩奇病毒A組2型(Coxsackievirus A2,CV-A2)在世界范圍廣泛流行。我們對(duì)2018年北京市豐臺(tái)區(qū)一起聚集性發(fā)熱疫情進(jìn)行病原學(xué)鑒定和基因特征分析,為該類疫情的防控提供實(shí)驗(yàn)室支持。采集6例病例的咽拭子標(biāo)本,進(jìn)行EV實(shí)時(shí)熒光RTPCR檢測,結(jié)果顯示5份為EV陽性。使用人橫紋肌肉瘤細(xì)胞進(jìn)行病毒分離,分離到4株EV,通過EV分支分型方法,確定這4株EV為CV-A2。4株CV-A2分離株的VP1區(qū)核苷酸序列和VP4區(qū)核苷酸序列相似性高達(dá)99.5%~100%,基因進(jìn)化樹圖分析顯示,4株CV-A2與D基因型代表株處于同一分支,與2017年中國天津分離株MG926808核苷酸同源性最高,為99.1%~99.3%。根據(jù)以上結(jié)果,確定此次聚集性發(fā)熱疫情是由CV-A2感染引起,且屬于在我國流行的D基因型,提示我們?cè)谝院蟮墓ぷ鲬?yīng)結(jié)合流行病學(xué)資料,加強(qiáng)對(duì)CV-A2的監(jiān)測。 

【文章來源】:病毒學(xué)報(bào). 2019,35(04)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】:5 頁

【文章目錄】:
材料與方法
    1標(biāo)本來源
    2標(biāo)本初篩
    3病毒分離和鑒定
    4 VP1區(qū)和VP4區(qū)基因擴(kuò)增
    5序列分析
結(jié)果
    1標(biāo)本核酸檢測初篩
    2病毒分離與鑒定
    3 VP1編碼區(qū)和VP4編碼區(qū)核苷酸相似性分析
    4進(jìn)化分析
討論


【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]柯薩奇病毒A組2型江蘇分離株(JS16-80)全基因組序列分析[J]. 楊倩,嚴(yán)冬梅,張勇,樊歡,嵇紅,冀天嬌,宋洋,許文波.  病毒學(xué)報(bào). 2018(05)
[2]海淀區(qū)2012—2016年30起學(xué)校聚集性發(fā)熱疫情調(diào)查[J]. 邢彥,華偉玉,劉鋒,李婕.  海峽預(yù)防醫(yī)學(xué)雜志. 2018(01)
[3]2013-2015年上海市浦東新區(qū)聚集性發(fā)熱疫情分析[J]. 陳諏,王遠(yuǎn)萍,徐紅梅,葉楚楚,朱渭萍.  實(shí)用預(yù)防醫(yī)學(xué). 2017(05)
[4]2014-2016年柳州市重癥手足口病柯薩奇病毒A2型病毒株基因特征分析[J]. 黃萍,陳柳軍,余鈞池.  中國病毒病雜志. 2017(02)
[5]珠海市2013年手足口病患兒柯薩奇病毒A2型分離株基因特征分析[J]. 周蘭蘭,魏泉德,張麗榮,林毅雄,李紅霞,鄭予柯,沈韌.  中國病毒病雜志. 2015(02)
[6]2012年北京市豐臺(tái)區(qū)環(huán)境污水中腸道病毒監(jiān)測分析[J]. 尉秀霞,張勇,秦萌,孟志明,祝雙利,李曉嫘,楊軍勇,武晶,董曉根,許文波,李潔.  國際病毒學(xué)雜志. 2014 (05)



本文編號(hào):3562308

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