中老年獼猴單個核細胞miRNA表達差異及其靶基因預測
發(fā)布時間:2021-12-29 20:55
目的研究中年與老年獼猴單個核細胞中miRNA表達差異,并預測其調(diào)控的靶基因。方法利用基于二代測序的miRNA測序方法 ,對中年和老年獼猴外周血中單個核細胞的miRNA進行測序,利用生物信息學方法對測序數(shù)據(jù)進行統(tǒng)計分析。結(jié)果中年與老年獼猴外周血單個核細胞的差異表達miRNA有55個,其中21個為已知miRNA,34個為新發(fā)現(xiàn)miRNA。已知miRNA中,有4個miRNA為上調(diào)表達,17個miRNA為下調(diào)表達。通過生物信息學分析預測發(fā)現(xiàn),已知差異miRNA的調(diào)控靶基因1634個,分別富集在35個KEGG信號通路上。結(jié)論發(fā)現(xiàn)中年和老年獼猴血單個核細胞差異表達的miRNA,并預測出其調(diào)控的靶基因。
【文章來源】:西南國防醫(yī)藥. 2019,29(06)
【文章頁數(shù)】:4 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 實驗動物
1.2 miRNA測序及數(shù)據(jù)預處理
1.3 miRNA的識別
1.4 miRNA差異分析
1.5 差異miRNA靶基因預測
1.6 預測靶基因GO和KEGG富集分析
2 結(jié)果
2.1 差異表達miRNA
2.2 差異miRNA的靶基因預測
2.3 靶基因GO分析
2.4 miRNA靶基因KEGG通路富集分析
3 討論
本文編號:3556855
【文章來源】:西南國防醫(yī)藥. 2019,29(06)
【文章頁數(shù)】:4 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 實驗動物
1.2 miRNA測序及數(shù)據(jù)預處理
1.3 miRNA的識別
1.4 miRNA差異分析
1.5 差異miRNA靶基因預測
1.6 預測靶基因GO和KEGG富集分析
2 結(jié)果
2.1 差異表達miRNA
2.2 差異miRNA的靶基因預測
2.3 靶基因GO分析
2.4 miRNA靶基因KEGG通路富集分析
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