人工噴泉中一株軍團(tuán)菌的系統(tǒng)遺傳學(xué)鑒定
發(fā)布時(shí)間:2021-12-24 11:21
目的檢測(cè)噴泉水中的1株軍團(tuán)菌并進(jìn)行分子生物學(xué)鑒定和系統(tǒng)發(fā)育分析。方法采集濰坊市一處人工噴泉水水樣,用細(xì)菌基因組試劑盒提取水樣中的總細(xì)菌基因組DNA,使用針對(duì)軍團(tuán)菌屬16S rRNA基因片段的特異性引物PCR擴(kuò)增軍團(tuán)菌屬16S rRNA基因片段并測(cè)序,與從GenBank獲得的另外41株軍團(tuán)菌的16S rRNA的基因序列進(jìn)行對(duì)比分析,采用PAUP*4.0b10軟件對(duì)16S rRNA基因片段序列數(shù)據(jù)矩陣進(jìn)行最大簡(jiǎn)約法分析并繪制基因進(jìn)化樹。結(jié)果 PCR擴(kuò)增噴泉水提取物中軍團(tuán)菌屬特異性16S rRNA基因片段,片段堿基數(shù)654 bp。測(cè)序分析該菌株(命名為WF-B)的16S rRNA基因序列與Legionella beliardensis 16S rRNA基因序列的遺傳距離較近,相似度達(dá)99.8%,在構(gòu)建的最大簡(jiǎn)約進(jìn)化樹中該菌與L.beliardensis以自檢值97%聚類為一枝。結(jié)論該噴泉水中檢出的軍團(tuán)菌WF-B與L.beliardensis的親緣關(guān)系較近,相關(guān)部門應(yīng)加強(qiáng)監(jiān)管力度,降低其感染風(fēng)險(xiǎn)。
【文章來源】:中國(guó)病原生物學(xué)雜志. 2019,14(05)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:4 頁
【文章目錄】:
材料與方法
1 樣品的采集和DNA提取
2 目的基因PCR 擴(kuò)增測(cè)序
3 序列分析
4 系統(tǒng)發(fā)育分析
結(jié) 果
1 16S rRNA基因PCR產(chǎn)物電泳鑒定
2 基于16S rRNA基因的序列分析
3 基于16S rRNA基因的系統(tǒng)發(fā)育分析
討 論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]長(zhǎng)白山地區(qū)蜱類和鼠類中查菲埃立克體感染調(diào)查及16S rRNA序列分析[J]. 王卓,吳瓊,楊慎江,馮立,張慶波,王秀紅,于淼,王峰,吳益民. 中國(guó)病原生物學(xué)雜志. 2017(10)
[2]濰坊地區(qū)人工噴泉中一株軍團(tuán)菌的分子生物學(xué)鑒定[J]. 楊斌斌,李恒,管艷,伊正君. 中國(guó)病原生物學(xué)雜志. 2017(05)
[3]嗜肺軍團(tuán)菌微滴式數(shù)字PCR檢測(cè)方法的建立[J]. 于紀(jì)棉,李如松,倪健波,魏姣姣,高峰,王建峰. 中國(guó)衛(wèi)生檢驗(yàn)雜志. 2017(09)
[4]16S rRNA基因高通量測(cè)序分析牛糞發(fā)酵細(xì)菌多樣性[J]. 滑留帥,王璟,徐照學(xué),張子敬,婁治國(guó),趙洪昌,李文軍,王二耀. 農(nóng)業(yè)工程學(xué)報(bào). 2016(S2)
[5]軍團(tuán)菌檢測(cè)方法概述[J]. 呂恒,張錦海,陳鳳娟,顧海濤,王平,王長(zhǎng)軍. 東南國(guó)防醫(yī)藥. 2014(02)
[6]PCR-酶切技術(shù)快速鑒定軍團(tuán)菌[J]. 趙利偉,胡朝暉,陳文聰,顧全,朱慶義. 微生物學(xué)通報(bào). 2013(08)
[7]16 S rRNA在細(xì)菌分類鑒定研究中的應(yīng)用[J]. 劉文強(qiáng),賈玉萍,趙宏坤. 動(dòng)物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2006(11)
碩士論文
[1]EMA-qPCR檢測(cè)公共場(chǎng)所氣溶膠中存活的嗜肺軍團(tuán)菌[D]. 劉航.中國(guó)疾病預(yù)防控制中心 2014
本文編號(hào):3550394
【文章來源】:中國(guó)病原生物學(xué)雜志. 2019,14(05)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:4 頁
【文章目錄】:
材料與方法
1 樣品的采集和DNA提取
2 目的基因PCR 擴(kuò)增測(cè)序
3 序列分析
4 系統(tǒng)發(fā)育分析
結(jié) 果
1 16S rRNA基因PCR產(chǎn)物電泳鑒定
2 基于16S rRNA基因的序列分析
3 基于16S rRNA基因的系統(tǒng)發(fā)育分析
討 論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]長(zhǎng)白山地區(qū)蜱類和鼠類中查菲埃立克體感染調(diào)查及16S rRNA序列分析[J]. 王卓,吳瓊,楊慎江,馮立,張慶波,王秀紅,于淼,王峰,吳益民. 中國(guó)病原生物學(xué)雜志. 2017(10)
[2]濰坊地區(qū)人工噴泉中一株軍團(tuán)菌的分子生物學(xué)鑒定[J]. 楊斌斌,李恒,管艷,伊正君. 中國(guó)病原生物學(xué)雜志. 2017(05)
[3]嗜肺軍團(tuán)菌微滴式數(shù)字PCR檢測(cè)方法的建立[J]. 于紀(jì)棉,李如松,倪健波,魏姣姣,高峰,王建峰. 中國(guó)衛(wèi)生檢驗(yàn)雜志. 2017(09)
[4]16S rRNA基因高通量測(cè)序分析牛糞發(fā)酵細(xì)菌多樣性[J]. 滑留帥,王璟,徐照學(xué),張子敬,婁治國(guó),趙洪昌,李文軍,王二耀. 農(nóng)業(yè)工程學(xué)報(bào). 2016(S2)
[5]軍團(tuán)菌檢測(cè)方法概述[J]. 呂恒,張錦海,陳鳳娟,顧海濤,王平,王長(zhǎng)軍. 東南國(guó)防醫(yī)藥. 2014(02)
[6]PCR-酶切技術(shù)快速鑒定軍團(tuán)菌[J]. 趙利偉,胡朝暉,陳文聰,顧全,朱慶義. 微生物學(xué)通報(bào). 2013(08)
[7]16 S rRNA在細(xì)菌分類鑒定研究中的應(yīng)用[J]. 劉文強(qiáng),賈玉萍,趙宏坤. 動(dòng)物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2006(11)
碩士論文
[1]EMA-qPCR檢測(cè)公共場(chǎng)所氣溶膠中存活的嗜肺軍團(tuán)菌[D]. 劉航.中國(guó)疾病預(yù)防控制中心 2014
本文編號(hào):3550394
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