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人工噴泉中一株軍團(tuán)菌的系統(tǒng)遺傳學(xué)鑒定

發(fā)布時間:2021-12-24 11:21
  目的檢測噴泉水中的1株軍團(tuán)菌并進(jìn)行分子生物學(xué)鑒定和系統(tǒng)發(fā)育分析。方法采集濰坊市一處人工噴泉水水樣,用細(xì)菌基因組試劑盒提取水樣中的總細(xì)菌基因組DNA,使用針對軍團(tuán)菌屬16S rRNA基因片段的特異性引物PCR擴(kuò)增軍團(tuán)菌屬16S rRNA基因片段并測序,與從GenBank獲得的另外41株軍團(tuán)菌的16S rRNA的基因序列進(jìn)行對比分析,采用PAUP*4.0b10軟件對16S rRNA基因片段序列數(shù)據(jù)矩陣進(jìn)行最大簡約法分析并繪制基因進(jìn)化樹。結(jié)果 PCR擴(kuò)增噴泉水提取物中軍團(tuán)菌屬特異性16S rRNA基因片段,片段堿基數(shù)654 bp。測序分析該菌株(命名為WF-B)的16S rRNA基因序列與Legionella beliardensis 16S rRNA基因序列的遺傳距離較近,相似度達(dá)99.8%,在構(gòu)建的最大簡約進(jìn)化樹中該菌與L.beliardensis以自檢值97%聚類為一枝。結(jié)論該噴泉水中檢出的軍團(tuán)菌WF-B與L.beliardensis的親緣關(guān)系較近,相關(guān)部門應(yīng)加強(qiáng)監(jiān)管力度,降低其感染風(fēng)險。 

【文章來源】:中國病原生物學(xué)雜志. 2019,14(05)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】:4 頁

【文章目錄】:
材料與方法
    1 樣品的采集和DNA提取
    2 目的基因PCR 擴(kuò)增測序
    3 序列分析
    4 系統(tǒng)發(fā)育分析
結(jié) 果
    1 16S rRNA基因PCR產(chǎn)物電泳鑒定
    2 基于16S rRNA基因的序列分析
    3 基于16S rRNA基因的系統(tǒng)發(fā)育分析
討 論


【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]長白山地區(qū)蜱類和鼠類中查菲埃立克體感染調(diào)查及16S rRNA序列分析[J]. 王卓,吳瓊,楊慎江,馮立,張慶波,王秀紅,于淼,王峰,吳益民.  中國病原生物學(xué)雜志. 2017(10)
[2]濰坊地區(qū)人工噴泉中一株軍團(tuán)菌的分子生物學(xué)鑒定[J]. 楊斌斌,李恒,管艷,伊正君.  中國病原生物學(xué)雜志. 2017(05)
[3]嗜肺軍團(tuán)菌微滴式數(shù)字PCR檢測方法的建立[J]. 于紀(jì)棉,李如松,倪健波,魏姣姣,高峰,王建峰.  中國衛(wèi)生檢驗(yàn)雜志. 2017(09)
[4]16S rRNA基因高通量測序分析牛糞發(fā)酵細(xì)菌多樣性[J]. 滑留帥,王璟,徐照學(xué),張子敬,婁治國,趙洪昌,李文軍,王二耀.  農(nóng)業(yè)工程學(xué)報. 2016(S2)
[5]軍團(tuán)菌檢測方法概述[J]. 呂恒,張錦海,陳鳳娟,顧海濤,王平,王長軍.  東南國防醫(yī)藥. 2014(02)
[6]PCR-酶切技術(shù)快速鑒定軍團(tuán)菌[J]. 趙利偉,胡朝暉,陳文聰,顧全,朱慶義.  微生物學(xué)通報. 2013(08)
[7]16 S rRNA在細(xì)菌分類鑒定研究中的應(yīng)用[J]. 劉文強(qiáng),賈玉萍,趙宏坤.  動物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2006(11)

碩士論文
[1]EMA-qPCR檢測公共場所氣溶膠中存活的嗜肺軍團(tuán)菌[D]. 劉航.中國疾病預(yù)防控制中心 2014



本文編號:3550394

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