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人CD34+造血干/祖細胞和日本血吸蟲的轉(zhuǎn)錄組學和蛋白質(zhì)組學研究

發(fā)布時間:2021-09-24 12:52
  本論文在楊芃原教授和韓澤廣研究員的指導下進行,主要工作在國家人類基因組南方研究中心完成。本博士論文的主要貢獻為:1.對人CD34+造血干/祖細胞進行了轉(zhuǎn)錄組和蛋白質(zhì)組學研究,鑒定了370個蛋白質(zhì),這是迄今為止鑒定最多的CD34+細胞蛋白,并且鑒定了各種轉(zhuǎn)錄組研究沒能發(fā)現(xiàn)的133個CD34+細胞蛋白,發(fā)現(xiàn)了CD34+細胞具有可塑性的新的證據(jù),證明了反義核酸未能完全阻止其相應(yīng)基因的表達,并提出一些蛋白的異質(zhì)性是由于翻譯后修飾造成;2.對日本血吸蟲進行了大規(guī)模轉(zhuǎn)錄組學和蛋白質(zhì)組學研究,得到了大量的重要發(fā)現(xiàn)。獲得了約15000個基因種類,約占日本血吸蟲基因總數(shù)的90%,其中包括8400多個血吸蟲基因編碼蛋白質(zhì),建立了目前世界上最大的日本血吸蟲功能基因組公共數(shù)據(jù)庫、基因克隆庫和菌種庫;鑒定了3260個不同生活周期的以及表皮的血吸蟲蛋白,并首次鑒定了卵殼蛋白,提供了眾多藥物靶點和潛在疫苗的選擇;在血吸蟲基因中發(fā)現(xiàn)了大量的遺傳多態(tài)性位點,并用序列測定和蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)驗證;分析得到了血吸蟲保守的和特異的蛋白,為認識血吸蟲生物學特征、開發(fā)抗血吸蟲藥物以及研制血吸蟲疫苗奠定了理論基礎(chǔ);3.鑒定并分析了純化后... 

【文章來源】:復(fù)旦大學上海市 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】:175 頁

【學位級別】:博士

【部分圖文】:

人CD34+造血干/祖細胞和日本血吸蟲的轉(zhuǎn)錄組學和蛋白質(zhì)組學研究


Ilses具有分化為多種血液細胞的潛力

圖譜,RNA酶,DNA酶,解決辦法


往往難以溶解,造成蛋白損失。解決辦法是,少量多次加入,結(jié)合超聲和煮沸,反復(fù)提取,在使用了DNA酶和RNA酶作用以及丙酮沉淀不談,圖IB的膠點更分散、更清晰。我們的多

譜圖,反相色譜


復(fù)旦大李博士格文消化時,我們也采用了獨特的方法。我們使用PCR儀做溫度反應(yīng)。一則PCR儀控溫準確,二則有熱蓋,避免長時間酶解中的水分蒸發(fā)。而且使用的是PCR管,體積小,管底為尖狀,樣品集中,而且管壁光滑減少樣品吸附損失,尤其當?shù)鞍啄z點很小的時候。Zintip去鹽。雖然理論上MALDI耐鹽,但ZIPtiP除鹽可以極大地改善譜圖質(zhì)量,因此該步不能省略。4.5難溶蛋白沉淀的處理丙酮沉淀后大部分蛋白可以溶解,少量蛋白難溶。在抽提組織蛋白時,也會遇到有部分蛋白難以溶解情況。為提高蛋白分析的覆蓋率,我們用含有高濃度SDS的蛋白電泳緩沖液,結(jié)合高溫和超聲波處理,盡量抽提沉淀中的難溶蛋白,再用一維SDS一隊GE分離,割條帶膠內(nèi)酶解后用在線反相色譜一質(zhì)譜分析(圖3)。


本文編號:3407786

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