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福壽螺感染廣州管圓線蟲后G型溶菌酶基因差異表達分析

發(fā)布時間:2021-06-24 21:52
  目的分析感染廣州管圓線蟲后福壽螺G型溶菌酶基因的組織表達特征。方法根據(jù)福壽螺G型溶菌酶基因序列,設(shè)計特異性引物, PCR擴增后進行測序,利用在線軟件ExPASy、 signalP 4.1、 TMHMM2.0、Smart、 MEGA7對其序列的基本生物學(xué)信息進行分析,并構(gòu)建系統(tǒng)進化樹。取含有廣州管圓線蟲Ⅰ期幼蟲的大鼠糞便喂食福壽螺,感染后24 h統(tǒng)一飼養(yǎng),分別于感染后1、 10、 20、 30 d各取3~5只福壽螺采集肝胰腺、腎臟、腸道、頭足和鰓組織,未感染的福壽螺為陰性對照組。提取各個感染時期福壽螺各組織總RNA,逆轉(zhuǎn)錄為cDNA,熒光定量PCR分析福壽螺G型溶菌酶mRNA的組織表達特征,設(shè)定對照組福壽螺各組織的G型溶菌酶m RNA的相對表達量為1.0±0.0。結(jié)果PCR擴增福壽螺G型溶菌酶基因片段,長度約為800 bp。測序結(jié)果顯示,為一段828 bp的完整開放讀碼框,編碼275個氨基酸。生物信息學(xué)分析結(jié)果顯示, G型溶菌酶基因編碼產(chǎn)物為穩(wěn)定的疏水性蛋白,在1~19位存在1個信號肽,主要在細胞外包括細胞壁發(fā)揮作用,在18~85位氨基酸處存在1個SH3b結(jié)構(gòu)域。系統(tǒng)進化樹分析顯示,福壽... 

【文章來源】:中國寄生蟲學(xué)與寄生蟲病雜志. 2019,37(03)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】:6 頁

【部分圖文】:

福壽螺感染廣州管圓線蟲后G型溶菌酶基因差異表達分析


福壽螺G型溶菌酶的氨基酸序列與其他物種序列的系統(tǒng)進化樹分析Fig.2PhylogenetictreeanalysisofP.canaliculateGtypelysozymesequencewithitshomologuesindifferentsnailsandfishes0.1096小管福壽螺Pomaceacanaliculata尖膀胱螺Physellaacuta(ADV36303.1)

氨基酸序列,福壽螺,溶菌酶基因,DNA標志


中國寄生蟲學(xué)與寄生蟲病雜志2019年6月第37卷第3期ChinJParasitolParasitDisJune2019,Vol.37,No.3圖2福壽螺G型溶菌酶的氨基酸序列與其他物種序列的系統(tǒng)進化樹分析Fig.2PhylogenetictreeanalysisofP.canaliculateGtypelysozymesequencewithitshomologuesindifferentsnailsandfishes0.1096100小管福壽螺Pomaceacanaliculata尖膀胱螺Physellaacuta(ADV36303.1)蝦夷扇貝Mizuhopectenyessoensis(AEY77130.1)櫛孔扇貝Azumapectenfarreri(ABB53641.1)膨腹海馬Hippocampusabdominalis(ART85744.1)塞內(nèi)加爾鰨Soleaseneqalensis(CCB84597.1)半滑舌鰨Cynoglossussemilaevis(NP001281118.1)卵形鯧鯵Trachinotusovatus(ANS12746.1)腔棘魚Latimeriamenadoensis(AHG59337.1)黃顙魚Tachysurusfulvidraco(ALD84262.1)草魚Ctenopharyngodonidella(ACF41165.1)鯽魚Carassiusauratus(AJY58045.1)97977934976996M:DNA標志物;1、2:福壽螺M:DNAmarker;1,2:P.canaliculata圖1福壽螺G型溶菌酶基因PCR擴增產(chǎn)物的電泳分析結(jié)果Fig.1AgarosegelelectrophoresisanalysisofamplifiedGtypelysozymecDNAfromP.canaliculataM12bp1200900700500300100的完整開放讀碼框,編碼275個氨基酸。利用在線軟件預(yù)測其相對分子質(zhì)量(Mr)為28910,等電點(PI)值為6.47,脂肪系數(shù)為73.85;合成目的蛋白的氨基酸共有20種,其中帶負電荷的氨基酸殘基(Asp+Glu)共有17個,帶正電荷的氨基酸殘基(Arg+Lys)共有13個;不穩(wěn)定系數(shù)為37.07,小于40,為穩(wěn)定蛋白,親水指數(shù)總平均為-0.12,說明該蛋白是疏水性蛋白。

序列,福壽螺,頭足,溶菌酶基因


中國寄生蟲學(xué)與寄生蟲病雜志2019年6月第37卷第3期ChinJParasitolParasitDisJune2019,Vol.37,No.310、20d低于對照組的(P<0.05),30d與對照組差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05);感染后1、10、20、30d腸道組織中表達量分別為0.280±0.040、0.070±0.030、0.039±0.002、0.120±0.050,各時期相對表達量均低于對照組(P<0.05);感染后1、10、20、30d頭足部組織中表達量分別為0.280±0.150、0.150±0.008、0.031±0.011、0.120±0.030,各時期相對表達量均低于對照組(P<0.05)(圖4)。3討論溶菌酶是一類具有殺菌免疫作用的功能分子,對于缺少特異性免疫的無脊椎動物來說,溶菌酶在機體的免疫體系中是非常重要的一個環(huán)節(jié)[11-12]。本研究基于本課題組對福壽螺感染廣州管圓線蟲后的轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)果,篩選出福壽螺G型溶菌酶基因序列,經(jīng)擴增測序得到一段828bp的完整開放讀碼框,含有275個氨基酸。預(yù)測的二級結(jié)構(gòu)中,α-螺旋和無規(guī)則卷曲含量較高,α-螺旋是蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)中最常見、最典型、含量也較為豐富的二級結(jié)構(gòu)元件,而無規(guī)則卷曲是構(gòu)成酶重要活性部位和蛋白質(zhì)特異功能部位的二級結(jié)構(gòu)元件[13]。福壽螺G型溶菌酶蛋白在1~19位存在一個信號肽,屬于分泌蛋白,結(jié)合亞細胞定位分析顯示,G型溶菌酶主要在細胞外包括細胞壁發(fā)揮作用,這也與G型溶菌酶的抗菌作用機制相符合。SH3b結(jié)構(gòu)域能夠識別富含脯氨酸和疏水殘基的蛋白質(zhì)并與之結(jié)合,介導(dǎo)蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)之間的相互作用,說明福壽螺的G型溶菌酶還參與了機體多種細胞內(nèi)的生化反應(yīng),包括細胞增殖、運動等。

【參考文獻】:
期刊論文
[1]入侵生物福壽螺抗逆性的研究進展[J]. 吳帆,李海云,趙鑫,章家恩,羅明珠.  生物安全學(xué)報. 2012(04)
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[6]三種淡水螺與廣州管圓線蟲相容性的實驗研究[J]. 呂山,張儀,王顯紅,劉和香,朱丹,殷位剛,周曉農(nóng).  中國寄生蟲學(xué)與寄生蟲病雜志. 2006(04)



本文編號:3247890

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