超廣譜β內(nèi)酰胺酶腸桿菌拮抗菌的鑒定及抑菌產(chǎn)物分析
發(fā)布時間:2021-06-23 01:16
本研究對從土壤中篩選出的超廣譜β內(nèi)酰胺酶腸桿菌的拮抗菌進行鑒定,并對其發(fā)酵產(chǎn)物抑菌效果進行研究。以分離到的污水中的15株產(chǎn)超廣譜β內(nèi)酰胺酶腸桿菌為測試菌株,土壤中分離到的1株拮抗菌為試驗菌株,通過點接種法、平板對峙法和發(fā)酵產(chǎn)物抑菌試驗測試試驗菌株對測試菌住的拮抗作用;通過16S r DNA PCR產(chǎn)物測序及生理生化反應(yīng)鑒定試驗菌株種屬;通過發(fā)酵產(chǎn)物氯仿粗提物薄層色譜分析試驗,結(jié)合細(xì)菌次級代謝產(chǎn)物基因簇預(yù)測在線分析,初步研究試驗菌株的抑菌成分。顯示試驗菌株鑒定為銅綠假單胞菌,對15株產(chǎn)超廣譜β內(nèi)酰胺酶腸桿菌均有拮抗作用,其發(fā)酵產(chǎn)物氯仿粗提物中組分之一具有明顯抑菌作用,次級代謝產(chǎn)物基因簇在線軟件分析推測該產(chǎn)物可能為Nrps、Bacteriocin、Phenazine、Siderophore、Hserlactone、Arylpolyene中的一種或幾種。本研究提示銅綠假單胞菌含有多種已知或未知次級代謝產(chǎn)物,為開發(fā)利用銅綠假單胞菌資源提供研究資料。
【文章來源】:基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2019,38(06)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:7 頁
【部分圖文】:
ESBLs腸桿菌的分離與純化
鶳A7菌株的相似率為100%,該菌株來源于臨床,基因組全長為6588339bp。以PA7作為參考菌株,從NCBI下載其全基因組序列(序列號:CP000744.1),上傳至antiSMASHBacteriaVersion4.0在線軟件分析預(yù)測后,預(yù)測其次級代謝產(chǎn)物基因簇共有11個,隸屬于7類基因簇:Nrps(非核糖體肽合成酶類)、Bacteriocin(細(xì)菌素類)、Phenazine(吩嗪類)、Siderophore(嗜鐵素類)、Hserlactone(內(nèi)脂類)、Arylpolyene(芳基多烯類)、Other(其它)。其中6個基因簇未知,與已知基因圖3拮抗菌株G199的鑒定注:A:G199菌在364nm紫外光下有熒光;B:G199菌株溶血現(xiàn)象;C:G199菌株革蘭氏染色;D:G199菌株在42℃正常生長Figure3IdentificationoftheantagoniststrainG199Note:A:FluorescenceofG199strainunder364nmUVlight;B:HemolysisphenomenonofG199strain;C:GramstainingresultofG199strain;D:G199straingrownormallyin42℃圖416SrDNAPCR產(chǎn)物鑒定注:M:DL2000DNAMarker;1:空白對照;2:G199菌株16SrDNAPCR產(chǎn)物Figure4Identificationof16SrDNAPCRproductionofG199strainNote:M:DL2000DNAMarker;1:Control;2:16SrDNAPCRproductionofG199strain圖2拮抗菌抑菌試驗注:A:點接種法測試199株細(xì)菌對R1的拮抗作用,箭頭所示為G199菌株對R1的拮抗作用;B:平板對峙法測試G199菌株對15株ESBLs的拮抗作用;C:G199菌株72h發(fā)酵產(chǎn)物對15株ESBLs的拮抗作用Figure2TheantibacterialtestsNote:A:Theantagonisticeffectof199strainsonR1wastestedbypointinoculation,andthearrowsshowedtheantagonismofG199toR1;B:TheantagonisticeffectsofG199onfifteenESBLs
ine(吩嗪類)、Siderophore(嗜鐵素類)、Hserlactone(內(nèi)脂類)、Arylpolyene(芳基多烯類)、Other(其它)。其中6個基因簇未知,與已知基因圖3拮抗菌株G199的鑒定注:A:G199菌在364nm紫外光下有熒光;B:G199菌株溶血現(xiàn)象;C:G199菌株革蘭氏染色;D:G199菌株在42℃正常生長Figure3IdentificationoftheantagoniststrainG199Note:A:FluorescenceofG199strainunder364nmUVlight;B:HemolysisphenomenonofG199strain;C:GramstainingresultofG199strain;D:G199straingrownormallyin42℃圖416SrDNAPCR產(chǎn)物鑒定注:M:DL2000DNAMarker;1:空白對照;2:G199菌株16SrDNAPCR產(chǎn)物Figure4Identificationof16SrDNAPCRproductionofG199strainNote:M:DL2000DNAMarker;1:Control;2:16SrDNAPCRproductionofG199strain圖2拮抗菌抑菌試驗注:A:點接種法測試199株細(xì)菌對R1的拮抗作用,箭頭所示為G199菌株對R1的拮抗作用;B:平板對峙法測試G199菌株對15株ESBLs的拮抗作用;C:G199菌株72h發(fā)酵產(chǎn)物對15株ESBLs的拮抗作用Figure2TheantibacterialtestsNote:A:Theantagonisticeffectof199strainsonR1wastestedbypointinoculation,andthearrowsshowedtheantagonismofG199toR1;B:TheantagonisticeffectsofG199onfifteenESBLsweretestedbyplateconfrontationmethod;C:TheantagonisticeffectsofG199strain72hfermentationproductonfifteenESBLs2642
本文編號:3243922
【文章來源】:基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2019,38(06)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:7 頁
【部分圖文】:
ESBLs腸桿菌的分離與純化
鶳A7菌株的相似率為100%,該菌株來源于臨床,基因組全長為6588339bp。以PA7作為參考菌株,從NCBI下載其全基因組序列(序列號:CP000744.1),上傳至antiSMASHBacteriaVersion4.0在線軟件分析預(yù)測后,預(yù)測其次級代謝產(chǎn)物基因簇共有11個,隸屬于7類基因簇:Nrps(非核糖體肽合成酶類)、Bacteriocin(細(xì)菌素類)、Phenazine(吩嗪類)、Siderophore(嗜鐵素類)、Hserlactone(內(nèi)脂類)、Arylpolyene(芳基多烯類)、Other(其它)。其中6個基因簇未知,與已知基因圖3拮抗菌株G199的鑒定注:A:G199菌在364nm紫外光下有熒光;B:G199菌株溶血現(xiàn)象;C:G199菌株革蘭氏染色;D:G199菌株在42℃正常生長Figure3IdentificationoftheantagoniststrainG199Note:A:FluorescenceofG199strainunder364nmUVlight;B:HemolysisphenomenonofG199strain;C:GramstainingresultofG199strain;D:G199straingrownormallyin42℃圖416SrDNAPCR產(chǎn)物鑒定注:M:DL2000DNAMarker;1:空白對照;2:G199菌株16SrDNAPCR產(chǎn)物Figure4Identificationof16SrDNAPCRproductionofG199strainNote:M:DL2000DNAMarker;1:Control;2:16SrDNAPCRproductionofG199strain圖2拮抗菌抑菌試驗注:A:點接種法測試199株細(xì)菌對R1的拮抗作用,箭頭所示為G199菌株對R1的拮抗作用;B:平板對峙法測試G199菌株對15株ESBLs的拮抗作用;C:G199菌株72h發(fā)酵產(chǎn)物對15株ESBLs的拮抗作用Figure2TheantibacterialtestsNote:A:Theantagonisticeffectof199strainsonR1wastestedbypointinoculation,andthearrowsshowedtheantagonismofG199toR1;B:TheantagonisticeffectsofG199onfifteenESBLs
ine(吩嗪類)、Siderophore(嗜鐵素類)、Hserlactone(內(nèi)脂類)、Arylpolyene(芳基多烯類)、Other(其它)。其中6個基因簇未知,與已知基因圖3拮抗菌株G199的鑒定注:A:G199菌在364nm紫外光下有熒光;B:G199菌株溶血現(xiàn)象;C:G199菌株革蘭氏染色;D:G199菌株在42℃正常生長Figure3IdentificationoftheantagoniststrainG199Note:A:FluorescenceofG199strainunder364nmUVlight;B:HemolysisphenomenonofG199strain;C:GramstainingresultofG199strain;D:G199straingrownormallyin42℃圖416SrDNAPCR產(chǎn)物鑒定注:M:DL2000DNAMarker;1:空白對照;2:G199菌株16SrDNAPCR產(chǎn)物Figure4Identificationof16SrDNAPCRproductionofG199strainNote:M:DL2000DNAMarker;1:Control;2:16SrDNAPCRproductionofG199strain圖2拮抗菌抑菌試驗注:A:點接種法測試199株細(xì)菌對R1的拮抗作用,箭頭所示為G199菌株對R1的拮抗作用;B:平板對峙法測試G199菌株對15株ESBLs的拮抗作用;C:G199菌株72h發(fā)酵產(chǎn)物對15株ESBLs的拮抗作用Figure2TheantibacterialtestsNote:A:Theantagonisticeffectof199strainsonR1wastestedbypointinoculation,andthearrowsshowedtheantagonismofG199toR1;B:TheantagonisticeffectsofG199onfifteenESBLsweretestedbyplateconfrontationmethod;C:TheantagonisticeffectsofG199strain72hfermentationproductonfifteenESBLs2642
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