1.從16S rRNA限定性酶切片段多樣性上考察北里屬(Kitasatosporia)的分類 2.放線菌KO-7132的
發(fā)布時間:2021-04-11 20:51
傳統(tǒng)的放線菌分類和鑒定采用表型特征分析的方法進(jìn)行,這種分析往往不能得出肯定的結(jié)論,有時甚至?xí)贸鲥e誤的結(jié)論。近些年來隨著分子生物技術(shù)的發(fā)展及廣泛應(yīng)用,采用微生物的遺傳信息16S rRNA或基因組DNA等遺傳特征進(jìn)行分子水平的分類和鑒定研究,使得微生物分類鑒別的結(jié)果更可靠和精確。 放線菌北里屬(Kitasatosporia)菌是日本國北里研究所1982年發(fā)現(xiàn)和命名的。近年來有人提出北里屬菌應(yīng)化歸為鏈霉屬里的一個新種。為了從DNA分子水平上考察放線菌北里屬(Kitasatosporia)菌株和鏈霉屬(Streptomyces)菌株,驗證其以前依據(jù)表型特征分類的正確性,我們采用PCR反應(yīng)從菌株的基因組DNA中擴(kuò)增出幾乎全部的16S rRNA基因,并用幾種內(nèi)切酶進(jìn)行酶切,電泳分析比較它們的異同。研究表明,PCR反應(yīng)擴(kuò)增出的約1500bp長度的16S rRNA基因經(jīng)內(nèi)切酶Mbo Ⅰ消化,北里屬(Kitasatosporia)菌株產(chǎn)生獨特的135bp和480bp兩個片段,經(jīng)內(nèi)切酶EcoT 14Ⅰ消化,北里屬菌株產(chǎn)生獨特的120bp和150bp的片段,這些片段不能在鏈霉屬菌株中檢測到;谶@些...
【文章來源】:北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院北京市 211工程院校 985工程院校
【文章頁數(shù)】:84 頁
【學(xué)位級別】:博士
【部分圖文】:
Kitasatosporia屬和Streptomyees屬菌株的Mbol酶切圖譜
Kitasatosporia屬和streptomyees屬菌株的EeoT141酶切圖譜
圖6.Anazi使用RAPO法的反應(yīng)條件及一些鏈霉菌菌株的RAPD分析譜(PrimerR28:5,一ATGGATCCGC1.5.lavendulaeIFO3125;2.5,lavendulaeIFO5.lavendulaeIFO3361;4.5.lvaendulaeIFO12340;5.5.lavendulaeIFO12341;6.5.IFO12343;7.5.lvaendulaeIFO12344;8.s.lvaendulaeIFO13710;9.5.lvaendulaeI10.5.lvaendulaeIFO13709;11.5.lvaendulaeIFO12789;12.5.virginiaeJCM5.virginiaeIFO3392;14.5.virginiaeIFO3729:15.5.virginiaeATCC13013;16.ATCC13161:17.5.virginiaeATCC15894:18.S.VirginiaeIFO12827:M.PHYmark一DNA,b1590bPDNA)RAPD方法盡管有上述各種優(yōu)點,但具體時實踐起來仍有其一定的因為影響反應(yīng)的因素很多,有些時候再現(xiàn)性難以重復(fù)。原則上引物可但對某些模板DNA來說,有些引物不能得到PCR擴(kuò)增片段,這可能DNA聚合酶種類有關(guān)。Mehling用RAPD法鑒定鏈霉菌5.bikininensis.,,
本文編號:3131939
【文章來源】:北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院北京市 211工程院校 985工程院校
【文章頁數(shù)】:84 頁
【學(xué)位級別】:博士
【部分圖文】:
Kitasatosporia屬和Streptomyees屬菌株的Mbol酶切圖譜
Kitasatosporia屬和streptomyees屬菌株的EeoT141酶切圖譜
圖6.Anazi使用RAPO法的反應(yīng)條件及一些鏈霉菌菌株的RAPD分析譜(PrimerR28:5,一ATGGATCCGC1.5.lavendulaeIFO3125;2.5,lavendulaeIFO5.lavendulaeIFO3361;4.5.lvaendulaeIFO12340;5.5.lavendulaeIFO12341;6.5.IFO12343;7.5.lvaendulaeIFO12344;8.s.lvaendulaeIFO13710;9.5.lvaendulaeI10.5.lvaendulaeIFO13709;11.5.lvaendulaeIFO12789;12.5.virginiaeJCM5.virginiaeIFO3392;14.5.virginiaeIFO3729:15.5.virginiaeATCC13013;16.ATCC13161:17.5.virginiaeATCC15894:18.S.VirginiaeIFO12827:M.PHYmark一DNA,b1590bPDNA)RAPD方法盡管有上述各種優(yōu)點,但具體時實踐起來仍有其一定的因為影響反應(yīng)的因素很多,有些時候再現(xiàn)性難以重復(fù)。原則上引物可但對某些模板DNA來說,有些引物不能得到PCR擴(kuò)增片段,這可能DNA聚合酶種類有關(guān)。Mehling用RAPD法鑒定鏈霉菌5.bikininensis.,,
本文編號:3131939
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