發(fā)布時間：2021-03-11 21:28

　　本文報道了第二次全國HIV-1分子流調（2001-2002）主要流行重組株B′／C Tat基因第一外顯子的序列特征。并把此次分子流調中的CRF07-BC Tat基因第一外顯子變異情況與第一次全國分子流調（1996—1998）的CRF07-BC Tat基因第一外顯子變異情況作了比較，同時用真核表達系統(tǒng)對CRF07-BC Tat基因第一外顯子和其相應的LTR的相互作用進行了比較研究。 一．中國HIV-1主要流行重組株B′／C Tat基因第一外顯子序列特征分析 經(jīng)PCR擴增和測序共得到我國HIV-1 B′／C亞型Tat序列154條，其中CRF07-BC為120份，CRF08-BC為34份，兩種亞型廣泛分布在我國多個省市。兩種類型重組株第一外顯子氨基酸序列的差異主要為半胱氨酸富含區(qū)和核心區(qū)的變化。 二．兩次全國HIV分子流行病學調查CRF07-BC重組株Tat基因變異特征分析 第二次全國HIV分子流行病學調查中CRF07-BC Tat基因第一外顯子主要氨基酸變化表現(xiàn)在Tat蛋白的第7、10、39、57位點。其中第10位氨基酸的出現(xiàn)頻率在第二次流調中已經(jīng)出現(xiàn)明顯變化，Se... 

【文章來源】：福建師范大學福建省

【文章頁數(shù)】：75 頁

【學位級別】：碩士

【文章目錄】：
內容提要
Abstract
序言
第一部分 文獻綜述
    1 Tat及其編碼的Tat蛋白的結構
    2 Tat對HIV增殖過程中轉錄的作用
        2.1 TAR RNA
        2.2 TAKs
        2.3 組氨酸乙酰轉移酶
第二部分 材料與方法
    1 實驗材料
        1.1 標本來源
        1.2 菌種和質粒
        1.3 主要試劑與工具酶
        1.4 主要儀器
        1.5 常見溶液配制
        1.6 PCR引物
        1.7 主要生物軟件和互連網(wǎng)網(wǎng)上分析工具
    2 實驗方法
        2.1 中國HIV-1主要流行B′／C重組株Tat基因第一外顯子序列特征分析
        2.2 CRF07-BC重組株Tat基因第一外顯子突變對功能影響分析
第三部分 結果與分析
    1 中國HIV-1主要流行B，／C重組株Tat基因第一外顯子序列特征分析
        1.1 nested-PCR擴增結果
        1.2 基因序列測定
        1.3 中國HIV-1主要流行重組株樣本來源、亞型及數(shù)量統(tǒng)計
        1.4 基因距離分析
        1.5 系統(tǒng)樹分析
        1.6 重組方式分析
        1.7 共享序列分析
        1.8 氨基酸變化情況分析
        1.9 共享序列三維結構預測分析
    2 兩次全國HIV分子流調CRF07-BC重組株Tat基因變異特征分析
    3 CRF07-BC重組株Tat基因第一外顯子突變對功能影響分析
        3.1 Tat基因第一外顯子及LTR基因的擴增
        3.2 Tat基因第一外顯子及LTR基因的克隆
        3.3 質粒轉染及熒光素酶活性的檢測
第四部分 小結與討論
參考文獻
中文摘要
附錄1 全國第二次流調部分HIV-l CRF07-BC Tat蛋白序列
附錄2 全國第二次流調部分HIV-1 CRFOB-BC Tat蛋白序列
附錄3 在學期間發(fā)表和完成的論文
致謝



本文編號：3077123