2013—2018年中國H7N9流感病毒HA與NA進(jìn)化研究
發(fā)布時間:2021-01-26 01:11
目的研究2013—2018年中國H7N9流感病毒HA與NA進(jìn)化研究。方法通過收集NCBI網(wǎng)站HA與NA序列數(shù)據(jù),對各年份篩選出序列進(jìn)行進(jìn)化分析、關(guān)鍵位點(diǎn)分析,糖基化位點(diǎn)分析。結(jié)果 H7N9流感病毒HA與NA序列中韓與美國形成兩大分支。韓國與中國形成并列分支。2013—2018年間遺傳距離增加,同源性遞減。所有中國株缺失69~73位缺失"QISNT"。NA糖基化位點(diǎn)42~45位,關(guān)鍵位點(diǎn)193有突變。HA抗原決定簇148位點(diǎn),182和183位點(diǎn)有變異,關(guān)鍵位點(diǎn)186和134有突變。結(jié)論中國H7N9流感病毒HA與NA序列正在變遷,部分關(guān)鍵位點(diǎn)已經(jīng)發(fā)生突變,可能會改變病毒的致病特征。
【文章來源】:公共衛(wèi)生與預(yù)防醫(yī)學(xué). 2019,30(03)
【文章頁數(shù)】:6 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 數(shù)據(jù)來源
1.2 方法
1.2.1 軟件
1.2.2 方法
1.2.3 系統(tǒng)進(jìn)化分析
1.2.4 糖基化位點(diǎn)預(yù)測
2 結(jié)果
2.1 同源性分析
2.2 HA系統(tǒng)進(jìn)化分析
2.3 NA系統(tǒng)進(jìn)化分析
2.4 HA關(guān)鍵位點(diǎn)分析
2.5 NA關(guān)鍵位點(diǎn)分析
2.6 HA抗原決定簇位點(diǎn)分析
2.7 糖基化位點(diǎn)分析
3 討論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]2015—2016年湖北省人感染H7N9禽流感病例流行病學(xué)特征與防控實(shí)踐[J]. 劉紅慧,劉力,黃丹欽,劉漫,邢學(xué)森. 公共衛(wèi)生與預(yù)防醫(yī)學(xué). 2017(04)
[2]H7N9禽流感及相關(guān)疫情分析評估[J]. 林丹,謝劍鋒,嚴(yán)延生. 中國人獸共患病學(xué)報. 2017(03)
[3]2013-2014年全國人感染H7N9禽流感疫情媒體信息搜索分析[J]. 劉紅慧,吳楊,黃丹欽,陳琦,邢學(xué)森. 公共衛(wèi)生與預(yù)防醫(yī)學(xué). 2015(06)
[4]兩株人H7N9禽流感病毒的全基因組測序及分子特征分析[J]. 郭曉蘭,司露露,管大偉,王穎,于玉鳳,方丹云,武婕,江麗芳. 中山大學(xué)學(xué)報(醫(yī)學(xué)科學(xué)版). 2015(02)
[5]H7N9禽流感病毒對人類致病的分子基礎(chǔ)分析[J]. 于玉鳳,郭曉蘭,王穎,周俊梅,方丹云,曾谷城,晏輝鈞,江麗芳. 中山大學(xué)學(xué)報(醫(yī)學(xué)科學(xué)版). 2013(05)
[6]神經(jīng)氨酸酶莖部氨基酸缺失對H5N1亞型禽流感病毒生物學(xué)特性的影響[J]. 王曲直,龍進(jìn)學(xué),胡順林,吳艷濤,劉秀梵. 微生物學(xué)報. 2006(04)
本文編號:3000216
【文章來源】:公共衛(wèi)生與預(yù)防醫(yī)學(xué). 2019,30(03)
【文章頁數(shù)】:6 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 數(shù)據(jù)來源
1.2 方法
1.2.1 軟件
1.2.2 方法
1.2.3 系統(tǒng)進(jìn)化分析
1.2.4 糖基化位點(diǎn)預(yù)測
2 結(jié)果
2.1 同源性分析
2.2 HA系統(tǒng)進(jìn)化分析
2.3 NA系統(tǒng)進(jìn)化分析
2.4 HA關(guān)鍵位點(diǎn)分析
2.5 NA關(guān)鍵位點(diǎn)分析
2.6 HA抗原決定簇位點(diǎn)分析
2.7 糖基化位點(diǎn)分析
3 討論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]2015—2016年湖北省人感染H7N9禽流感病例流行病學(xué)特征與防控實(shí)踐[J]. 劉紅慧,劉力,黃丹欽,劉漫,邢學(xué)森. 公共衛(wèi)生與預(yù)防醫(yī)學(xué). 2017(04)
[2]H7N9禽流感及相關(guān)疫情分析評估[J]. 林丹,謝劍鋒,嚴(yán)延生. 中國人獸共患病學(xué)報. 2017(03)
[3]2013-2014年全國人感染H7N9禽流感疫情媒體信息搜索分析[J]. 劉紅慧,吳楊,黃丹欽,陳琦,邢學(xué)森. 公共衛(wèi)生與預(yù)防醫(yī)學(xué). 2015(06)
[4]兩株人H7N9禽流感病毒的全基因組測序及分子特征分析[J]. 郭曉蘭,司露露,管大偉,王穎,于玉鳳,方丹云,武婕,江麗芳. 中山大學(xué)學(xué)報(醫(yī)學(xué)科學(xué)版). 2015(02)
[5]H7N9禽流感病毒對人類致病的分子基礎(chǔ)分析[J]. 于玉鳳,郭曉蘭,王穎,周俊梅,方丹云,曾谷城,晏輝鈞,江麗芳. 中山大學(xué)學(xué)報(醫(yī)學(xué)科學(xué)版). 2013(05)
[6]神經(jīng)氨酸酶莖部氨基酸缺失對H5N1亞型禽流感病毒生物學(xué)特性的影響[J]. 王曲直,龍進(jìn)學(xué),胡順林,吳艷濤,劉秀梵. 微生物學(xué)報. 2006(04)
本文編號:3000216
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