目的:探討運(yùn)用DNA條形碼標(biāo)準(zhǔn)序列進(jìn)行鄱陽湖流域并殖吸蟲宿主動物華溪蟹屬淡水蟹類分類鑒定的可行性,為淡水蟹分類鑒定提供一個(gè)標(biāo)準(zhǔn)化的分子分類參照模式。方法:根據(jù)不同取材部位對DNA提取效果的影響,優(yōu)化華溪蟹屬淡水蟹類DNA的提取。根據(jù)華溪蟹屬物種間地理分布、生境模式的差異性,選取分布于鄱陽湖流域的福建華溪蟹（Sinopotamon fukienense）、萬載華溪蟹（S.wanzaiense）、修水華溪蟹（S.xiushuiense）、斜緣華溪蟹（S.obliquum）、蘭氏華溪蟹（S.lansi）以及資溪華溪蟹（S.zixiense）6個(gè)代表性物種,采用線粒體COI、16S r DNA基因片段以及核基因片段ITS2作為分子標(biāo)記,結(jié)合Gen Bank數(shù)據(jù)庫中同屬序列片段,經(jīng)DNA提取、引物篩選、PCR擴(kuò)增、產(chǎn)物純化測序及測序數(shù)據(jù)處理和分析,在計(jì)算得到的遺傳距離和所構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)生樹基礎(chǔ)上進(jìn)行華溪蟹DNA條形碼標(biāo)準(zhǔn)基因的選擇。結(jié)果:使用試劑盒法提取華溪蟹屬淡水蟹類步足肌肉,DNA提取濃度可達(dá)30 ng/μL,DNA提取效果穩(wěn)定可靠。在本實(shí)驗(yàn)涉及的淡水蟹類個(gè)體及類群的識別上,選擇16S r DN... 

【文章來源】：南昌大學(xué)江西省 211工程院校

【文章頁數(shù)】：62 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
ABSTRACT
第1章 引言
    1.1 鄱陽湖流域的界定及其自然地理
    1.2 鄱陽湖流域淡水蟹類與作為并殖吸蟲第二中間宿主物種的研究概況
        1.2.1 鄱陽湖流域淡水蟹類的研究
        1.2.2 作為并殖吸蟲第二中間宿主淡水蟹類的研究（表 1.1）
        1.2.3 鄱陽湖流域華溪蟹屬淡水蟹類的種名記述與地理分布
    1.3 淡水蟹類的形態(tài)學(xué)分類與分子標(biāo)記及系統(tǒng)發(fā)育研究
        1.3.1 淡水蟹類的形態(tài)學(xué)分類研究
        1.3.2 淡水蟹類的分子標(biāo)記及系統(tǒng)發(fā)育研究
    1.4 華溪蟹屬淡水蟹類在分類上面臨的主要問題
        1.4.1 形態(tài)學(xué)分類上的難點(diǎn)
        1.4.2 DNA條形碼分類研究
    1.5 DNA條形碼研究概況
        1.5.1 DNA條形碼的提出與發(fā)展
        1.5.2 DNA條形碼研究的現(xiàn)狀
        1.5.3 DNA條形碼存在的爭議
    1.6 開展本項(xiàng)探索性實(shí)驗(yàn)研究的必要性及其意義
第2章 材料和方法
    2.1 實(shí)驗(yàn)材料
        2.1.1 樣本采集、保存與形態(tài)學(xué)鑒定
        2.1.2 主要實(shí)驗(yàn)儀器和試劑
    2.2 實(shí)驗(yàn)方法
        2.2.1 組織DNA的提取
        2.2.2 引物篩選
        2.2.3 PCR擴(kuò)增
第3章 華溪蟹DNA條形碼構(gòu)建
    3.1 DNA條形碼標(biāo)準(zhǔn)基因的篩選
    3.2 數(shù)據(jù)處理
    3.3 華溪蟹DNA條形碼分析
        3.3.1 BLAST同源性比對
        3.3.2 SeqMan軟件整理、對齊序列
        3.3.3 堿基組成與變異位點(diǎn)
        3.3.4 遺傳距離
        3.3.5 NJ法構(gòu)建分支樹
第4章 結(jié)果與結(jié)論
第5章 展望
致謝
參考文獻(xiàn)
攻讀學(xué)位期間的研究成果
綜述
    參考文獻(xiàn)



本文編號：2990312