目的對(duì)分析葡萄球菌基因組中CRISPR-Cas系統(tǒng)基因結(jié)構(gòu),探討其與細(xì)菌耐藥性之間的關(guān)系。方法 CRISPRdb數(shù)據(jù)庫中公布的154株及NCBI中下載的171株葡萄球菌基因組共包含20個(gè)種,利用生物信息學(xué)方法分析CRISPR分布情況、重復(fù)序列、間隔序列、cas基因及CRISPR存在與細(xì)菌mecA基因之間的關(guān)系。結(jié)果 325株葡萄球菌基因組中共發(fā)現(xiàn)196個(gè)確定的CRISPR結(jié)構(gòu)和1757個(gè)可疑的CRISPR結(jié)構(gòu);有25株含有cas基因簇,可分為Ⅲ-A(占48.1%)和Ⅱ-C(占51.9%)兩型;確定CRISPR陣列中重復(fù)序列數(shù)大多數(shù)為2,有14種重復(fù)序列可以形成莖環(huán)結(jié)構(gòu),遺傳進(jìn)化分析顯示其大致可以分為3類。確定CRISPR陣列中437種間隔序列有53種匹配質(zhì)�；蚴删w,部分序列同時(shí)匹配多個(gè)質(zhì)粒或噬菌體。cas基因簇存在和不存在時(shí)的mecA攜帶率分別為28.00%和54.15%,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ~2=6.37,P0.05),兩者呈負(fù)相關(guān)。結(jié)論葡萄球菌基因組中CRISPR-Cas系統(tǒng)攜帶率低,且基因座、cas基因的結(jié)構(gòu)和功能均不完善,僅較少的菌株中含有完整的CRISPR-Cas系統(tǒng),基因座中可疑結(jié)構(gòu)較多,且DRs和spacer數(shù)量低于其他細(xì)菌。完整的葡萄球菌CRISPR-Cas系統(tǒng)可能限制mecA基因的水平轉(zhuǎn)移。
【部分圖文】：

圖１葡萄球菌ＣＲＩＳＰＲ－Ｃａｓ系統(tǒng)結(jié)構(gòu)圖Ｆｉｇ．１ＴｈｅｇｅｎｅｉｃｓｔｒｕｃｔｕｒｅｏｆＳｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓＣＲＩＳＰＲ－Ｃａｓｓｙｓｔｅｍ圖２基于葡萄球菌ｃａｓ１基因構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹Ｆｉｇ．２ＴｈｅｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃｔｒｅｅｏｆＳｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓｂａｓｅｏｎｃａｓ１ｓｅｑｕｅｎｃｅ·６５５·中國(guó)病原生物學(xué)雜志ＪｏｕｒｎａｌｏｆＰａｔｈｏｇｅｎＢｉｏｌｏｇｙ２０１９年５月第１４卷第５期Ｍａｙ．２０１９，Ｖｏｌ．１４，Ｎｏ．５
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8 劉純杰;葡萄球菌的分類與分型研究進(jìn)展[J];肉品衛(wèi)生;1996年06期

9 АкаmовА К;錢伯欽;;葡萄球菌分類的現(xiàn)代概念[J];國(guó)外醫(yī)學(xué)(微生物學(xué)分冊(cè));1981年02期

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