發(fā)布時間：2020-10-16 12:38

　　 目的對分析葡萄球菌基因組中CRISPR-Cas系統(tǒng)基因結(jié)構(gòu),探討其與細菌耐藥性之間的關(guān)系。方法 CRISPRdb數(shù)據(jù)庫中公布的154株及NCBI中下載的171株葡萄球菌基因組共包含20個種,利用生物信息學(xué)方法分析CRISPR分布情況、重復(fù)序列、間隔序列、cas基因及CRISPR存在與細菌mecA基因之間的關(guān)系。結(jié)果 325株葡萄球菌基因組中共發(fā)現(xiàn)196個確定的CRISPR結(jié)構(gòu)和1757個可疑的CRISPR結(jié)構(gòu);有25株含有cas基因簇,可分為Ⅲ-A(占48.1%)和Ⅱ-C(占51.9%)兩型;確定CRISPR陣列中重復(fù)序列數(shù)大多數(shù)為2,有14種重復(fù)序列可以形成莖環(huán)結(jié)構(gòu),遺傳進化分析顯示其大致可以分為3類。確定CRISPR陣列中437種間隔序列有53種匹配質(zhì)�；蚴删w,部分序列同時匹配多個質(zhì)�；蚴删w。cas基因簇存在和不存在時的mecA攜帶率分別為28.00%和54.15%,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(χ~2=6.37,P0.05),兩者呈負相關(guān)。結(jié)論葡萄球菌基因組中CRISPR-Cas系統(tǒng)攜帶率低,且基因座、cas基因的結(jié)構(gòu)和功能均不完善,僅較少的菌株中含有完整的CRISPR-Cas系統(tǒng),基因座中可疑結(jié)構(gòu)較多,且DRs和spacer數(shù)量低于其他細菌。完整的葡萄球菌CRISPR-Cas系統(tǒng)可能限制mecA基因的水平轉(zhuǎn)移。
【部分圖文】：

圖１葡萄球菌ＣＲＩＳＰＲ－Ｃａｓ系統(tǒng)結(jié)構(gòu)圖Ｆｉｇ．１ＴｈｅｇｅｎｅｉｃｓｔｒｕｃｔｕｒｅｏｆＳｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓＣＲＩＳＰＲ－Ｃａｓｓｙｓｔｅｍ圖２基于葡萄球菌ｃａｓ１基因構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹Ｆｉｇ．２ＴｈｅｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃｔｒｅｅｏｆＳｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓｂａｓｅｏｎｃａｓ１ｓｅｑｕｅｎｃｅ·６５５·中國病原生物學(xué)雜志ＪｏｕｒｎａｌｏｆＰａｔｈｏｇｅｎＢｉｏｌｏｇｙ２０１９年５月第１４卷第５期Ｍａｙ．２０１９，Ｖｏｌ．１４，Ｎｏ．５
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2 AkaTob AK;桂海泉;;對目前葡萄球菌分類的補充意見[J];國外醫(yī)學(xué)(微生物學(xué)分冊);1990年02期

3 李兆杰;王靜;隋濤;宋曉華;劉玉敏;崔鳳杰;楊麗君;;傅立葉變換紅外光譜技術(shù)對2種葡萄球菌的快速分類鑒定[J];安徽農(nóng)業(yè)科學(xué);2012年27期

4 盛相鵬;杜崇濤;許會會;顧敬敏;雷連成;韓文瑜;;倉鼠源緩慢葡萄球菌的分離鑒定及生物學(xué)特性研究[J];動物醫(yī)學(xué)進展;2010年07期

5 張邦燮;朱德鐘;;標記葡萄球菌A蛋白研究的進展[J];國外醫(yī)學(xué).臨床生物化學(xué)與檢驗學(xué)分冊;1981年04期

6 吳燕;伍素華;羅向東;蘇踴躍;陳曉玲;陳渝;;重組溶葡萄球菌蛋白的原核表達、純化及生物學(xué)活性研究[J];第三軍醫(yī)大學(xué)學(xué)報;2007年11期

7 韋惠如，覃錦耀;兩種葡萄球菌的感染率和耐藥率的調(diào)查[J];廣西醫(yī)科大學(xué)學(xué)報;1996年01期

8 劉純杰;葡萄球菌的分類與分型研究進展[J];肉品衛(wèi)生;1996年06期

9 АкаmовА К;錢伯欽;;葡萄球菌分類的現(xiàn)代概念[J];國外醫(yī)學(xué)(微生物學(xué)分冊);1981年02期

10 肖家祁;;用葡萄球菌A蛋白作為表面吸附劑來分離淋巴細胞的方法[J];國外醫(yī)學(xué)(免疫學(xué)分冊);1980年06期

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