廣西、云南、湖南三地釘螺親緣關(guān)系的研究
發(fā)布時(shí)間:2018-05-11 20:04
本文選題:釘螺 + 基因差異 ; 參考:《廣西醫(yī)科大學(xué)》2005年碩士論文
【摘要】:目的:分析廣西靖西、云南洱源和湖南岳陽三地釘螺的基因差異,揭示廣西靖西釘螺與其它兩地釘螺的親緣關(guān)系,為探討廣西釘螺來源提供科學(xué)依據(jù)。 方法:采集廣西靖西、云南洱源和湖南岳陽三地釘螺,分別提取釘螺基因組DNA,PCR 擴(kuò)增線粒體DNA(mtDNA)的細(xì)胞色素C 氧化酶Ⅰ(COⅠ)和細(xì)胞色素b(Cytb)基因并測序。應(yīng)用Pairwise Blast 軟件比較序列的同源性。以Genebank 登錄的光滑雙臍螺Biomphalaria glabrata(NC_005439)mtDNA的COⅠ、Cytb 序列為種外參照,應(yīng)用Clustal W(1.82)軟件對釘螺COⅠ、Cytb基因序列進(jìn)行排列比較。Kimura雙參數(shù)法計(jì)算遺傳距離。應(yīng)用PHYLIP(2000)和MEGA(2.1)軟件,用非加權(quán)組平均法(UPGMA)和最大簡約法(MP)構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)生樹。并且與Genebank 已知的釘螺COⅠ基因序列進(jìn)行對照比較。同時(shí)收集廣西、湖南和云南三地釘螺的分布情況、釘螺孳生地和古地理等資料,從流行病學(xué)、地理學(xué)的宏觀角度與分子生物學(xué)的微觀角度進(jìn)行綜合分析。 結(jié)果:三地釘螺COⅠ、Cytb 基因序列的比較結(jié)果和所構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)生樹顯示:廣西靖西與湖南岳陽釘螺COⅠ基因的同源性為94%,遺傳距離為0.051;Cytb 基因的同源性為97%,遺傳距離為0.031。廣西靖西與云南洱源釘螺COⅠ基因的同源性為86%,遺傳距離為0.158;Cytb 基因的同源性為76%,遺傳距離為0.405。湖南岳陽與云南洱源釘螺COⅠ基因的同源性為87%,遺傳距離為0.158;Cytb 基因的同源性為77%,遺傳距離為0.391。上述結(jié)果說明兩種基因序列比較及所構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)生樹結(jié)果一致,兩種基因分別構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)生樹中廣西靖西與湖南岳陽釘螺同屬一個(gè)支系,其親緣關(guān)系較近;而云南洱源釘螺單獨(dú)形成另一支系,與廣西靖西、湖南岳陽釘螺的親緣關(guān)系都較遠(yuǎn)。三地釘螺COⅠ基因序列與Genebank 已知釘螺COⅠ基因序列的比較結(jié)果和所構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)生樹顯示:廣西靖西釘螺與湖南岳陽、湖北漢陽釘螺間的同源性為93%~94%,遺傳距離為0.044~0.053;廣西靖西釘螺與云南洱源、云南大理、四川綿竹釘螺間的同源性為85%~86%,遺傳距離為0.148~0.151;湖南岳陽釘螺與云南洱源、云南大理間的同源性為84%~87%,遺傳距離為0.153~0.155;云南洱源、云南大理釘螺與四川綿竹釘螺間的同源
[Abstract]:Objective: to analyze the genetic differences of Oncomelania hupensis in Jingxi, Eryuan and Yueyang in Guangxi, and to reveal the genetic relationship between Oncomelania hupensis in Jingxi, Yunnan and Yueyang in Hunan, so as to provide scientific basis for exploring the origin of Oncomelania hupensis in Guangxi. Methods: the cytochrome C oxidase 鈪,
本文編號:1875392
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