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豬內(nèi)源性逆轉錄病毒分子特性的研究及抗病毒位點的選擇

發(fā)布時間:2018-04-28 01:24

  本文選題:異種移植 + 人獸共患疾病 ; 參考:《四川大學》2007年博士論文


【摘要】: 供器官嚴重不足是目前困擾移植界的重要難題之一。供器官短缺可從以下幾方面進行探索:(1)宣傳和發(fā)展自體移植,如自體骨髓/外周血細胞移植;(2)擴大同種異體供器官來源,如宣傳腦死亡立法,放寬對供者年齡的限制和倡導活體親屬供器官等;(3)人工器官/組織工程材料;(4)克隆技術/胚胎干細胞技術;(5)研究開發(fā)異種供器官源。 近年來,組織工程和胚胎干細胞的研究發(fā)展非常迅速并成為醫(yī)學界關注的焦點,但其臨床應用優(yōu)勢主要集中于創(chuàng)傷修復,而且相關研究仍處于早期階段,體內(nèi)外條件下能否誘導胚胎干細胞分化發(fā)育為實體器官尚無確切證據(jù)證實。因此,異種器官的開發(fā)和選擇仍是解決供器官短缺的重要途徑之一。以前曾一度認為靈長類動物因其親緣關系與人類最近,會成為最佳的異種器官供源,但由于靈長類動物屬瀕危物種,數(shù)目稀少,難以大量用于臨床移植,更重要的是靈長類動物體內(nèi)的病原體有使移植受者感染致病的危險,現(xiàn)已證實人免疫缺陷病毒(HIV)源自非洲綠猴,因此已將靈長類動物作為異種供器官源的可能性排除。 目前豬被公認為是最佳的異種供器官源。因豬的器官在形態(tài)學及解剖學上與人的器官相似,且在豬-人肝腎功能的匹配研究中也發(fā)現(xiàn)豬肝臟合成α、β球蛋白的能力與人相近,表明豬器官是具有人類器官相應生理功能的成熟器官。對豬-人異種組織的移植已經(jīng)進行了部分嘗試,如豬胰島細胞治療糖尿;豬皮治療燒傷病人;豬神經(jīng)干細胞治療帕金森癥,及豬骨治療骨折病人等。 在豬-人移植的臨床研究中,雖然豬與人器官功能基本匹配,但仍有兩個主要障礙尚需攻克。一是排斥,因豬-人移植屬于遠緣移植,除同種異體移植常見的排斥反應外,還有超急性排斥,但隨著轉人CD55轉基因豬的出現(xiàn)及新型免疫抑制劑的開發(fā)和使用,,排斥反應得到了較好的控制;二是人獸共患病,即豬體內(nèi)的病原體可通過移植傳染給受者,進而傳播到健康人群,造成災難性后果。豬體內(nèi)存在著多種病原體,如布魯桿菌、鉤端螺旋體菌、皰疹病毒、馬腦炎病毒、球孢子菌、錐蟲菌、血吸蟲,以及近兩年引起人們高度重視的使人致病的豬鏈球菌,這些病原體都可能在移植后感染受者并致病,隨著現(xiàn)代動物飼養(yǎng)技術的提高,已可飼養(yǎng)出無病原體或無特定病原體(SPF)的豬,同時也可在移植前通過篩查去除豬器官中的病原體。但豬內(nèi)源性逆轉錄病毒(porcine endogenous retroviruses,PERV)是整合在豬的基因組中,并能以孟德爾遺傳方式傳給后代的一種病毒,因此無法通過上述常規(guī)方式去除。 PERV為典型的哺乳動物C型逆轉錄病毒,具有gag,pol,env三個功能基因和3’,5’端長的末端重復序列結構(Long Terminal Repeat,LTR)。PERV以“前病毒”DNA的形式整合在其宿主——豬的細胞染色體中。PERV可分為γ(γ1~γ5)和β(β1~β4)兩類,定量PCR結果表明PERV的拷貝數(shù)從2個(β2和γ5)到約50個(γ1)。其中γ1、γ2和β4在成體豬的腎組織中處于活化狀態(tài)。野生型豬、舊世界豬(Suidae)和新世界豬(Tayassuidae)中僅發(fā)現(xiàn)一個逆轉錄亞群β2。γ1是已知具有感染力的亞群,其外殼蛋白基因(env)的SU區(qū)域的差異分為三種亞型,分別為PERV-A,PERV-B和PERV-C。PERV-A,-B可感染多種人源細胞及非人靈長類細胞,PERV-C僅感染特定豬來源的細胞。其他類型PERV還尚未證實有感染性。 PERV可在體外感染多種人源細胞系,如來源于T淋巴細胞、骨髓細胞、NK細胞及腎臟的細胞系。這種感染與細胞系的組織器官來源無關,而與這些細胞系的轉化方式及體外培養(yǎng)狀況相關。PERV在體外感染非人靈長類細胞的研究包括恒河猴肺部來源細胞(FRhL-2)、視網(wǎng)膜內(nèi)皮細胞(RF/6A)和腎臟來源細胞(BSC-1),原代細胞包括恒河猴來源的肺、腎、主動脈和臍靜脈細胞。PERV可發(fā)生亞型間的重組,且感染力增強,增加了異種移植后發(fā)生種間感染的可能性。PERV還可作為誘導移植排斥的抗原,在豬到小鼠的皮膚移植模型中引發(fā)排斥反應。 PERV的體內(nèi)感染性研究因缺乏理想的模型導致結果不盡相同,動物實驗和臨床研究結果并不一致,因此目前對PERV的體內(nèi)感染性尚無確切結論,另外關于PERV致病性的相關研究尚無報道。臨床回顧性研究中,發(fā)現(xiàn)無論是在豬到非人靈長類的移植模型中,還是在用豬胰島治療糖尿病、豬皮膚治療燒傷病人、豬肝臟或腎臟搭橋進行體外灌注的研究中,均未找到PERV感染的證據(jù)。在動物模型的研究中,將豬的胰島移植到免疫缺陷小鼠中,3個月后檢測發(fā)現(xiàn)小鼠體內(nèi)的多個組織均感染PERV。雖然在臨床檢測和動物模型研究中均未找到PERV體內(nèi)感染的證據(jù),但是這些研究仍存在一系列問題:一是所研究的個體中只有少數(shù)接受了免疫抑制;二是病人與豬細胞的體內(nèi)接觸時間有限,在PERV還未建立感染時即被清除;三是在研究中僅檢測病人的外周血單個核細胞,未檢測病人體內(nèi)其他類型的細胞是否感染了PERV。目前尚不清楚PBMC表面是否存在PERV的感染受體,進一步研究仍是必要的。 在本課題組以前的研究中,曾對來自中國三個地方的豬種共117頭個體進行了PERV的流行病學調(diào)查,分離外周血白細胞進行檢測,發(fā)現(xiàn)在這些中國豬種中無PERV缺失個體,在基因組中的拷貝數(shù)較高,而且檢測到PERV的高表達。亞型分析中發(fā)現(xiàn)中國豬種的PERV以A,B亞型為主,且多數(shù)為A/B混合亞型,未發(fā)現(xiàn)C亞型的個體。對34頭版納微型豬近交系(BMI)的逆轉錄酶活性進行檢測,發(fā)現(xiàn)RT活性在不同個體中有差異。目前國內(nèi)外尚無關于豬不同組織的PERV拷貝數(shù)和亞型是否存在差異的研究報道。本研究第一部分中,分離并提取BMI不同組織的DNA,用PCR及Real-Time PCR方法對同一豬個體中不同組織的PERV拷貝及亞型進行研究,以尋找低拷貝甚至缺失PERV的組織及器官;同時分離12頭BMI的外周血單個核細胞(PBMC),用PHA及IL-2刺激72小時后進行致死性輻射,再與人源細胞系HEK293細胞共培養(yǎng),以研究同一豬種不同個體對HEK293細胞的嗜性差異,并假設不同豬個體表達的PERV對同一種細胞會表現(xiàn)出不同的感染力及易感性。結果表明版納微型豬近交系中,17種組織及器官的基因組DNA中均有PERV-gag、pol的嵌合,所檢測的亞型均為A,B亞型,未檢測到-C亞型的個體,定量PCR結果發(fā)現(xiàn)pol基因的拷貝數(shù)在不同組織中的差異較大(甲狀腺:97.1;膀胱:1.4),而gag、envA、envB在不同組織中的差異相對較小。應用細胞共培養(yǎng)的方法對12頭BMI中的PERV的嗜性差異進行分析,發(fā)現(xiàn)來自BMI的PBMC經(jīng)PHA及IL-2共刺激培養(yǎng),并經(jīng)過致死性輻射后,與人源腎臟細胞系293共培養(yǎng),有6頭BMI中的PERV可感染293細胞,另外6頭的PERV未感染,證實同一豬種不同個體所表達的PERV會對同一種細胞表現(xiàn)出不同的嗜性及感染力。 國外對PERV各功能基因的研究中,采用生物信息學軟件LOHA_(TM)研究PERV-A 14/220時發(fā)現(xiàn)其是由PERV-C與PERV-A序列重組而來,該克隆gag,pol,envTM均來自PERV-C,而env的受體結合區(qū)域(RBD)來自PERV-A,該850bp區(qū)域包括受體區(qū)域,因此改變了其細胞嗜性。另外,還發(fā)現(xiàn)來自PERV-C的多個決定域可明顯增加PERV-A 14/220的感染滴度。在PERV-NIH,PERV-C,PERV-A和PERV-B的長末端重復序列(LTR)的研究中表明PERV-A,-B相似性較大,而PERV-NIH和PERV-C的U3區(qū)域的差別較大。本課題組以前的研究中,曾研究了PERV體外長期感染HEK293細胞,檢測發(fā)現(xiàn)人源HEK293細胞長期感染PERV后在細胞形態(tài)、細胞倍增時間、細胞凋亡率、DNA含量、DNA合成能力等方面未發(fā)生明顯變化,但其細胞血清依賴性增強,提示在PERV長期感染人源細胞后未發(fā)現(xiàn)PERV導致的細胞病變。目前的研究尚未對中國豬種內(nèi)PERV的各功能基因進行深入研究,本研究第二部分用PCR及基因克隆測序,并結合生物信息學方法,對來自中國三個豬種(版納微型豬近交系、五指山豬、內(nèi)江豬)中的PERV各功能基因(gag、pol和env)以及長末端重復序列(LTR)與其他已報道的PERV序列及部分具致病性的逆轉錄病毒(C型、D型逆轉錄病毒及慢病毒)進行了序列對比及同源進化分析,對中國豬種中PERV的可能致病性及感染力進行評估。gag和pol基因的研究結果,發(fā)現(xiàn)來自中國三個豬種的PERV與部分具有致病性的C型,D型逆轉錄病毒及慢病毒(HIV-1)有共同的同源結構域,并可找到兩個高度匹配的結構域;env基因的研究也同樣發(fā)現(xiàn)了與gag、pol一樣的同源區(qū)域,該區(qū)域位于env基因的受體結構域,表明PERV與其他C型逆轉錄病毒在受體結合方面有一定的共同性;對這三個功能基因所構建的同源進化樹研究中,發(fā)現(xiàn)中國豬種中的PERV與部分C型逆轉錄病毒有共同的同源進化關系;LTR研究發(fā)現(xiàn)BMI及WZSP中的LTR與PERV-A,-B有較高的同源性,但在序列的重復次數(shù)中存在差異,提示其感染力的差異,而NJP中的PERV-LTR與PERV-C的同源性較高。 抗病毒的常規(guī)途徑有兩種:疫苗及藥物。國外研究用11種已在FDA注冊的用于HIV治療的化學藥物,其中包括6種抗核苷酶藥物和5種蛋白酶抑制劑,在體外實驗中研究這些藥物對PERV的抗病毒作用,結果發(fā)現(xiàn)11種抗HIV藥物中,僅齊多夫定有潛在的臨床應用價值。另外的研究采用最新RNA干擾技術,對PERV在靶細胞中的表達進行抑制,表明該技術可用于以后的抗病毒治療。本研究第三部分在此基礎上,根據(jù)生物信息學所研究的同源區(qū)域,設計針對PERV功能基因gag、pol及LTR的小片段干擾RNA(siRNA),用脂質(zhì)體轉染的方法導入高表達PERV的PK15細胞中,檢測不同的siRNA對PERV表達抑制的效果,以尋找新的抗病毒位點。結果發(fā)現(xiàn)來自LTR的siRNA未起到抑制表達的作用,而來自gag、pol的G1,G2,P1,P2中,P2的表達抑制作用最強,G1只能起到微弱的抗感染作用,且抑制作用在轉染后48小時最強,并且具有劑量依賴性。 以上結果表明,在所檢測的BMI各組織器官的基因組中均存在PERV各功能基因,對其拷貝數(shù)的研究證實各組織器官也無實質(zhì)性差異,表明并無PERV缺失的組織或器官,提示在臨床應用中,尋找無PERV的組織器官優(yōu)先用于臨床治療是不現(xiàn)實的;生物信息學研究發(fā)現(xiàn)來自三個中國豬種的PERV的三個功能基因gag、pol、env與部分具有致病性的C型,D型逆轉錄病毒及慢病毒(HIV-1)存在一定的同源性,gag和pol的同源序列分別屬于種群特異抗原和編碼逆轉錄酶區(qū)域,表明PERV與C型逆轉錄病毒具有相似的種群抗原特異性,且PERV也可編碼與這些病毒相似的逆轉錄酶;env序列研究中,PERV與其他逆轉錄病毒的同源序列位于受體結合區(qū)域,提示PERV與這些病毒在感染宿主細胞方面有很大的相似性;這些結果均表明即使尚未找到PERV致病的證據(jù),但由于PERV的各功能基因與這些致病病毒的相似性,仍不能忽略PERV的潛在致病性,及PERV與其他病毒發(fā)生重組并發(fā)生變異的危險性。LTR研究發(fā)現(xiàn)同一豬種(BMI)的序列重復次數(shù)存在差異,說明同一豬種內(nèi)的PERV存在感染力的強弱及嗜性的差異,該結果有助于在以后的臨床研究應用中,選擇體內(nèi)PERV感染力較弱的個體用于臨床治療。RNA干擾實驗證實了siRNA可在靶細胞中有效抑制PERV的表達,表明RNA干擾可用于PERV的表達控制,RNA干擾不僅可克服抗病毒藥物所帶來的副作用問題,最大的優(yōu)點是可以靶向降低PERV的表達,而不會對宿主細胞內(nèi)其他基因的正常表達產(chǎn)生影響。 綜上所述,本實驗結果及本課題組以前的工作表明PERV雖可在體外感染多種人源細胞,但未發(fā)現(xiàn)PERV可引起其宿主細胞病變;國外的臨床回顧性研究發(fā)現(xiàn)在用豬組織、細胞進行臨床治療,或用豬肝臟、腎臟的搭橋治療中,均未找到PERV在體內(nèi)感染的證據(jù)。但PERV的潛在致病性仍不能忽視,因病毒經(jīng)常發(fā)生重組并改變原病毒的感染力及宿主范圍,以后的工作應致力于研究PERV的重組特性,并進一步提高現(xiàn)有PERV感染性、致病性檢測方法的敏感性及特異性,以達到控制并最終排除PERV所引起的跨種感染。
[Abstract]:......
【學位授予單位】:四川大學
【學位級別】:博士
【學位授予年份】:2007
【分類號】:R373;R617

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