本文選題：microRNA + HSV-I��； 參考：《中國協(xié)和醫(yī)科大學(xué)》2007年碩士論文

【摘要】： microRNA(miRNA)，即微小RNA，是一類長約22個核苷酸的小分子非編碼RNA，通常與靶基因mRNA的3’UTR發(fā)生不完全互補，在轉(zhuǎn)錄后水平調(diào)節(jié)基因的表達。自2000年首次報道以來，對microRNA的研究進展迅速，全世界有很多研究小組致力于研究microRNA在各個物種間的分布情況和它所發(fā)揮的重要作用。近幾年的研究表明，這是一種高度保守的、廣泛存在于植物、動物、病毒中的調(diào)節(jié)機制，，在生長發(fā)育、器官的形成、癌癥的發(fā)生和病毒感染等過程中扮演重要的角色。microRNA的發(fā)現(xiàn)是對經(jīng)典的遺傳學(xué)法則的重要補充。 HSV-I(herpes simplex virus 1)是一個有包膜的雙鏈DNA病毒，具有龐大的基因組，目前已知的編碼蛋白有84個，分為α、β、γ三類，基因表達的調(diào)控極為復(fù)雜，很多基因的功能以及調(diào)控過程仍不清楚。HSV-I在原發(fā)感染之后不能被宿主免疫系統(tǒng)徹底清除，會終生潛伏在宿主的神經(jīng)節(jié)細胞內(nèi)，一定狀態(tài)下被重新激活，對機體造成損傷。目前的研究結(jié)果仍不能很好地解釋這種特殊的感染-潛伏-再激活的感染過程。 本課題的目的是預(yù)測并驗證HSV-I基因組中新的micmRNA，進而研究它在HSV-I基因表達調(diào)控中的作用。利用生物信息學(xué)的方法，依據(jù)一定的條件，我們確定了HSV-I基因組中可能編碼microRNA的27個莖環(huán)結(jié)構(gòu)，其中有4個在microRNA序列比對和預(yù)測軟件miRBase∷Sequences中顯示出較高的得分且在Herpes病毒家族中較為保守。提取HSV-I感染的細胞small RNA后，經(jīng)Northern blot分析，結(jié)果顯示，α基因ICP0的內(nèi)含子區(qū)編碼一個新的microRNA—mihsv-2。在對其功能進行了初步的分析后，認為mihsv-2很可能影響人的基因Kelch like-24的表達。本實驗嘗試從新的角度研究HSV-I基因表達的調(diào)控機制，希望為今后的研究提供有用的線索。
[Abstract]:MicroRNAs miRNAs, or microRNAs, are a class of small non-coding RNAs with about 22 nucleotides in length, which are usually not fully complementary to the 3'UTR of the target gene mRNA, and regulate the expression of genes at the post-transcriptional level. Since it was first reported in 2000, the research on microRNA has made rapid progress. There are many research groups all over the world devoted to studying the distribution of microRNA among species and its important role. Studies in recent years have shown that this is a highly conservative, widespread regulatory mechanism in plants, animals and viruses, in growth and development, in organ formation, The discovery of microRNA plays an important role in the development of cancer and viral infection. HSV-I(herpes simplex virus 1 (HSV-I(herpes simplex virus 1) is a double-stranded DNA virus with a large genome. At present, there are 84 known encoded proteins, which are classified into three types: 偽, 尾, 緯, and the regulation of gene expression is very complex. The function and regulatory process of many genes are still unclear. HSV-I can not be completely eliminated by host immune system after primary infection. HSV-I will lurk in the host's ganglion cells for life and be reactivated in a certain state, causing damage to the body. Current research results still do not explain this particular infection-latent-reactivation infection process. The purpose of this study is to predict and verify new micmRNAs in the HSV-I genome and to study its role in the regulation of HSV-I gene expression. Using the bioinformatics method and according to certain conditions, we have identified 27 stem ring structures in the HSV-I genome that may encode microRNA. Four of them showed higher scores in microRNA sequence alignment and prediction software miRBase: Sequences and were more conservative in the Herpes virus family. After extracting small RNA from HSV-I infected cells, the results of Northern blot analysis showed that the intron region of 偽 gene ICP0 encodes a new microRNA-mihsv-2. After a preliminary analysis of its function, it was suggested that mihsv-2 might affect the expression of human gene Kelch like-24. This study attempts to study the regulatory mechanism of HSV-I gene expression from a new perspective, hoping to provide useful clues for future research.
【學(xué)位授予單位】：中國協(xié)和醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2007
【分類號】：R373

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本文編號：1789620