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人spindlin1基因的功能研究

發(fā)布時間:2018-01-26 07:55

  本文關(guān)鍵詞: spindlin1 亞細(xì)胞定位 成瘤性 信號傳導(dǎo) 出處:《中國人民解放軍軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院》2005年博士論文 論文類型:學(xué)位論文


【摘要】:卵巢癌是目前嚴(yán)重威脅婦女健康的惡性腫瘤,由于缺少早期臨床診斷癥狀,60-70%的卵巢癌處于晚期診斷,手術(shù)難以根治,而目前治療卵巢癌的藥物特異性和敏感性均較差,使得卵巢癌在婦科腫瘤中死亡率最高,5年生存率一直徘徊在40%左右。因此尋找在卵巢癌的發(fā)生中敏感和特異的基因改變將有可能為臨床卵巢癌的診治提供有意義的生物學(xué)指標(biāo),為抗癌藥物的研究提供新靶點,具有重要的理論和實際意義。 我們研究小組采用改良的mRNA差異顯示PCR技術(shù)對卵巢癌和正常卵巢組織之間的差異表達基因進行了一系列的篩選和鑒定,獲得并克隆了一個新基因,由于它與鼠類spindlin基因高度同源,因此命名為人spindlin1基因(GenBank登錄號為AF317228)。對其分析如下: 1 新基因cDNA長度為4375bp,基因在236-949bp含有完整開放讀框,預(yù)測編碼由237個氨基酸組成的蛋白質(zhì)。在新基因cDNA開放讀框的第一個ATG上游-126bp處有同框終止密碼子TGA,在3’末端4350bp處為典型的加尾信號AATAAA,此后18bp處為polyA尾。新基因cDNA全長序列與鼠的spindlin基因核酸序列具有96%同源性;蛟236-949bp含有完整開放讀框,編碼237個氨基酸,所編碼氨基酸與鼠spindlin基因所編碼的241個氨基酸具有98%的同源性。且新基因與鼠spindlin1基因一樣、均在3’端具有長的非編碼調(diào)控序列。即新基因cDNA在核酸序列、編碼氨基酸序列和基因結(jié)構(gòu)三方面與鼠的spindlin基因高度同源。Spindin1基因內(nèi)含子和外顯子剪切位點分析表明,所得基因序列與人第9號染色體RP11-317b17克隆序列中的5個部分順序一致,可以推斷基因來源于人第9號染色體。cDNA由5個外顯子組成,基因組DNA由五個外顯子和4個內(nèi)含子組成,基因組全長為52.3kb。進一步分析基因組中內(nèi)含子和外顯子的結(jié)構(gòu)特征,表明內(nèi)含子和外顯子之間的剪切完全符合GT-AT法則。 2 spindlin1基因編碼蛋白為一親水性膜內(nèi)蛋白,分子量約為27Kd,等電點為5.615。它含有三個重復(fù)的spin-ssty結(jié)構(gòu)域,屬于spin/ssty家族。生物信息學(xué)預(yù)測其具有MAPK磷酸化位點、酪氨酸蛋白激酶磷酸化位點、RNA結(jié)合蛋白作用位點、cAMP依賴性酪氨酸蛋白激酶磷酸化位點、PKC磷酸化位點等。 3 spindlin 1基因的染色體定位分析表明其定位在第9號染色體的長臂9q22.1-22.3
[Abstract]:Ovarian cancer is a serious threat to women's health at present. Due to the lack of early clinical diagnosis symptoms 60% to 70% of ovarian cancer is in the late diagnosis, surgery is difficult to cure. At present, the drug specificity and sensitivity of the treatment of ovarian cancer are poor, making ovarian cancer in gynecological tumors the highest mortality. The 5-year survival rate has been hovering around 40%. Therefore, searching for sensitive and specific gene changes in the pathogenesis of ovarian cancer may provide valuable biological indicators for the diagnosis and treatment of ovarian cancer. It is of great theoretical and practical significance to provide new targets for the study of anticancer drugs. Our team used modified mRNA differential display PCR to screen and identify differentially expressed genes between ovarian cancer and normal ovarian tissues. A novel gene was obtained and cloned because of its high homology with mouse spindlin gene. Therefore, the accession number of human spindlin1 gene GenBank was AF3172281.The analysis was as follows: 1 the cDNA length of the new gene was 4375bp.The gene contained a complete open reading frame in 236-949bp. The predicted protein is composed of 237 amino acids. There is a codon TGA in the first ATG upstream -126 BP of the open reading frame of the new gene cDNA. A typical caudal signal AATAAA was found at 4350bp at the 3'terminal. The whole cDNA sequence of the new gene has 96% homology with the nucleic acid sequence of mouse spindlin gene, and the gene contains complete opening in 236-949 BP. Read the box. It encodes 237 amino acids and has 98% homology with 241 amino acids encoded by mouse spindlin gene. The new gene is the same as mouse spindlin1 gene. Both of them have long non-coding regulatory sequences at the 3 'end, that is, the new gene cDNA is in nucleic acid sequence. The amino acid sequence and gene structure were highly homologous to mouse spindlin gene. The analysis of intron and exon shear site of Spindin1 gene showed that the amino acid sequence and gene structure were highly homologous to the mouse spindlin gene. The obtained gene sequence is consistent with the five partial sequences of human chromosome 9 RP11-317b17 clone sequence. It can be concluded that the gene originated from human chromosome 9. The gene consists of five exons. Genomic DNA consists of five exons and four introns, and the length of the genome is 52.3 kb. the structural characteristics of introns and exons in the genome are further analyzed. It is shown that the shear between intron and exon conforms to the GT-AT rule. 2 spindlin1 gene is a hydrophilic intramembrane protein, and its molecular weight is about 27kd. The isoelectric point is 5.615. It contains three repeated spin-ssty domains, belonging to the spin/ssty family. Bioinformatics predicts that it has MAPK phosphorylation sites. The phosphorylation site of tyrosine protein kinase and the phosphorylation site of RNA-binding protein are camp dependent tyrosine protein kinase phosphorylation site and PKC phosphorylation site. Chromosome mapping analysis of 3 spindlin 1 gene showed that it was located in the long arm 9q22.1-22.3 of chromosome 9.
【學(xué)位授予單位】:中國人民解放軍軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院
【學(xué)位級別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2005
【分類號】:R341

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本文編號:1465104

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