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  本文關(guān)鍵詞：龍巖市手足口病病原體柯薩奇B5病毒基因特征分析　出處：《中國病原生物學(xué)雜志》2014年11期 　論文類型：期刊論文

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【摘要】：目的了解龍巖市手足口病病原體柯薩奇B5病毒(Coxsackie virus B5,CVB5)VP1區(qū)基因特征及變異情況。方法對(duì)2011年采自確診手足口病患者的Real-time RT-PCR法檢測(cè)腸道病毒通用引物陽性而腸道病毒71型(enterovirus 71,EV 71)和柯薩奇病毒A 16型(Coxsackie virus A 16,CVA16)陰性未分型樣品,經(jīng)RD細(xì)胞分離腸道病毒。從培養(yǎng)上清中提取RNA核酸,經(jīng)RT-PCR法初步鑒定病毒型別。應(yīng)用187/222引物對(duì)擴(kuò)增病毒株的VP1區(qū),回收產(chǎn)物經(jīng)克隆、篩選后測(cè)序。采用ClustalX、Mega5.0進(jìn)行核苷酸及氨基酸序列同源性分析和進(jìn)化樹構(gòu)建。結(jié)果 104份未分型樣品中分離到3株CVB5。3株CVB5分離株VP1區(qū)長度為330~357個(gè)核苷酸,編碼110~119個(gè)氨基酸。3株間的核苷酸同源性為97%~99%,氨基酸同源性為84%~99%。比較推導(dǎo)的氨基酸序列,FJLY2011126h株VP1與另外2株龍巖分離株相比有18個(gè)位點(diǎn)差異,核苷酸序列287~288位發(fā)生插入突變,第290、291、338、339位發(fā)生顛換,與2010年長春株JN695051的同源性最高(核苷酸同源性95%~98%,氨基酸同源性84%~99%)。結(jié)論 2011年福建省龍巖市手足口病患者中存在CVB5感染,病毒與2005年法國株和國內(nèi)山東、長春、昆明、浙江病毒株屬同一型別。
[Abstract]:Objective to understand the Longyan City HFMD pathogen of Coxsackie virus B5 (Coxsackie virus B5, CVB5) gene characteristics and variation of VP1. Methods collected from HFMD patients diagnosed with Real-time RT-PCR method for detection of enterovirus universal primers was enterovirus 71 on 2011 (enterovirus 71, EV 71) and Coxsackie virus A type 16 (Coxsackie virus 16 A, CVA16) negative unclassified samples by RD cells isolated from intestinal viruses. From the culture supernatant of RNA nucleic acid extraction, identified by RT-PCR method. The application of 187/222 type virus primer pairs amplified virus strains VP1, recovery of product was cloned, sequenced. After screening by ClustalX, Mega5.0 nucleotide and amino acid sequence homology analysis and phylogenetic tree construction. Results 104 undefferentiated were isolated 3 strains of CVB5.3 CVB5 isolates VP1 length of 330~357 nucleotides, encoding 110~119 amino acids of.3 strains The nucleotide homology was 97%~99%, amino acid homology comparison of the deduced amino acid sequence of 84%~99%. FJLY2011126h strain VP1, and the other 2 Longyan isolates compared with 18 loci between a nucleotide sequence of 287~288 insertion mutation, 290291338339th occurred in 2010 and Changchun transversion, strain JN695051 had the highest homology (nucleotide homology of 95%~98%. The homology of amino acid 84%~99%). Conclusion the 2011 Longyan city of Fujian province HFMD patients are infected by CVB5 virus, and in 2005 the French line and domestic Shandong, Kunming, Zhejiang Changchun, strains belonging to the same type.

【作者單位】： 龍巖市疾病預(yù)防控制中心;福建醫(yī)科大學(xué)龍巖市疾病預(yù)防控制中心教學(xué)點(diǎn);
【基金】：福建省衛(wèi)生廳青年科研課題項(xiàng)目(No.2012-1-47)
【分類號(hào)】：R373
【正文快照】： ***2011年龍巖市共報(bào)告手足口病(hand-foot-mouthdisease,HFMD)病例6 701例,其中重癥病例13例,死亡病例1例。對(duì)采集的302份HFMD病例咽拭標(biāo)本進(jìn)行病毒核酸檢測(cè)(Real-time RT-PCR法),腸道病毒通用引物核酸陽性207份(68.54%),其中EV 71核酸陽性46份(15.23%),CVA16核酸陽性57份(18

【參考文獻(xiàn)】

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【共引文獻(xiàn)】

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【二級(jí)參考文獻(xiàn)】

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本文編號(hào)：1426363